Johdanto
Tutkimusta tehdään akuutin meningiitin ja enkefaliitin diagnostiikassa.
Indikaatiot
Akuutin mikrobiperäisen meningiitin/enkefaliitin erotusdiagnostiikka.
Tämän tutkimuksen lisäksi potilaasta suositellaan otettavaksi likvorin bakteeriviljely (Li-BaktVi 1154).
Lähete/tutkimuksen tilaaminen
ATK-pyyntö. Mikäli ATK-pyyntöä ei voida tehdä, tulee käyttää Fimlabin yleislähetettä.
Näyteastia
Tehdaspuhdas putki
Näyte
0,5 ml likvoria eli aivo-selkäydinnestettä. Mikäli näytettä on alle 0,2 ml, negatiivinen analyysitulos ei ole luotettava.
Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely
Näyte tulee toimittaa välittömästi laboratorioon.
Tarvittaessa näyte säilyy analyysikelpoisena 12 tuntia huoneenlämmössä ja 7 vrk jääkaappilämpötilassa.
Menetelmä
Multiplex-PCR eli monikanavainen nukleiinihappo-osoitus. Tutkimuksessa tunnistetaan seuraavat mikrobit (huomioi menetelmäkohtaiset erot):
Bakteerit
- Escherichia coli K1
- Haemophilus influenzae
- Listeria monocytogenes
- Neisseria meningitidis (kapselillinen)
- Streptococcus agalactiae
- Streptococcus pneumoniae
- Streptococcus pyogenes (vain Pirkanmaa, Kanta-Häme ja Pohjanmaa)
- Mycoplasma pneumoniae (vain Pirkanmaa, Kanta-Häme ja Pohjanmaa)
Virukset
- Enterovirus (EV)
- Herpes simplex virus 1 (HSV-1)
- Herpes simplex virus 2 (HSV-2)
- Human herpesvirus 6 (HHV-6)
- Human parechovirus (HPeV)
- Varicella zoster virus (VZV)
- Cytomegalovirus (CMV) (vain Keski-Suomi ja Päijät-Häme)
Sienet
- Cryptococcus neoformans/gattii
Huom. mikäli tutkimus halutaan tehdä toisella alueella käytössä olevalla menetelmällä esim. Keski-Suomen alueen potilaalta halutaan tutkia Mycoplasma pneumoniae, tehdään pyyntö normaalisti, mutta näytteen mukaan tulee laittaa selkeä viesti, että halutaan tutkia alueen laboratorion paneelin kuulumaton mikrobi. Tällöin paikallinen laboratorio tietää lähettää näytteen analysoitavaksi toiseen Fimlabin toimipisteeseen.
Tulos valmiina
Tulos on valmiina saman tai seuraavan päivän aikana.
Viiteväli
Normaalisti negatiivinen.
Tulkinta
Positiivinen löydös viittaa kyseisen mikrobin aiheuttamaan meningiittiin/enkefaliittiin.
Löydöstä tulee aina arvioida suhteessa potilaan kliiniseen kuvaan.
Huomioi, että
- menetelmä ei tunnista muita kuin K1-serotyypin E. coli -kantoja
- menetelmä ei tunnista kapselittomia N. meningitidis -kantoja
- menetelmä ei tunnista tunnistuspaneeliin kuulumattomia mikrobeja (esim. vierasesineperäiset stafylokokit)
Virhelähteet
- Veren ei ole havaittu häiritsevän analyysiä, mutta mahdolliset mikrobit veressä voivat kontaminoida likvornäytteen. Siten verisen näytteen positiivinen tulos on epäluotettava meningiitin/enkefaliitin aiheuttajan suhteen.
Pirkanmaa, Kanta-Häme ja Pohjanmaa:
- Positiivinen Streptococcus pneumoniae löydös voi aiheuttaa HSV-1 kohdalla väärän negatiivisen tuloksen, joten S. pneumoniae positiivisissa näytteissä HSV-1 negatiivisuuteen tulee suhtautua varauksella ja pyytää näytteestä tarvittaessa HSVNhO-tutkimus (Li-HSVNhO 4404)
Keski-Suomi ja Päijät-Häme:
- Haemophilus haemolyticus voi antaa väärän positiivisen Haemophilus influenzae -tuloksen
- Rinovirus voi antaa väärän positiivisen enterovirustuloksen