Johdanto
Farmakogenetiikalla tarkoitetaan geneettisiä variaatioita, jotka vaikuttavat lääkeainevasteeseen. Potilaan yksilöllisten ominaisuuksien huomioiminen lääkkeen valinnassa ja annostuksessa on osa nykyaikaista ja taitavaa lääkkeiden määräämistä. Testin tulokset auttavat ennakoimaan lääkkeiden vaikutuksia potilaaseen sekä annostelemaan lääkkeitä aiempaa turvallisemmin ja tehokkaammin.
Tutkimus kattaa 29 geeniä ja sisältää lausunnon potilaan fenotyypin mukaiseen annosteluun yli 100 lääkeaineelle ja 240 lääkkeelle. Lausunto on tarkoitettu yleis- tai erikoislääkäreiden käyttöön.
Paneeliin on valittu geenit, joiden variaatiot vaikuttavat yleisesti määrättyjen lääkeaineiden metaboliaan. Sytokromi P450 (CYP) on tärkein ensimmäisessä vaiheessa lääkeaineiden aineenvaihduntaan osallistuvista entsyymijärjestelmistä. CYP-entsyymejä on useita ja eri lääkeianeet metaboloituvat eri CYP-entsyymien kautta. Toisaalta joidenkin lääkeaineiden metabolia vaatii usean eri entsyymin toimintaa (vrt. varfariinihoito; CYP2C9 ja VKORC1). CYP-entsyymien variaatioiden lisäksi paneelissa tutkitaan variaatioita, jotka liittyvät lääkehoidon lisääntyneeseen sivuvaikutusriskiin (esim. SLCO1B1 ja faktorit FV ja FII). Laajennetussa paneelissa on mukana on lisäksi mm. syöpälääkemetaboliassa tärkeät TPMT- ja DPYD-geenit sekä G6PD-geeni joka on tärkeässä roolissa hemolyyttisen anemian riskiä arvioitaessa etenkin Afrikan maista tulevien potilaiden kohdalla.
Paneelin käyttö on kustannustehokkaampaa kuin erillisten geenien/variaatioiden tutkiminen yksittäin. Laajennettu paneeli kattaa yli 100 lääkeainetta, joiden vaikutus riippuu merkittävästi potilaan omasta perimästä.
Indikaatiot
Lääkehoidon aloitus, sopivan annostuksen määrittely. Epäily lääkehoidon tehosta. Lääkehoidon haittojen ennaltaehkäisy.
Näyteastia
EDTA-putki (K2) 5/3 ml.
Näyte
3 ml EDTA-verta.
Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely
Lähetys mahdollisimman pian huoneenlämpöisenä. Näyte voidaan säilyttää 24 h huoneenlämmössä. Lyhytaikainen (1-5 vrk) säilytys jääkaapissa. Pidempiaikainen säilyttäminen (yli 5 vrk) pakastettuna.
Menetelmä
Tutkimus tehdään TaqMan-kemialla (SNP-variaatiot OpenArray-teknologialla ja CYP2D6-geenin monistuma/puutos TaqManMGB kemialla). Testipaneelilla tutkitaan tunnettuja variaatioita. Tutkimuksella ei havaita tutkittavien geenien harvinaisia variaatioita eikä CYP2D6-geenin mahdollisia harvinaisia rakenteellisia muunnoksia.
Tulos valmiina
30 arkipäivän kuluttua.
Tulkinta
Tutkimuksesta annetaan kirjallinen lausunto. Tulkinnassa hyödynnetään yhteistyökumppanin (Abomics Oy) farmakogeneettistä asiantuntijaosaamista. Tuloksen tulkinta perustuu Abomics Oy:n GeneRx-tietokantaan, joka sisältää useista eri lähteistä kootut tiedot geenien vaikutuksesta lääkkeiden tehoon ja turvallisuuteen, mukaan lukien fenotyyppikohtaiset suositukset annosohjeineen.
