Suosittelemme maskin käyttöä laboratoriossa asioidessasi, mikäli sinulla on hengitystieinfektion oireita. Saavuthan laboratorioon vasta juuri ennen sinulle varattua aikaa.
Varaa aika puhelimitse
Kanta-Häme, Keski-Suomi, Pirkanmaa ja Päijät-Häme (Arkisin ma-pe klo 7-18)
Koronan työllistävä vaikutus on ollut jo pidempään laskusuuntainen, minkä myötä Fimlabin mikrobiologian erikoisalalla on voitu jälleen keskittyä paremmin eri projekteihin. Valmiutta pidetään kuitenkin yhä yllä, ja tarpeen vaatiessa testauskapasiteettia voidaan kasvattaa nopeallakin aikataululla.
Koronan myötä moni mikrobiologian erikoisalalla käynnissä ollut projekti jouduttiin laittamaan jäihin, sillä työntekijöiden resurssit ohjattiin voimakkaasti koronatestaukseen. Vaikka tartuntamäärät ovat edelleen melko korkeita, virus on asettumassa yhdeksi hengitystieinfektion aiheuttajaksi monien muiden joukossa. Laboratoriossa tehtävien testien määrä on vähentynyt merkittävästi, ja mikrobiologian erikoisalan työntekijöiden arjessa ollaan palaamassa kohti niin kutsuttua normaalia.
Koronapandemia nosti esiin aukkoja varautumisessa kaikilla terveydenhuollon sektoreilla. Pandemiasta on kuitenkin otettu opiksi, ja valmiutta tullaan jatkossa pitämään yllä aiempaa paremmin.
– Pohdimme nyt aiempaa tarkemmin, millaista valmiutta tulee pitää yllä mahdollisten uusien pandemioiden varalta. Aiemmat varautumissuunnitelmat ovat pohjautuneet influenssaepidemioihin, mutta koronan myötä olemme saneet aivan uudenlaista perspektiiviä esimerkiksi laboratorioiden varautumiseen. Nämä opit ohjaavat nyt kaikkea varautumiseen liittyvää ajattelua ja suunnittelua, Fimlabin Mikrobiologian erikoisalajohtaja Tapio Seiskari kertoo.
Korona työllistää edelleen mikrobiologian erikoisalan henkilöstöä jonkin verran, mutta ei samalla tavalla kuin pandemian pahimmassa vaiheessa. Testausstrategiaa on muutettu pandemian edetessä niin, että kaikkia oireisia ei enää testata, ja samalla kotitestien osuus on kasvanut merkittävästi. Laboratoriossa tehtävät testit kohdentuvat sairaalahoitoisiin potilaisiin ja riskiryhmiin. Valmiutta kasvattaa testauskapasiteettia pidetään kuitenkin edelleen yllä.
Uusi tietojärjestelmä ja muita kehityskohteita
Koronan työllistävän määrän laskiessa Fimlabin mikrobiologian erikoisalalla on pystytty jälleen keskittymään paremmin muihin erikoisalaa koskeviin tärkeisiin asioihin. Esimerkiksi erilaisia projekteja on jälleen herätelty henkiin, ja suunnitteilla on monenlaisia menetelmäuudistuksia.
– Yksi merkittävä asia on bakteeriviljelyssä käytettävän laboratoriotietojärjestelmän uudistaminen. Se tulee työllistämään meitä loppuvuodesta. Uudistuksesta voi seurata hetkellisiä pullonkauloja, mutta se tulee myös avaamaan uusia ovia esimerkiksi laiteliitännöillä, jotka ovat odottaneet uuden järjestelmän käyttöönottoa jo hyvän tovin, Seiskari sanoo.
Toinen kehitettävä kokonaisuus on ulostediagnostiikka, minkä lisäksi listalla on paljon erilaisia yksittäisiä, pienempiä kehityskohteita. Lisäksi henkilökuntaa voidaan perehdyttää nyt muuhunkin kuin koronaan liittyviin tehtäviin.
– Koronan vuoksi muuhun diagnostiikkaan perehtyminen jäi vähemmälle, ja perehdytysvelkaa pyritään nyt paikkaamaan, Seiskari vakuuttaa.
Fimlabin Tampereen koronanäytteenotto muuttaa Nekalasta Hatanpään sairaala-alueelle. Hatanpään koronanäytteenottopiste palvelee asiakkaita perjantaista 11.11.2022 alkaen osoitteessa Hatanpäänkatu 22 (O-rakennus). Nekalan koronanäytteenottopiste sulkeutuu torstaina 10.11.2022 klo 16.
Huomaathan, että koronanäytteenottoon tulo vaatii aina lähetteen ja ajanvarauksen. Saavu näytteenottoon oikeana päivänä ja kellonaikana. Ajanvarauksen tiedot ovat varausvahvistuksessa. Muistathan perua sinulle varatun näytteenottoajan, mikäli olet estynyt tulemaan. Ohjeet näytteenottoajan perumiseen löydät tekstiviestinä tulleesta varausvahvistuksesta.
Hatanpään koronanäytteenottopiste (Hatanpäänkatu 22, O-rakennus) palvelee asiakkaita 11.11.2022 alkaen ma–pe klo 9–17 ja la–su klo 9–16.
Fimlab on kilpailuttanut koronanäytteenoton Tampereella. Maanantaista 2.5.2022 alkaen Nekalan koronanäytteenottopisteessä näytteenottoa tekee UpWeGo.
Ajanvarauskäytäntö koronanäytteenottoon ei muutu. Nekalan näytteenottopisteessä otetut näytteet analysoidaan edelleen Fimlabissa, ja vastaus tulee tekstiviestillä tuloksen valmistuttua.
