28.4.2020
Laboratoriotiedote 47/2020 • Keski-Suomi
Keski-Suomen positiivisten veriviljelynäytteiden analytiikka muuttuu merkittävästi 28.4. alkaen.
Positiivisten näytteiden jatkoviljely siirtyy Keski-Suomen keskussairaalan mikrobiologian laboratoriosta Tampereen keskuslaboratorioon. Vastaavasti Keski-Suomeen jäävää positiivisten näytteiden alustavaa analytiikkaa kehitetään nukleiinihappo-osoitusmenetelmällä.
Prosessi ei vaikuta negatiivisten näytteiden analytiikkaan. Positiivisten vastausten osalta alustavan vastauksen sisältö tarkentuu merkittävästi (lisätietoa alla). Lopullinen vastaus valmistuu pääsääntöisesti samalla viiveellä kuin aiemmin, joissain tapauksissa päivää myöhemmin.
Menetelmä- ja prosessimuutos ei vaikuta tutkimuksen hintaan.
Nukleiinihappo-osoitusmenetelmän sisältö
Nykyisin positiivisen veriviljelynäytteen alustava tunnistus perustuu subjektiiviseen gram-värjäykseen, missä vastausmuoto on hiiva, grampositiivinen tai -negatiivinen sauva tai kokki.
Käyttöön otettava menetelmä on monikanavainen nukleiinihappo-osoitusmenetelmä, ns. multiplex-PCR. Tunnistuspaneeli sisältää lajitason tunnistuksen noin 20 veriviljelyssä yleisimmälle bakteerille ja hiivalle. Lisäksi suku-/heimotason tunnistus laajentaa testin kattavuutta vielä useilla kymmenillä bakteerilajeilla. Kaikkiaan tunnistuspaneeli kattaa yli 90 % Suomessa esiintyvistä veriviljelylöydöksistä. Menetelmä ei tunnista anaerobibakteereita.
| Gram-positiiviset bakteerit | Gram-negatiiviset bakteerit | Hiivat |
| Enterococcus-suku | Acinetobacter baumannii | Candida albicans |
| Listeria monocytogenes | Enterobacteriaceae-heimo | Candida glabrata |
| Staphylococcus-suku | Enterobacter cloacae complex | Candida krusei |
| Staphylococcus aureus | Escherichia coli | Candida parapsilosis |
| Streptococcus-suku | Klebsiella oxytoca | Candida tropicalis |
| Streptococcus agalactiae | Klebsiella pneumoniae | |
| Streptococcus pneumoniae | Proteus-suku | |
| Streptococcus pyogenes | Serratia marcescens | |
| Haemophilus influenzae | ||
| Neisseria meningitidis | ||
| Pseudomonas aeruginosa |
Mikrobitunnistuksen lisäksi menetelmä tunnistaa KPC- (CPE), vanA/B- (VRE) ja mec- (MRSA) resistenssiominaisuuksia.
Asiakkaiden tulee huomioida, että nukleiiniihappo-osoitus on menetelmänä täysin eriävä viljelystä ja värjäyksestä ja tunnistustulos on siksi alustava. Menetelmä ei havaitse tunnistuspaneelin ulkopuolisia mikrobeita ja menetelmä voi havaita mahdollisia nukleiinihappojäämiä veriviljelypullon elatusaineessa. Nukleiinihappo-osoitusmenetelmän puutteita tuetaan positiivisista näytteistä edelleen tehtävällä gram-värjäyksellä. Veriviljelyn varsinainen vastaus perustuu edelleen positiivisen näytteen jatkoviljelyyn.
Lisätiedot
Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.
Tiedustelut
Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800
Jaakko Uksila, Ylilääkäri
Tapio Seiskari, Erikoisalajohtaja