Johdanto
KIT-geeni (c-KIT) sijaitsee kromosomissa 4q12 ja se koodaa luokan III transmebraanista reseptorityrosiinikinaasia (CD117). KIT-geenin mutaatiot voivat aiheuttaa reseptorin konstitutiivisen aktivaation. Mutaatiot sijoittuvat erityisesti kinaasialayksikköä koodaavaan eksoniin 17, mutta myös muihin eksoneihin. KIT-geenin aktivoivia mutaatioita tavataan useissa eri tautitiloissa, mm. systeemisessä mastosytoosissa sekä akuutissa myelooisessa leukemiassa.
Suurimmalla osalla aikuisiän systeemistä mastosytoosia sairastavista voidaan osoittaa KIT-geenin aktivoiva mutaatio D816V (c.2447A>T), joka luetaan yhdeksi sivukriteeriksi taudin diagnostiikassa. D816V-mutaation osoituksessa on tärkeää käyttää herkkää mutaationosoitustekniikkaa, koska klonaalisten mast-solujen osuus luuydinaspiraatissa voi olla vähäinen. Tässä tutkimuksessa käytetään TaqMan-PCR -menetelmää, jolla voidaan osoittaa KIT-geenin D816V-mutaatio ainakin 0,1 %:n herkkyystasolle asti.
Tiedustelut
Sairaalageneetikot puh. 03-311 75937, 050-347 6382
Indikaatiot
Systeemisen mastosytoosin diagnostiikka.
Lähete/tutkimuksen tilaaminen
Atk-pyyntö. Mikäli atk-pyyntöä ei ole mahdollista tehdä, täytetään huolellisesti genetiikan lähete, joka löytyy ohjekirjan Lähetteet-kansiosta.
HUOM! Mikäli tutkimus halutaan tehtäväksi jo aikaisemmin otetusta näytteestä, toimitaan näin: JOTTA PYYNTÖ VÄLITTYY GENETIIKAN LABORATORIOON tulee WebFimlabissa vaihtaa Näytteenotto -kohtaan ”Näytteenotto heti, tulosta tarrat”. Tarroja ei kuitenkaan tarvitse tulostaa laboratoriota varten.
Näyteastia
4 ml CPT-putki
Näyte
Sitraattiruiskulla n. 3 ml luuydintä CPT-putkeen (suositeltava putkityyppi: BD Vacutainer CPT with Sodium Citrate, 4 mL draw capacity).
Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely
Sentrifugointi (30 min, 1600 g, huoneenlämpö 18-25°C) kahden tunnin sisällä näytteenotosta. Sentrifugoinnin jälkeen käännetään avaamaton putki 8-10 kertaa ylösalaisin. Putket voidaan lähettää huoneenlämmössä normaalina yön yli postina.
Menetelmä
TaqMan-PCR mutaatiospesifisellä ASO-alukkeella D816V-mutaation osoittamiseksi.
Tulos valmiina
Noin kolmen viikon kuluessa näytteen saapumisesta laboratorioon.
Tulkinta
Tutkimuksesta annetaan lausunto.
Tutkimuslyhenne | Toimipisteet akkreditoinnin pätevyysalueella | Akkreditoitu |
---|---|---|
92502 | Bm-KIT816 | Ei | |