Nekalan koronanäytteenottopiste palvelee asiakkaita 2.5.2022 alkaen ma-pe 8-20 ja la-su 10-18 osoitteessa Viinikankatu 44 G. Koronanäytteenottoon tulo vaatii aina lähetteen ja ajanvarauksen.
Fimlabissa tutkitaan tällä hetkellä valtavia määriä koronanäytteitä ja positiivisten löydösten osuus on ennennäkemättömän suuri. Kiireen ohella on pystytty tekemään myös tutkimustyötä, jolla varmistetaan diagnostiikan toimivuus. Tutkimuksen tueksi Fimlab sai Tampereen tuberkuloosisäätiöltä merkittävän apurahan.
Ylilääkäri Tapio Seiskarin mukaan kotimaisella tutkimuksella on pandemian hoidossa tärkeä rooli, sillä sen ansiosta voidaan varmistaa diagnoosien ja hoitoprosessien oikeellisuus.
– Kun tutkimme omaa tekemistämme ja uusia menetelmiä, voimme varmistaa, että teemme asioita oikein ja järkevästi, ja että kehitysaskeleet ovat oikean suuntaisia. Hyvä esimerkki tästä on antigeenitestien suorituskyky, joka tunnetaan Fimlabissa erittäin tarkasti meillä tehtyjen tutkimusten perusteella, Seiskari kuvailee.
Antigeenitestien tiedetään toimivan hyvin, kun hengitystieoireiden alusta on kulunut yhdestä seitsemään vuorokautta. Fimlabissa tehty tutkimus osoittaa kuitenkin selvästi, että aivan oireisen taudin alkuvaiheessa, ja oireettomilla potilailla, antigeenitestin herkkyys on merkittävästi PCR-tutkimusta huonompi.
– Tämä on merkittävä havainto, kun arvioidaan esimerkiksi kansallisia linjauksia kotitestien käytöstä oireettomien seulonnassa, toteaa mikrobiologian osastonylilääkäri Janne Aittoniemi.
Tampereen tuberkuloosisäätiö myönsi Fimlab Laboratoriot Oy:lle puolen miljoonan suuruisen apurahan koronatutkimusta varten. Apurahan voimin on jo tehty tutkimusta ja julkaisuja. Antigeenitestien suorituskyvyn lisäksi on tutkittu vasta-ainetestien toimivuutta ja muun muassa erilaisten näytteenottokohtien soveltuvuutta PCR-diagnostiikkaan. Havainto nenästä otetun PCR-näytteen toimivuudesta on huomioitu suoraan Fimlabin näytteenotto-ohjeistuksessa. Tutkimuksen hyöty on siis ollut hyvin konkreettinen.
Valtavat näytemäärät haastavat ensin näytteenottoa ja pienellä viiveellä analytiikkaa
Vaikka tutkimustyö onkin tärkeää, kasvavat koronatartuntamäärät suuntaavat resurssit valtavista näytemääristä selviämiseen. Loppuvuodesta 2021 tartuntamäärät ja sen myötä myös koronatestaus lisääntyivät merkittävästi kuormittaen Fimlabin henkilöstöä.
Koronan lisäksi hengitystieoireilua ja testauksen tarvetta ovat lisänneet monet muut hengitystievirukset. Etenkin RS-virusta on ollut paljon liikkeellä. Lisäksi omikronvariantin rantautuminen Suomeen on lisännyt sekvensointien tarvetta. Vuodenvaihteen tienoilla positiivisten koronalöydösten määrät lähtivät jyrkkään nousuun, varmasti osin omikronin myötä. Erityisesti positiivisten löydösten runsas määrä on edellyttänyt muutoksia näytekäsittelyssä ja pakottanut luopumaan monista aiemmin käytössä olleista toimintatavoista esimerkiksi näytteiden säilytyksen suhteen. Fokus onkin nyt vahvasti siinä, että kaikki näytteet saadaan tutkittua.
Covid-näytteiden kohdalla ei voida puhua myöskään pelkästään analytiikasta, vaan on huomioitava koko ketju näytteenotosta tuloksiin asti. Se sitouttaa paljon henkilöstöä. Haasteet kohdataan tyypillisesti ensin näytteenotossa, ja näytteiden hyökyaalto tulee pienellä viiveellä analytiikkaan.
– Käytännössä pyrimme lisäämään henkilöstömäärää analytiikkaan sitä mukaan, kun näytemäärät kasvavat. Se ei kuitenkaan aina ole ihan yksinkertaista ja sen myötä myös muun diagnostiikan tekotiheyttä joudutaan mahdollisesti vähentämään, sanoo Seiskari.
Toistaiseksi vain pieni osa suomalaisista on sairastanut taudin. Nyt kiihtynyt vauhti ennustaa, että pikkuhiljaa yhä useampi kohtaa viruksen.
– Toivottavasti mahdollisimman monella ensikontakti virukseen tapahtuu rokotuksen kautta, Seiskari päättää.
Fimlab avaa Tampereelle uuden koronanäytteenottopisteen maanantaina 30.8.2021. Näytteenotto sijaitsee Nekalassa osoitteessa Viinikankatu 44 G ja se on avoinna päivittäin klo 8–20. Koronanäytteenotto Hatanpään ja TAYSin näytteenottopisteissä päättyy sunnuntaina 29.8.2021.
Nekalan koronanäytteenottopisteessä on kolme ilmoittautumishuonetta ja seitsemän näytteenottohuonetta. Joustavan palvelukonseptin avulla näytteenottopisteessä on mahdollista palvella 500–600 asiakasta päivässä. Huomaathan, että koronanäytteenottoon tulo vaatii aina lähetteen ja ajanvarauksen. Saavuthan näytteenottoon vasta omalla ajanvarausajallasi.
