Johdanto
Tampereen Biopankkiin kerätään näytteitä ja niihin liittyvää tietoa biolääketieteellistä tutkimusta ja tuotekehitystä varten. Näytteitä hyödynnetään biopankkilain mukaisesti. Tampereen Biopankki toimii yliopistosairaalan yhteydessä. Näytteitä kerätään biopankkisuostumuksen ja -hyväksynnän antaneilta henkilöiltä diagnostisen näytteenoton yhteydessä.
Tiedustelut
Biopankin tutkimuskoordinaattori p. 044 472 8425
Tampereen Biopankin laboratorio p. 03 311 66026, 044 472 8840
Indikaatiot
CtDNA-näytteet ovat syöpäpotilailta biopankin tuorekudosnäytekeräyksen yhteydessä kerättäviä nestebiopsiaverinäytteitä. CtDNA-näytteet otetaan ennen leikkausta ja ctDNA2-näytteet leikkauksen jälkeen. Nestebiopsianäytteessä on havaittavissa ja tutkittavissa syövälle ominaiset somaattiset mutaatiot ja epigeneettiset muutokset. ctDNA-näytteitä kerätään vain sovituilta erikoisaloilta.
Lähete/tutkimuksen tilaaminen
Alla mainittuihin toimipisteisiin on toimitettu Biopankki ctDNA -näytteen ottamiseen tarkoitetut erikoisputket:
TAYS poliklinikkalaboratorio, Radiuksen laboratorio, Hatanpään laboratorio, Kuninkaankulman laboratorio, Valkeakosken laboratorio ja Vammalan laboratorio.
Näissä toimipisteissä asiakas voi siten käydä antamassa Biopankki ctDNA -näytteen, vaikka hänellä ei itsellään olisi näytteenottosettiä mukanaan.
Näytteitä otetaan arkipäivisin, ajantasaiset aukioloajat on nähtävissä Fimlabin verkkosivuilla.
HUOM!
Asiakas saattaa tulla tämän tutkimuksen näytteenottoon myös siten, että hänellä on erikoisputket ja keltamustaraidallinen lähetyslaatikko mukanaan.
Tällöin näytteet voidaan ottaa missä tahansa Fimlabin näytteenottopisteessä.
Näyteastia
BIOctDNA ja BIOctDNA2: cell free DNA BCT 10 ml → näitä erikoisputkia on toimitettu vain TAYS poliklinikkalaboratorioon sekä Radiuksen, Hatanpään, Kuninkaankulman, Valkeakosken ja Vammalan laboratorioon.
Asiakkaalla voi olla myös näytteenottoputket mukana.
Näyte
BIOctDNA ja BIOctDNA2: 2 x 10 ml DNA BCT-näyte, aputarran mukaisesti huoneenlämpö. Ota näyte aina vakuumisti. Molemmille ctDNA-putkille tulostuu oma viivakooditarra.
Jos näytteenotto ei onnistu vakuumisti, jätä näyte ottamatta. Ota ctDNA-näytteet näytteenottojärjestyksessä EDTA-putken ja fluoridioksalaattiputken (sokeriputki) välissä.
ctDNA – näytteitä ei suositella otettavan heti hepariiniputken jälkeen seuraavana näytteenä, joten jos asiakkaasta on pyydetty hepariininäytteitä, mutta ei EDTA-näytteitä, ota tällöin EDTA-hukkaputki hepariiniputken ja ctDNA-näytteiden välissä.
Näytteenoton jälkeen sekoita näyte kääntelemällä putkea varovasti n. 8-10 kertaa.
Kirjaa todellinen näytteenottoaika näytepyyntötarraan, mikäli näytteenottoaika on muuttunut tarratulostuksesta.
Putkeen liimattavapyyntötarra ei saa peittää nestepintaa ja tarran viivakoodin on oltava pystysuorassa, vähintään 2 cm putken alareunasta. Aputarraa ei liimata putkeen.
HUOM! Ottamatta jääneet tai ei saadut ctDNA-näytepyynnöt kuittaantuvat otetuiksi tarrojen tulostushetkellä. Pyyntötarrat tulee lähettää Tampereen Biopankkiin poistettavaksi.
Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely
Alueella otetut näytteet lähetetään huoneenlämmössä Tampereelle FM4 näytekäsittelyyn, josta näytteet toimitetaan omalla merkityllä kopallaan Tampereen Biopankille.
Näytteitä ei lähetetä taksi -kuljetuksella! Näytteet lähetetään lähetyslaatikossa FM Deltan näytekäsittelyyn.
Lisätiedot
ctDNA-näyteputkien tilaukset Tampereen Biopankin laboratoriosta p. 03 311 66026, 044 472 8840, 044 472 8425.