11.3.2022
Laboratoriotiedote 32/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten
DPYD-geenin varianttien tutkimus, B -DPYD-D, 14379
DPYD-geeni koodaa dihydropyrimidiinidehydrogenaasi (DPD)-entsyymiä, joka on fluoropyrimidiinilääkkeiden metabolian nopeutta rajoittava entsyymi. DPYD-geenin muutoksia tunnetaan useita ja osalla niistä on vaikutus DPD-entsyymin aktiivisuuteen. Alentunut DPD-entsyymin aktiivisuus hidastaa kyseisten lääkeaineiden metaboliaa ja altistaa niiden aiheuttamille vakaville haittavaikutuksille. Euroopan lääkevirasto (EMA) suosittaa DPD-entsyymin aktiivisuuden selvittämistä ennen syöpäpotilaiden fluoropyrimidiinihoitoja.
Tutkimuksessa määritetään CE-IVD -merkittyä menetelmää käyttäen DPYD-geenin kuusi pistemutaatiota:
- c.1905+1 G>A (DPYD*2A, rs3918290)
- c.1679 T>G (p.Ile560Ser, DPYD*13, rs55886062)
- c.2846A>T (p.Asp949Val, rs67376798)
- c.1236G>A (HapB3, rs56038477)
- c.483+18G>A (HapB3, rs56276561)
- c.1129-5923C>G (HapB3, rs75017182)
Laajennuksena tutkimussisältöön selvitetään jatkossa myös mahdollinen DPYD-geenin eksonin 4 deleetio laboratoriomme omaa PCR-menetelmää käyttäen. Deleetion on raportoitu liittyvän alentuneeseen DPD-entsyymin aktiivisuuteen varsinkin suomalaisväestössä. Vaikka kyseiselle muutokselle ei ole tällä hetkellä saatavilla hoitopäätöksiä ohjaavia ”geeniaktiivisuuspisteitä”, kuten paremmin tunnetuille pistemutaatiolle, tulisi kyseinen muutos ottaa huomioon fluoropyrimidiinilääkitystä aloitettaessa.
Lisätietoja
Tarkemmat tiedot tutkimuksesta, näyteputkista ja tilaamisesta löytyvät sähköisestä Fimlabin ohjekirjasta. Tutkimusten hinnat on tarkistettavissa Fimlabin myyntiorganisaatiosta myynti[at]fimlab.fi.
Kirjallisuutta
Saarenheimo J, Wahid N, Eigeliene N, Ravi R, Salomons GS, Ojeda MF, Vijzelaar R, Jekunen A, van Kuilenburg ABP. Preemptive screening of DPYD as part of clinical practice: high prevalence of a novel exon 4 deletion in the Finnish population. Cancer Chemother Pharmacol. 2021 May;87(5):657-663. doi: 10.1007/s00280-021-04236-y. Epub 2021 Feb 5. PMID: 33544210.
Saarenheimo J, Wahid N, Tornio A, Ristamäki R, Keinänen M, Niemi M, Turpeinen M, Jekunen A. DPYD-geenitestaus kliinisessä käytössä. Duodecim 2021;137(23):2560-6
Tiedustelut
Leena Huhti, sairaalageneetikko, p. 041 730 6148
Virpi Laitinen, sairaalageneetikko, p. 041 730 6149
Sara Lehtinen, geneetikko, p. 041 730 6150
Mauri Keinänen, erikoisalajohtaja