Drive-in-koronanäytteenottopiste muuttaa syyskuussa Hakametsään
Toinen muutos Fimlabin Tampereen koronanäytteenottopisteisiin on luvassa syyskuussa, kun Tampereen Messu- ja Urheilukeskuksella toimiva suurtehon drive-in-koronanäytteenottopiste muuttaa Hakametsään. Hakametsän jäähallin parkkipaikalle pystytettävä drive-in-koronanäytteenottopiste palvelee asiakkaita lauantaista 11.9.2021 alkaen. Messukeskuksen näytteenottopiste suljetaan perjantaina 10.9.2021 klo 16.
Huomaathan, että koronanäytteenottoon tulo vaatii aina lähetteen ja ajanvarauksen. Saavuthan näytteenottoon vasta sinulle varatulla ajalla.
Fimlabin Tampereen keskuslaboratoriossa on käynnistetty koronavirusmuunnosten tunnistaminen sekvensoinnilla. Sekvensointia käytetään virusvarianttien seurantaan nopeasti kehittyvässä pandemiassa. Mutaatioita seuraamalla voidaan tarkimmillaan selvittää yksittäisten tartuntaketjujen kulkua.
Sekvensointi
on pystytetty tiiviissä yhteistyössä mikrobiologian ja genetiikan erikoisalojen
sekä Tampereen yliopiston kanssa. Genetiikan laboratoriolla vakiintuneessa käytössä
olleet menetelmät ja kokemus sekvensoinnista osana muun muassa syöpädiagnostiikkaa
ovat edesauttaneet menetelmän käyttöönottoa myös virusvarianttien
tunnistamiseen.
Sekvensoinnin tavoite on epidemiologinen seuranta
Koronaviruksen
osoitus potilasnäytteistä perustuu PCR-testaukseen, jossa tutkitaan yhtä tai
muutamaa ennalta määritettyä sekvenssipätkää kerrallaan. Tämän vuoksi menetelmä
sopii hyvin viruksen osoittamiseen suurista näytemääristä.
Sekvensoinnin merkitys osana koronadiagnostiikkaa heräsi tarpeesta seurata maailmalla leviämään lähteneiden virusvarianttien kulkua. Nyt on selvää, että variantit leviävät vauhdilla, ja brittivariantista on tulossa uusi valtavirus myös Suomessa.
– Elämme murrosvaihetta sen suhteen, millainen testausstrategia virusvarianttien sekvensointiin tullaan linjaamaan. Resurssien turvaamisen näkökulmasta on tärkeää, ettei lähdetä ylimitoitettuun sekvensointiin. Tarvitsemme systemaattista sekvensointia tietääksemme, minkälaisia viruskantoja Suomessa on liikkeellä. Näin voimme varmistaa myös PCR-diagnostiikan toimivuuden, toteaa mikrobiologian erikoisalajohtaja, ylilääkäri Tapio Seiskari.
–
Vallitsevassa tilanteessa on tarkoituksenmukaista pysytellä nimenomaan epidemiologisen
tilannekuvan rakentamisen tasolla, koska tällä on merkitystä arvioitaessa
esimerkiksi rokotteiden tehoa kiertäviin viruskantoihin, lisää mikrobiologian
erikoislääkäri Minna Paloniemi.
Sekvensointimenetelmiin
kohdistuvat vaatimukset kasvavat, kun genomia määritetään tarkemmin, eikä vain
seurata tiettyjen, yksittäisten varianttien leviämistä.
– Yhden
sekvenssinäyte-erän kattava analysointi koko virusgenomin osalta on vaativaa ja
kestää kaikkine vaiheineen useamman päivän. Siksi sekvensointi ei varsinaisesti
palvele taudin diagnostiikkaa, vaan enemmänkin juuri epidemian seurantaa, sanoo
genetiikan erikoisalajohtaja Mauri
Keinänen.
Fimlabin Tampereen keskuslaboratorioon pystytetään parhaillaan
uutta sekvensointijärjestelmää, jolla voidaan skannata virusten perimää. Tähän
asti positiiviset koronanäytteet on tarvittaessa lähetetty Helsinkiin THL:n tekemää
muunnosten sekvenssianalyysia varten.
Mikrobiologian molekyylilaboratorion menetelmistä vastaava sairaalamikrobiologi
Bruno Luukinen on ollut pandemian
alusta asti käynnistämässä koronadiagnostiikkaa Fimlabilla.
– Sain erikoistumisopinnot valmiiksi juuri sopivasti helmikuussa
2020, kun virus alkoi toden teolla levitä maaliskuussa. Hyppäsin liikkuvaan
junaan, kun aloitimme koronadiagnostiikan pystyttämisen. Muutosten vauhti ei
ole sen koommin laantunut, ja nyt olemme taas uuden, mielenkiintoisen vaiheen
edessä, Luukinen kuvailee.
Molekyylilaboratorion lääketieteellisestä puolesta vastaa kliinisen
mikrobiologian erikoislääkäri Minna Paloniemi,
joka liittyi mukaan tiimiin syksyllä palattuaan post-doc-tutkimustyöstä
Cambridgesta, Englannista.
Sekvensointi avaa perimän
Vuoden aikana tutkimusmäärät Fimlabin laboratoriossa ovat
nousseet räjähdysmäisesti.
