Indikaatiot
Epäily steriilin alueen bakteeri-infektiosta, erityisesti jos bakteeriviljely on negatiivinen esimerkiksi antibioottihoidon tai näytteessä mahdollisesti esiintyvän bakteerin vaikean viljeltävyyden vuoksi.
Lähete/tutkimuksen tilaaminen
Näytteen laatu tai ottokohta merkittävä pyynnön lähete-kohtaan.
Näyteastia
Steriili tai tehdaspuhdas putki tai purkki.
Näyte
Steriilin alueen näytteet (kudospala tai aspiraatti): steriilissä tai tehdaspuhtaassa purkissa tai putkessa. Kudospalaan voidaan lisätä hieman steriiliä keittosuolaliuosta kuivumisen estämiseksi.
Likvor, lapsivesi tai luuydin: n. 1 ml steriilissä tai tehdaspuhtaassa putkessa.
Nivelneste ja pleuraneste: EDTA- tai sitraattiputkeen
Tutkimusta ei ole tarkoitettu tehtäväksi verinäytteestä eikä näytteistä, joissa oletettavasti esiintyy normaaliflooran bakteereita.
Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely
Säilytys jääkaapissa, lähetys huoneenlämmössä
Menetelmä
Bakteerin osoitus DNA-monistusmenetelmällä (PCR). Positiivisessa tapauksessa bakteeri tunnistetaan määrittämällä ribosomaalista RNA:ta koodaavan geenin emäsjärjestys ja vertaamalla sitä tunnettujen bakteerien sekvensseihin.
Tulos valmiina
Noin viikon kuluessa
Tulkinta
Positiivinen PCR-tulos viittaa yhden tai useamman bakteerin läsnäoloon näytteessä. Yhden bakteerin aiheuttamissa infektioissa pystytään aiheuttaja yleensä tunnistamaan ainakin sukutasolle. PCR-tuotteen sekvensointi ei onnistu jos bakteeria on näytteessä hyvin vähän.