Johdanto
Tampereen Biopankkiin kerätään näytteitä ja niihin liittyvää tietoa biolääketieteellistä tutkimusta ja tuotekehitystä varten. Näytteitä hyödynnetään biopankkilain mukaisesti. Tampereen Biopankki toimii yliopistosairaalan yhteydessä. Näytteitä kerätään biopankkisuostumuksen ja -hyväksynnän antaneilta henkilöiltä diagnostisen näytteenoton yhteydessä.
Tiedustelut
Biopankin tutkimuskoordinaattori p. 044 472 8425
Tampereen Biopankin laboratorio p. 03 311 66026, 044 472 8840
Indikaatiot
CtDNA-näytteet ovat syöpäpotilailta biopankin tuorekudosnäytekeräyksen yhteydessä kerättäviä nestebiopsiaverinäytteitä. CtDNA-näytteet otetaan ennen leikkausta ja ctDNA2-näytteet leikkauksen jälkeen. Nestebiopsianäytteessä on havaittavissa ja tutkittavissa syövälle ominaiset somaattiset mutaatiot ja epigeneettiset muutokset. ctDNA-näytteitä kerätään vain sovituilta erikoisaloilta.
Lähete/tutkimuksen tilaaminen
Näytteenotto on mahdollista seuraavissa toimipisteissä, joihin on toimitettu erilliset Biopankki ctDNA -näytteen ottamiseen tarkoitetut erikoisputket:
TAYS poliklinikkalaboratoriossa, Radiuksen laboratoriossa, Hatanpään laboratoriossa, Kuninkaankulman laboratoriossa, Valkeakosken laboratoriossa ja Vammalan laboratoriossa.
Näytteitä otetaan vain arkisin ma-pe, paitsi Kuninkaankulman ja Hatanpään näytteenottopisteessä ma-la. Näytteitä ei lähetetä taksi -kuljetuksella!
HUOM! Asiakas saattaa tulla tämän tutkimuksen näytteenottoon myös erikoisputkien ja keltamustaraidallinen lähetyslaatikko mukanaan ja silloin näytteet voidaan ottaa missä tahansa Fimlabin näytteenottopisteessä. Näytteet lähetetään lähetyslaatikossa FM Deltan näytekäsittelyyn.
Näyteastia
BIOctDNA ja BIOctDNA2: cell free DNA BCT 10 ml → näitä erikoisputkia toimitettu vain TAYS poliklinikkalaboratorioon sekä Radiuksen, Hatanpään, Kuninkaankulman, Valkeakosken ja Vammalan laboratorioon.
Näyte
BIOctDNA ja BIOctDNA2: 2 x 10 ml DNA BCT-näyte, aputarran mukaisesti huoneenlämpö. Ota näyte aina vakuumisti. Molemmille ctDNA-putkille tulostuu oma viivakooditarra.
Jos näytteenotto ei onnistu vakuumisti, jätä näyte ottamatta. Ota ctDNA-näytteet näytteenottojärjestyksessä EDTA-putken ja fluoridioksalaattiputken (sokeriputki) välissä.
ctDNA – näytteitä ei suositella otettavan heti hepariiniputken jälkeen seuraavana näytteenä, joten jos asiakkaasta on pyydetty hepariininäytteitä, mutta ei EDTA-näytteitä, ota tällöin EDTA-hukkaputki hepariiniputken ja ctDNA-näytteiden välissä.
Näytteenoton jälkeen sekoita näyte kääntelemällä putkea varovasti n. 8-10 kertaa.
Kirjaa todellinen näytteenottoaika näytepyyntötarraan, mikäli näytteenottoaika on muuttunut tarratulostuksesta.
Putkeen liimattava pyyntötarra ei saa peittää nestepintaa ja tarran viivakoodin on oltava pystysuorassa, vähintään 2 cm putken alareunasta. Aputarraa ei liimata putkeen.
HUOM! Ottamatta jääneet tai ei saadut ctDNA-näytepyynnöt kuittaantuvat otetuiksi tarrojen tulostushetkellä. Pyyntötarrat tulee lähettää Tampereen Biopankkiin poistettavaksi.
Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely
Näytteet lähetetään omalla koppakuljetuksellaan Tampereen Biopankin laboratorioon (FM5, 7krs.) Lähetys huoneenlämmössä. Näyte voidaan toimittaa biopankin laboratorioon myös vasta näytteenottoa seuraavana päivänä.
Lisätiedot
ctDNA-näyteputkien tilaukset Tampereen Biopankin laboratoriosta p. 03 311 66026, 044 472 8840, 044 472 8425.