– Pandemian alkumetreillä pohdimme tosissamme, voisimmeko
nostaa päivittäisiä näytteenottomääriä lähemmäs 40:tä. Tällä hetkellä teemme
parhaimmillaan noin 4 000 PCR-testiä päivässä, mikä vastaa yhden keskimääräisen
influenssakauden koko näytemäärää, Luukinen havainnollistaa.
PCR-testissä tutkitaan vain yhtä tai muutamaa ennalta
määritettyä sekvenssipätkää kerrallaan, minkä vuoksi menetelmä sopii hyvin
viruksen tunnistamiseen, mutta huonosti mutaatioiden seurantaan alati
kehittyvässä pandemiassa. Sekvensointimenetelmien avulla taas voidaan analysoida
viruksen koko perimää jopa yksittäisen nukleotidin tasolla. Mutaatioita
seuraamalla voidaan tarkimmillaan selvittää yksittäisten tartuntaketjujen
kulkua.
Sekvensoinnin käyttöönotto aloitetaan Tampereella helmikuun
aikana koronavarianttien määrittämisellä. Osaamisen kartuttua on tarkoitus
jatkaa nopeasti uuden sukupolven kokogenomisekvensointimenetelmiin.
– Pandemiatilanteessa on toki tarkoituksenmukaisempaa
pysytellä epidemiologisen tilannekuvan rakentamisen tasolla, sillä yhden
sekvenssinäyte-erän analysointi on hidasta ja vie kaikkine vaiheineen useamman
päivän, toteaa Paloniemi.
Yhteistyöllä virusta vastaan
Sekvenssitestauksessa kertyy valtavat määrät tietoa. Testauksen
myötä rakennetaan sekä kansallista että kansainvälistä tietokantaa, joiden
avulla pystytään luokittelemaan ja ryhmittelemään löydökset. Uusien
mutaatioiden kautta syntyvien koronavarianttien liikkeitä voidaan siten
paremmin seurata ja tarvittaessa kohdentaa epidemian hallintaan liittyviä
toimia ajoissa. Siitä, miten ja missä määrin laajaa datapohjaa aiotaan jatkossa
hyödyntää, päättää THL, joka vastaa kansallisen testausstrategian luomisesta.
Pandemian myötä yhteistyö erikoisalojen laboratorioiden välillä on tiivistynyt. Esimerkiksi osa genetiikan käytössä olleista sekvensointilaitteista alkaa palvella jatkossa myös koronadiagnostiikkaa. Myös genetiikan osaaminen ja kokemus sekvensoinnista on äärimmäisen tärkeä osa yhteistyötä. Paloniemen mukaan kaikki mahdollinen osaaminen on syytä hyödyntää kilpajuoksussa virusta vastaan.
– Sekvensointiprojektissa teemme yhteistyötä genetiikan
laboratoriomme lisäksi myös THL:n ja Tampereen yliopiston kanssa. Yhdistämällä
voimamme pystymme vastaamaan mahdollisimman nopeasti uusiin
koronadiagnostiikkaan liittyviin haasteisiin ja siten omalta osaltamme vaikuttamaan
epidemian hyvään hallintaan.
Koronatilanne on jälleen valtakunnallisesti kiihtynyt. Kasvavat pyyntömäärät heijastuvat myös vasteaikoihin koronanäytteenotosta tulokseen. Tällä hetkellä Fimlabissa tutkitaan keskimäärin lähes 3000 näytettä päivässä. Määrät ovat kasvussa ja päivittäinen vaihtelu on suurta: arkipäivisin pyyntöjä saatetaan tehdä nelinkertaisesti viikonloppuun nähden.
Fimlabin
toiminta-alueista Keski-Suomi, Kanta-Häme ja osa Päijät-Hämeestä ovat
koronatilanteen leviämisvaiheessa ja Pirkanmaa sekä Pohjanmaa
kiihtymisvaiheessa. Seuraamme tilanteen kehittymistä tarkasti ja olemme varautuneet
näytemäärien kasvuun.
– Tehostamme jatkuvasti toimintaamme niin, että pystymme käsittelemään suurempia näytemääriä. Parhaillaan olemme automatisoimassa pitkälti käsityönä tehtävää näytteiden esikäsittelyä. Hyödyntämällä automaatiota entistä laajemmin analyysia voidaan nopeuttaa, mikrobiologian erikoisalajohtaja, ylilääkäri Tapio Seiskari sanoo.
Tuotantovarmuuden
takaamiseksi Fimlab hyödyntää tarvittaessa myös tutkimusten alihankintaa
yhteistyölaboratorioista.
Viruksen
osoitustutkimusten rinnalla Fimlab kehittää parhaillaan yhdessä Tampereen
yliopiston kanssa menetelmiä vauhdilla leviävien varianttivirusten tunnistamiseksi.
Pyrkimyksenä on päästä aloittamaan sekvensointitutkimukset Fimlabissa jo helmikuussa.
Fimlabin
suuren tehon drive in -koronanäytteenotto Tampereen Messu- ja
Urheilukeskuksessa muuttaa A-hallista E-halliin keskiviikkona 23. joulukuuta.
Muuton myötä A-halli palautuu alkuperäiseen tarkoitukseensa liikuntahalliksi
urheilijoiden käyttöön. Näytteenoton kapasiteettiin muutolla ei ole vaikutusta.
Aiemmin Tampereen
kaupungin kanssa neuvotellusta jatkoajasta huolimatta Fimlabin
koronanäytteenoton muuttoaikataulua Tampereen Messu- ja Urheilukeskuksessa on
päätetty aikaistaa.
