Tulosta

Tutkimus:
MIKROBIT, NUKLEIINIHAPPO (KVAL), LIKVORI
näytä tutkimukset

Luokitus:
Molekyylibiologia

Käyttöönottopäivä:
2.12.2022

23052 • Li-MikrNhO

23052 • Li-MikrNhO

Johdanto

Tutkimusta tehdään akuutin meningiitin ja enkefaliitin diagnostiikassa.

Indikaatiot

Akuutin mikrobiperäisen meningiitin/enkefaliitin erotusdiagnostiikka. Tämän tutkimuksen lisäksi potilaasta suositellaan otettavaksi likvorin bakteeriviljely (Li-BaktVi 1154).

Lähete/tutkimuksen tilaaminen

ATK-pyyntö. Mikäli ATK-pyyntöä ei voida tehdä, tulee käyttää Fimlabin yleislähetettä.

Näyteastia

Tehdaspuhdas putki

Näyte

0,5 ml likvoria/aivo-selkäydinnestettä. Mikäli näytettä on alle 0,2 ml, negatiivinen analyysitulos ei ole luotettava.

Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely

Näyte tulee toimittaa välittömästi laboratorioon.
Tarvittaessa näyte säilyy analyysikelpoisena 12 tuntia huoneenlämmössä ja 7 vrk jääkaappilämpötilassa.

Menetelmä

Multiplex-PCR eli monikanavainen nukleiinihappo-osoitus. Tutkimuksessa tunnistetaan seuraavat mikrobit (huomioi menetelmäkohtaiset erot):

Bakteerit

  • Escherichia coli K1
  • Haemophilus influenzae
  • Listeria monocytogenes
  • Neisseria meningitidis (kapselillinen)
  • Streptococcus agalactiae
  • Streptococcus pneumoniae
  • Streptococcus pyogenes (vain Pirkanmaa ja Kanta-Häme, positiivinen löydös vastataan lausunnossa)
  • Mycoplasma pneumoniae (vain Pirkanmaa ja Kanta-Häme, positiivinen löydös vastataan lausunnossa)

Virukset

  • Enterovirus (EV)
  • Herpes simplex virus 1 (HSV-1)
  • Herpes simplex virus 2 (HSV-2)
  • Human herpesvirus 6 (HHV-6)
  • Human parechovirus (HPeV)
  • Varicella zoster virus (VZV)
  • Cytomegalovirus (CMV) (vain Keski-Suomi ja Päijät-Häme, positiivinen löydös vastataan lausunnossa)

Sienet

  • Cryptococcus neoformans/gattii

Tulos valmiina

Tulos on valmiina saman tai seuraavan päivän aikana.

Viiteväli

Normaalisti negatiivinen.

Tulkinta

Positiivinen löydös viittaa kyseisen mikrobin aiheuttamaan meningiittiin/enkefaliittiin.
Löydöstä tulee aina arvioida suhteessa potilaan kliiniseen kuvaan.
Huomioi, että

  • menetelmä ei tunnista muita kuin K1-serotyypin E. coli -kantoja
  • menetelmä ei tunnista kapselittomia N. meningitidis -kantoja
  • menetelmä ei tunnista tunnistuspaneeliin kuulumattomia mikrobeja (esim. vierasesineperäiset stafylokokit)

Virhelähteet

  • Veren ei ole havaittu häiritsevän analyysiä, mutta mahdolliset mikrobit veressä voivat kontaminoida likvornäytteen. Siten verisen näytteen positiivinen tulos on epäluotettava meningiitin/enkefaliitin aiheuttajan suhteen.

Pirkanmaa ja Kanta-Häme: 

  • Positiivinen Streptococcus pneumoniae löydös voi aiheuttaa HSV-1 kohdalla väärän negatiivisen tuloksen, joten S. pneumoniae positiivisissa näytteissä HSV-1 negatiivisuuteen tulee suhtautua varauksella ja pyytää näytteestä tarvittaessa HSVNhO-tutkimus (Li-HSVNhO 4404)

Keski-Suomi ja Päijät-Häme:

  • Haemophilus haemolyticus voi antaa väärän positiivisen Haemophilus influenzae -tuloksen
  • Rinovirus voi antaa väärän positiivisen enterovirustuloksen