Farmakogeneettisessä paneelissa tutkittavat geenit:
| ABCB1 | digoksiini, ondansetroni |
| ABCG2 | allopurinoli, atorvastatiini, rosuvastatiini |
| ALDH2 | alkoholi, glyseryylitrinitraatti |
| BCHE | mivacurium, suksametoni, tetrakaiini |
| CACNA1S | desfluraani, enfluraani, halotaani, isofluraani, metoksifluraani, sevofluraani, sukkametoni |
| CYP1A2 | agomelatiini, kofeiini, klotsapiini, olantsapiini, paroksetiini, rukaparibi |
| CYP2B6 | bupropioni, efavirentsi, metadoni, nevirapiini, prasugreeli |
| CYP2C_rs12777823 | varfariini |
| CYP2C19 | amitriptyliini, brivarasetaami, sitalopraami, klopidogreeli, essitalopraami, fluoksetiini, fluvoxamiini, imipramiini, lansopratsoli, mefenytoiini, omepratsoli, pantopratsoli, fenytoiini, sertraliini, vorikonatsoli |
| CYP2C8 | pioglitasooni, rosiglitasooni |
| CYP2C9 | asenokumaroli, diklofenaakki, dronabinoli, ibuprofeeni, irbesartaani, losartaani, meloksikaami, fenytoiini, pioglitasooni, tolbutamidi, varfariini |
| CYP2D6 | amitriptyliini, atomoksetiini, kodeiini, desipramiini, dekstrometorfaani, duloksetiini, haloperidoli, metoprololi, nortriptyliini, ondansetroni, oksikodoni, paroksetiini, risperidoni, tamoksifeeni, tramadoli |
| CYP3A4 | atorvastatiini, simvastatiini |
| CYP3A5 | prasugreeli, takrolimuusi, vinkristiini |
| CYP4F2 | varfariini |
| DPYD | kapecitabiini, flusytosiini, fluorourasiili, tegafuuri |
| F2 | (prothrombin) avatrombopagi, konjugoitu estrogeenit, eltrombopagi, estradioli, estrioli, etinyyliestradioli, lusutrombopagi, romiplostiimi, tamoksifeeni, tibolone |
| F5 | avatrombopagi, konjugoitu estrogeenit, eltrombopagi, estradioli, estrioli, etinyyliestradioli, lusutrombopagi, romiplostiimi, tamoksifeeni, tiboloni |
| G6PD | artikaiini, askorbiinihappo, bupivakaiini, klooriprokaiini, klorokiini, klooripropamidi, siprofloksasiini,dabrafenibi, dapsoni, flutamidi, hydroksiklorokiini, levofloksasiini, lidokaiini, mafenidi, mafeniidramiini, metoklopramidi, nitrofurantoiini, norfloksasiini, peglotikaasi, prilokaiini, primakiini, probenesidi, kinini, rasburikaasi, ropivakaiini, natriumnitriitti, sulfadiatsiini, sulfametoksatsoli, sulfasalatsiini, sulfisoksatsoli, tafenokiini, tetrakaiini, tolbutamidi |
| GRIK4 | sitalopraami, essitalopraami |
| IFNL3 | bosepreviiri, daklatasviiri, peginterferoni alfa-2a, peginterferoni alfa-2b, ribaviriini, simepreviiri, sofosbuviiri, telapreviiri |
| MTHFR | foolihappo, metotreksaatti |
| NAT2 | amifampridiini, dapsoni, hydralatsiini, isoniatsidi, sulfametoksatsoli, sulfasalatsiini |
| NFIB | klotsapiini |
| NUDT15 | atsatiopriini, merkaptopuriini, tioguaniini |
| SLCO1B1 | atorvastatiini, fluvastatiini, lovastatiini, metotreksaatti, pitavastatiini, pravastatiini, rosuvastatiini, simvastatiini |
| TPMT | atsatiopriini, sisplatiini, merkaptopuriini, tioguaniini |
| UGT1A1 | arformoteroli, atatsanaviiri, belinostaatti, binimetinibi, kabotegraviiri, dolutegraviiri, erlotinibi, govitekaani, indakateroli, irinotekaani, nilotinibi, patisiraani, raltegraviiri, sasatuzumabigovitekaani |
| VKORC1 | varfariini |
Lisätiedot
Huomioitavaa
Tämän tutkimuksen tulos tallennetaan automaattisesti geenitaltioon, joka on potilaan henkilökohtainen tietovarasto geenitestien tuloksille.
Kun pyydetty tutkimus on valmistunut, vastataan tulos normaalilla vastausliikenteellä tilaajan potilastietojärjestelmään. Lisäksi tulos tulkintoineen tallennetaan Geenitaltio-palveluun. Kantaan välittyvässä vastauksessa annetaan ohjeet geenitaltioon kirjautumiseen. Geenitaltiosta tulokset ovat potilaan hyödynnettävissä tarvittaessa.
Lisätietoja: www.geenitaltio.fi
Lisätietoja
Terveysportti, Farmakogenetiikka, www.terveysportti.fi
PharmGKB julkinen tietokanta, www.pharmgkb.org/index.jsp
Abomics Oy, www.abomics.fi