– Ymmärrämme hyvin liikuntatoimen
tarpeen tilankäytölle ja olemme myös arvioineet näytteenoton kuormitusta joulun
ja uudenvuoden aikaan. Tulimme siihen tulokseen, että ennen joulua on paras
ajankohta muutolle, kertoo Fimlabin Pirkanmaan aluejohtaja, ylilääkäri Anna-Maija Haapala.
Muutto ei aiheuta katkosta näytteenottotoimintaan
Näytteenottotoiminta
Tampereen Messu- ja Urheilukeskuksen A-hallissa päättyy tiistaina 22.12. kello
19. Toiminta E-hallissa alkaa heti seuraavana aamuna kello 7.30.
– Sisäänajo E-halliin tapahtuu hallin pohjoispuolelta. Käytännössä se tarkoittaa, että näytteenottoon tultaessa on ajettava lenkki hallin toiselle puolelle. Vastaavasti ulosajo tapahtuu hallin eteläpuolelta. Uusi reitti vaatii autoilijoilta huolellisuutta liikenneturvallisuuden takaamiseksi, Haapala toteaa.
Uudet saapumisohjeet päivittyvät Fimlabin verkkosivuille ennen muuttoa. Näytteenoton kapasiteetti säilyy ennallaan. Enimmillään suuren tehon drive in -näytteenotossa on otettu lähes 1300 näytettä päivässä.
Koronanäytteenotto palvelee myös joulunpyhinä
Fimlabin koronanäytteenotto Tampereen Messu- ja Urheilukeskuksen E-hallissa sekä Hatanpäällä ja Taysissa palvelevat myös joulunpyhien ajan. Toimipisteet ovat pyhinä auki seuraavasti: 24.12. klo 8–16, 25.–27.12. klo 10–18 ja 1.–3.1.2021 klo 10–18. Uudenvuoden aattona 31.12. messukeskus palvelee klo 7.30–19.30 ja Tays klo 7.15–19.30.
Arkena ja viikonloppuisin toimipisteet palvelevat pääsääntöisesti seuraavasti: Messukeskus ma–su klo 7.30–19.30, Hatanpää ma–pe klo 8–19.30, la–su klo 9–17 ja Tays ma–su klo 7.15–19.30. Huomaathan, että koronanäytteenottoon tulo vaatii aina lähetteen ja ajanvarauksen.
Viime viikkoina Fimlabin koronatestausta haastanut laiterikko osassa tutkimuslinjastoa on saatu korjattua. Tutkimuskapasiteetin palautuminen ennalleen vähentää tarvetta alihankinnalle ja lyhentää tutkimustulosten vasteaikoja.
– Pari
viime viikkoa ovat olleet ennätyksellisen tiiviitä. Valtakunnallisesti
kiihtynyt koronatilanne yhdistettynä laiterikkoon aiheutti jonkin verran
vasteaikojen venymistä. Tilanteen pitäisi nyt huomattavasti helpottaa, kertoo
mikrobiologian erikoisalajohtaja, ylilääkäri Tapio Seiskari.
Tutkimuslinjastoa
jo kesällä täydentämään tilatun laitteen asennus on myös parhaillaan käynnissä.
Laitelisäyksen myötä tuotantovarmuus kasvaa entisestään.
– Kuluva
viikko on tutkimuspyyntöjen valossa hieman kahta edeltävää viikkoa
rauhallisempi. Tulevista päivistä ja viikoista ei toki voi vielä tietää,
Seiskari toteaa.
Tuotantovarmuuden takaamiseksi Fimlab hyödyntää jatkossakin tarvittaessa tutkimusten alihankintaa yhteistyölaboratorioista. Olemassa olevien alihankintakanavien ohelle rakennetaan parhaillaan logistisia ja tietoyhteyksiä myös HUSin tutkimuskapasiteetin hyödyntämiseksi.
Laboratoriopalveluille laajaa kysyntää
Tavanomainen
laboratoriopalveluiden kysyntä jatkuu kiivaana koronanäytteenoton ja
-tutkimusten ohella.
– Edelliset
pari viikkoa ovat olleet hyvin haastavia. Koronaepidemia on heijastunut myös
peruspalvelutuotantoomme, koska sairastumiset ja karanteenitoimet ovat
koskettaneet myös laboratoriohenkilöstöä. Koronatutkimusten vastausviiveet ovat
aiheuttaneet paljon kysymyksiä ja palautetta asiakkailtamme, kertoo
palvelujohtaja Anu Mustila.
Fimlabin
toiminta-alueista Päijät-Häme ja Kanta-Häme ovat koronatilanteen osalta leviämisvaiheessa
ja Pirkanmaa, Keski-Suomi ja Pohjanmaa kiihtymisvaiheessa. Tutkimuspyyntöjen
määrä on hieman tasoittunut kuluneen viikon aikana. Koronanäytteenottoon pääsee
nopeasti ja tulosten vasteaikoja saadaan nyt nopeutettua. Fimlabissa tutkitaan
nyt keskimäärin yli 3000 koronanäytettä päivässä. Kiivaimpina päivinä
tutkimusmäärät ovat olleet 4000 näytteen luokkaa.
Suomessa todetaan tällä hetkellä 400–500 positiivista koronatulosta päivittäin. Positiivisten tulosten osuus on kasvanut myös ikääntyneen väestön keskuudessa. Tämä voi ennakoida terveydenhuollon tehohoitokapasiteetin kuormittumista tulevina viikkoina.
Koronatilanne on kiihtynyt ympäri Suomea viime viikkojen aikana. Tämä näkyy myös näytteenottomäärissä. Fimlabin alueella tutkitaan tällä hetkellä noin 3200 covid-19-näytettä päivässä. Tutkimusmäärien ohella myös positiivisten tulosten osuus on kasvanut selvästi viimeisten kahden viikon aikana.
– Näytteitä tulee tällä hetkellä rajusti. Näytteiden suuren
määrän ohella painetta aiheuttaa yhden keskeisen laitteen rikkoutuminen
päätutkimuslinjastossamme. Varaosista ja tutkimustarvikkeista käydään globaalia
kilpailua ja niiden saatavuudessa on viiveitä, kertoo mikrobiologian
erikoisalajohtaja, ylilääkäri Tapio
Seiskari.
Haasteista huolimatta vasteajat ovat pysyneet kohtuullisina
eikä näytteitä ole päässyt kasaantumaan. Rinnakkaisia laitteita on useita, ja laiterikon
aiheuttamaa tutkimuskapasiteetin tilapäistä pienentymistä on paikattu
lisäämällä alihankintayhteistyötä.
– Paitsi omaa tuotantoa myös alihankintakanavia kehitetään
koko ajan. Yhteistyö muiden toimijoiden kanssa on ensiarvoisen tärkeää riskien
hallinnan kannalta, Seiskari toteaa.
Tutkimuskapasiteetti saamassa vahvistusta
Laiterikon korjaamiseksi tarvittava varaosa saataneen ensi
viikon aikana. Tämän lisäksi tutkimuskapasiteettiin on Seiskarin mukaan tulossa
lisävahvistusta, kun jo keväällä tilattu laitevahvistus saadaan käyttöön lähiviikkoina.
– Tutkimusjärjestelmäämme täydentävän laitteen asennus alkaa näillä näkymin ensi viikon aikana. Laite kootaan paikan päällä ja asennustyö vie useammalta henkilöltä pari viikkoa, eli puhutaan varsin suuresta laitteesta. Uuden laitteen myötä myös tarviketoimituksiin on odotettavissa helpotusta.
Ennätysmäärä näytteitä päivässä
Joulukuun ensimmäisenä päivänä pelkästään Tampereen Messu-
ja Urheilukeskuksen drive-in-näytteenottopisteessä otettiin yli 1000 näytettä.
– Messu- ja Urheilukeskuksen suurtehon
drive-in-näytteenottopisteessä koronanäytteitä otetaan aamusta iltaan kahdeksalla
ajolinjalla. Ruuhkasta huolimatta ajan koronanäytteenottoon saa viimeistään
seuraavalle päivälle, kertoo Pirkanmaan aluejohtaja, ylilääkäri Anna-Maija Haapala.
Fimlab vastaa koronatutkimuksista viiden sairaanhoitopiirin
alueella Suomessa: Pirkanmaalla, Kanta-Hämeessä, Keski-Suomessa,
Päijät-Hämeessä ja Pohjanmaalla. Kaikki toimialueet ovat tällä hetkellä
koronaepidemian kiihtymis- tai leviämisvaiheessa. Ruuhkaisuudesta huolimatta
vasteajat ovat pysyneet kohtuullisina ja tilanne vakaana.
Käytäthän kasvomaskia tullessasi näytteenottoon ja asioidessasi laboratorioissamme.
Fimlabin
toiminta-alueella koettiin lokakuussa koronatilanteen nopea kiihtymisvaihe. Tilastot
osoittavat, että testiin hakeutumisessa ja positiivisten tulosten
ilmaantuvuudessa on sukupuolisidonnaisia eroja. Asiantuntijat muistuttavat,
että myös lieväoireisten on syytä hakeutua testattaviksi ja välttää sosiaalisia
kontakteja.
Fimlabin toiminta-alueella todettiin syyskuun
lopussa vain noin 10–12 positiivista covid-19-tutkimustulosta päivässä. Lokakuun
alussa viiden päivän aikana positiivisten tulosten määrä moninkertaistui lähes
90:een päivässä. Yli 60 positiivisen tutkimustuloksen päivävauhti jatkui kaksi
viikkoa. Neljässä viikossa tilanne saatiin hallintaan ja saavutettiin syyskuun
lopun ilmaantuvuustilanne.
Voidaan siis sanoa, että infektion leviäminen
tapahtui muutamassa päivässä, sammuttaminen kesti ainakin kaksi viikkoa ja
jälkisammutustoimet vaativat jopa neljä viikkoa.
– Parin viikon ajan olimme samalla ilmaantuvuustasolla kuin ennen ilmaantuvuuden äkillistä nousua, kunnes aivan viime päivinä ilmaantuvuus kääntyi taas huolestuttavasti uuteen nousuun. Emme siis voi tuudittautua siihen, että korona on selätetty, vaan on ymmärrettävä, että tilanne voi riistäytyä käsistä muutamissa päivissä, sanoo mikrobiologian erikoisalajohtaja, ylilääkäri Tapio Seiskari.
Positiivisten koronatulosten keskiarvoinen, päiväkohtainen ilmaantuvuus seurannan aikana 13.7.–16.11.2020.
Naiset kävivät testattavana miehiä aktiivisemmin
Heinäkuulta alkavan seurannan mukaan naiset hakeutuvat
testattaviksi miehiä aktiivisemmin. Sen sijaan positiivinen tutkimustulos on
todennäköisempi miehillä. Tutkimuksessa
käyneistä kaikkiaan 42 prosenttia oli miehiä ja silti positiivisista tuloksista
yli puolet todettiin heillä.
Kaikkein
aktiivisimmin testattiin työikäisiä naisia. Heidän osuutensa testatuista oli enimmillään
lähes viidenneksen suurempi kuin vastaavan ikäisten miesten.
– Tämä selittynee terveydenhuollon ja opetustoimen henkilöstön runsaalla testaamisella. Runsas testaaminen ei kuitenkaan tuonut esille vastaavassa määrin positiivisia tuloksia, toteaa palvelujohtaja Anu Mustila.
Seurannan aikana testatuista henkilöistä 42 prosenttia oli miehiä ja 58 prosenttia naisia. Positiivisista tuloksista yli puolet, 52 prosenttia, todettiin miehillä.
Se, että myös iäkkäämmät, yli 60-vuotiaat miehet
hakeutuivat testattaviksi harvemmin kuin saman ikäiset naiset, jää vaille
selitystä. Paitsi näissä ikäryhmissä myös nuorilla 21–30-vuotiailla miehillä
positiivinen tutkimustulos oli kaikkein todennäköisin.
Testiin matalalla kynnyksellä
Sitä, hakeudutaanko covid-19-tutkimuksiin
samanlaisella kynnyksellä iästä ja sukupuolesta riippumatta, on Mustilan mukaan
syytä pohtia laajemmin.
– Miesten hakeutuminen testeihin on ollut iästä riippumatta naisia vähäisempää. Mikäli tutkimuksiin ei hakeuduta lieväoireisina tai vältetä kontaktia toisten ihmisten kanssa, voi covid-19-ilmaantuvuus nousta aivan yhtä nopeasti kuin lokakuun alussa tapahtui.
Positiivisten koronatulosten osuus koko ikäluokan tutkimusmäärästä (naiset ja miehet yhteensä).
Elokuun lopulla annettu valtakunnallinen
koronatestausstrategia nostaa testauksen määrää koskevan tavoitteen 20 000
näytteeseen vuorokaudessa. Tavoitteena on, että testeihin pääsee vuorokaudessa
ja että testitulos on käytettävissä vuorokauden kuluessa näytteenotosta. Fimlabin
tavoitteena on saavuttaa tarvittava testauskapasiteetti syys–lokakuun aikana.
Suurin
osa Kanta-Hämeen, Keski-Suomen, Pirkanmaan ja Vaasan sairaanhoitopiirien sekä
Päijät-Hämeen hyvinvointikuntayhtymän alueiden koronanäytteistä analysoidaan
Fimlabin keskuslaboratoriossa Tampereella. Näytemäärä on kasvanut elokuussa
nopeasti yli 2 000 näytteeseen vuorokaudessa.
– Elokuun
aikana näytemäärän kasvu on ollut eksponentiaalista, minkä johdosta
vastausviive on ajoittain ollut yli neljä vuorokautta. Eri puolilla tapahtunut
testausjonojen purkaminen on tuottanut niin suuria näyte-eriä, että niistä on
muodostunut ruuhkia. PCR-testaus suuren kapasiteetin laitteilla kestää jopa
yhdeksän tuntia, eikä koneaikaa ole mahdollista lyhentää. Lisäksi tähän on
laskettava päälle aikaa vievä näytekäsittely, toteaa mikrobiologian
erikoisalajohtaja Tapio Seiskari.
Haasteita
testauskapasiteetin nostamiselle on aiheuttanut myös testauksessa tarvittavien
reagensseihin ja kulutustarvikkeisiin kohdistuva massiivinen globaali kysyntä.
– Tarvikkeita
allokoidaan nyt globaalisti maiden todellisen tarpeen mukaan. Suomen tilanteen
ollessa vielä rauhallinen, emme ole ensimmäisten joukossa toimituslistalla,
Seiskari sanoo.
Uudet laitehankinnat kaksinkertaistavat testauskapasiteetin
Fimlab
pyrkii nostamaan koronatestauskapasiteettiaan syksyn aikana, ja onkin jo
keväällä tilannetta ennakoiden tehnyt kaksi uutta laitehankintaa
analytiikkalinjastoansa täydentämään. Nämä laitteet mahdollistavat kapasiteetin
kaksinkertaistamisen.
– Nämä
syksyllä saapuvat täydentävät laitetoimitukset lisäävät toimintavarmuutta ja
nopeuttavat tulosten saamista. Tavoitteena on vastauksen tuottaminen 1–2 vuorokaudessa,
kertoo Seiskari.
Kasvavat näytemäärät edellyttävät myös työvuorojen ja henkilöstön lisäämistä ja perehdyttämistä. Fimlabiin onkin syksyn mittaan tulossa lisälaitteiston lisäksi lisää henkilökuntaa, joka osaltaan auttaa tavoitteen saavuttamisessa.
Testauskapasiteetin
kasvattaminen ei yksin riitä vastaamaan haasteeseen, sillä ongelmaksi on
monilla alueilla muodostunut näytteenottoruuhkat. Fimlab ottaa vain osan
toiminta-alueensa näytteistä. Pirkanmaalla tämä on noin puolet kaikista
julkisen puolen koronanäytteenotoista. Muilla alueilla pääosin hoitoyksiköt
ottavat näytteet itse.
Pirkanmaalla
toimivat drive-in-näytteenottopisteet ovat osoittautuneet erittäin tehokkaiksi
ja nopeiksi toimintamalleiksi. Niiden avulla on jo nyt saatu purettua ruuhkia,
ja testiin pääsee päivässä.
–
Elokuun lopussa avatussa Tampereen Messu- ja Urheilukeskuksen
drive-in-testauspisteessä pystytään ottamaan tällä hetkellä noin tuhat testiä
päivässä. Määrää on mahdollista kasvattaa, kun näytteenottolinjoja avataan
lisää, kertoo Fimlabin Pirkanmaan aluejohtaja ja ylilääkäri Anna-Maija
Haapala.
Messu-
ja Urheilukeskuksen drive-in-näytteenottopisteen ohella koronanäytteenottoa on
Pirkanmaalla TAYSin alueella ja Hatanpään sairaalassa. Näihin
näytteenottopisteisiin tulisi ohjata erityisesti autotta kulkevat asiakkaat.
– Koronanäytteenotto
toimii ajanvarauksella. Näytteenottoon tulo vaatii aina hoitoyksikön tekemän arvion
ja lähetteen, Haapala muistuttaa.
Tampereen Messu- ja Urheilukeskuksen testauspiste on avoinna seitsemänä päivänä viikossa. Lue lisää täältä.
Olemme käynnistäneet kohdunkaulan syövän seulontakutsujen lähettämisen kaikille seulonnan piiriin tänä vuonna kuuluville asiakkaillemme.
HUOM. Koronatilanteesta johtuen asiakkaidemme on hyvä varautua viiveisiin tutkimustulosten saamisessa.
Huomaathan, että kutsu on voimassa vuoden 2020 loppuun asti eli voit varata ajan gynekologiseen näytteenottoon sinulle parhaiten sopivana ajankohtana.
Tutkimus ei ole kiireellinen, mutta pidämme seulontoihin osallistumista äärimmäisen tärkeänä, jotta syövän esiasteisiin viittaavat solumuutokset havaitaan ajoissa.
Varaa aika gynekologiseen näytteenottoon
Aikaa
varatessa on hyvä huomata, että olemme epidemian takia joutuneet sopeuttamaan
toimintaamme ja osa toimipisteistämme palvelee supistetuin aikatauluin ja osa
on suljettu. Jos et saa aikaa lähimpään laboratorioon, niin voit varata ajan
mihin tahansa alueellasi toimivaan, gynekologisia näytteitä ottavaan
laboratorioon. Ajanvarausjärjestelmämme tarjoaa automaattisesti seuraavat
vapaana olevat ajat.
Olemme käynnistäneet kohdunkaulan syövän seulontakutsujen lähettämisen kaikille seulonnan piiriin tänä vuonna kuuluville asiakkaillemme.
Epidemian vuoksi Fimlab on väliaikaisesti tauottanut kutsujen lähettämisen kohdunkaulan syövän seulontakokeisiin (ns. joukkopapa). Kutsujen lähettäminen jatkuu tällä tietoa toukokuun puolivälissä. Fimlab pyrkii tekemään kaikki vuoden 2020 seulonnat aikataulun mukaisesti vuoden loppuun mennessä. Jokainen vuoden 2020 seulontaan kuuluva saa seulontakutsun viimeistään marraskuun puoliväliin mennessä.
Huomaathan,
että kutsu on voimassa vuoden 2020 loppuun asti. Eli jos et nyt
poikkeustilanteessa halua osallistua seulontakokeeseen, voit varata ajan näytteenottoon sitten kun tilanne on helpottanut.
Aikaa
varatessa on hyvä huomata, että olemme epidemian takia joutuneet sopeuttamaan
toimintaamme ja osa toimipisteistämme palvelee supistetuin aikatauluin ja osa
on suljettu. Jos et saa aikaa lähimpään laboratorioon, niin voit varata ajan
mihin tahansa alueellasi toimivaan, gynekologisia näytteitä ottavaan
laboratorioon. Ajanvarausjärjestelmämme tarjoaa automaattisesti seuraavat
vapaana olevat ajat.
Fimlab on tehnyt ison laitehankinnan, joka nostaa koronaviruksen testauskapasiteetin monikertaiseksi. Kahdella Rochen Cobas 8800 -laboratoriojärjestelmällä on mahdollista tutkia suuri osa koko Suomen testaustarpeesta, sillä laboratoriojärjestelmä mahdollistaa jopa 8000 näytteen tutkimisen vuorokauden aikana. Samalla testausta voidaan automatisoida ja tehostaa sekä nopeuttaa vastausten saamista.
Kotimainen testauskapasiteetti varmasti riittää, vaikka näytemäärät kasvavat. Valmistaudumme samalla lisäämään näytteenoton kapasiteettia.
Fimlabin toimitusjohtaja Ari Miettinen
Koronaviruksen testaukset ovat
alkaneet Fimlabissa jo helmikuun lopulla ja testauskapasiteettia on lisätty
sitä mukaa kuin näytemäärät ovat kasvaneet. Tällä hetkellä testataan noin 500-600
näytettä päivässä.
Rajoitustoimet ovat purreet hyvin, mutta rajoitusten asteittaisen purkamisen seurauksena ja syksyn flunssakauden käynnistyessä on odotettavissa, että oireisten potilaiden määrä kasvaa ja sen myötä testaustarve.
Ylilääkäri Tapio Seiskari
Fimlabin hankkimien Roche Cobas 8800 -laboratoriojärjestelmien testausprosessit ovat pitkälle automatisoituja. Uudet laitteet palvelevat laajasti virusdiagnostiikkaa. Automaation avulla saadaan tehostettua toimintaa ja nopeutettua vastausten saamista, kun samanaikaisesti voidaan testata suuria määriä näytteitä yhdellä laitteella. Suuren globaalin kysynnän vuoksi laitteita joudutaan odottamaan, mutta ne ovat tulossa Sveitsistä Suomeen ja testauskapasiteetti kasvaa jo toukokuun aikana.
Ennen tavoiteltuihin testausmääriin pääsemistä pitää kuitenkin myös näytteiden ottamista lisätä merkittävästi. Kun testauksen kriteerejä väljennetään, nousee testattavien määrä vähitellen. Meillä on tarvittava kapasiteetti käytössä silloin, kun sitä tarvitaan.
