Tulosta

Tutkimus:
Apinarokkovirus (Orthopoxvirus), nukleiinihappo (kval)

Luokitus:
Mikrobiologia

Käyttöönottopäivä:
7.11.2022

4608 • -PoxNhO

Johdanto

Apinarokko on Orthopoxvirusten sukuun kuuluvan apinarokkoviruksen (Monkeypox virus, MPXV) aiheuttama infektiotauti. Samaan sukuun kuuluvat muun muassa lehmärokkovirus ja isorokkoa aiheuttava variolavirus. Apinarokkoa esiintyy pääasiassa Länsi- ja Keski-Afrikassa, jossa se leviää yleensä zoonoottisesti esim. jyrsijöiden välityksellä. Toukokuusta 2022 alkaen Euroopassa ja Pohjois-Amerikassa on todettu apinarokkoa henkilöillä, jotka eivät ole matkustaneet alueilla, jossa apinarokkoa tavallisesti esiintyy.

Apinarokko tarttuu ensisijaisesti kosketustartuntana, mutta myös pisaratartunta tai tartunta esim. rakkulaeritteellä kontaminoituneiden vuodevaatteiden välityksellä on mahdollista. Klassinen taudinkuva muistuttaa isorokkoa, jossa alkuvaiheen yleisoireiden jälkeen ilmaantuu muutamassa päivässä rakkulainen ihottuma. Valtaosassa tapauksia oireet ovat lieviä tai kohtalaisia.

Tutkimusnimike 4608 viittaa kuntaliiton nimikkeistön mukaisesti Orthopoxviruksiin, mutta menetelmä on tarkoitettu ja epidemiologisen tilanteen mukaisesti validoitu ainoastaan apinarokkoviruksen osoittamiseen.

Indikaatiot

Apinarokko-epäily

Lähete/tutkimuksen tilaaminen

Sähköinen lähete, ja näytteen mukaan laitetaan lisäksi liite tai paperilähete (esim Fimlabin yleislähete https://fimlab.fi/wp-content/uploads/yleislahete_allman-remiss.pdf ), josta tulee ilmetä pyydetty tutkimus ja puhelinnumero, johon mahdollinen positiivinen vastaus soitetaan!


Hoitavien tahojen tulee soittaa apinarokkoepäilyissä ennen näytteenottoa Fimlabiin. 

FIMLAB:

Pirkanmaa: näytteiden vastaanottoon p. 03311 76536

Pohjanmaa: Fimlab Vaasan kliinisen mikrobiologian laboratorioon p. 06-213 2842

Keski-Suomi: Sairaala Novan ensiavun näytteenottaja p. 014-269 3193

Päijät-Häme: Kliininen mikrobiologia klo 7-20 p. 041-731 3778, Päivystysaikaan kemian päivystäjä klo 20-7 p. 044-719 5428

Kanta-Häme: päivystävä laboratoriohoitaja  p. 03-629 2016


Näyteastia

Copan UTM-putki

Näyte

  • Näyte otetaan ensisijaisesti rakkulaeritteestä/leesiosta. 

    • Selvästi altistuneella yleisoireilevalla, jolla ei vielä ole ihottumaa voidaan tutkimus ottaa myös nielunäytteenä, mutta negatiivinen nielunäyte ei poissulje infektiota.

  • Näytteenotossa on huomioitava paikalliset suojautumisohjeet ja muut käytännön ohjeet, kuten näytteenottotila ja tila, jossa pakkaaminen suoritetaan.

  • Ennen näytteenottoa näyteputkiin laitetaan pyyntötarrat. Näytteenottaja pukee asianmukaiset suojavarusteet (suojatakki, suojakäsineet, hengityssuojain FFP2/3, suojalasit tai visiiri).

  • Näyte otetaan steriilillä dacron– tai nailontikulla hankaamalla rikotun rakkulan pohjalta tai leesiosta viruskuljetusputkeen (UTM-putki). Tikku jätetään putkeen (tikun vartta katkaistaessa tulee olla tarkkana ettei näytettä roiskahda putkesta ulos). 

    • Sulje näyteputki napakasti.  

    • Pyyhi näyteputken pinta 2% Erisan Oxy:llä.

    • Aseta näyteputki puhtaaseen kertakäyttömaljaan tai suoraan Falcon-putkeen. 

    • Riisu muut suojaimet paitsi pään alueen suojaimet, desinfioi kädet. 

    • Näyte/näytteet pakataan alla olevan ohjeen mukaan paikalliseseti sovitussa tilassa

  • On suositeltavaa ottaa vähintään kaksi erillistä näytettä ja mikäli rakkuloita on useita niin näytteitä kannattaa ottaa useammasta rakkulasta

  • Infektiolääkärin paikallisen ohjeistuksen mukaan rakkulaeritteistä pyydetään myös erotusdiagnostisia testejä. Esim. VZVNhO (1781) ja HSVNhO (1860) sekä harkiten osalta myös enterovirusnäyte EVirNhO (4392). Jokaista pyyntöä varten otetaan oma näyte ja ne pakataan/lähetetään yhdessä -PoxNho -näytteen kanssa. Tarkempia ohjeita muiden näytteiden ottoon liittyen ohjekirjan ohjeessa ”Apinarokko; muut tutkimukset, näytteet ja näytteiden käsittely sekä lähetys”

Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely

Näytteiden pakkaus:

  • valitse lähetyspakkauksen (Pathopak) koko lähetettävän putkimäärän mukaan; 1 litran pakkaukseen mahtuu 4 Falcon-putkea, 2 litran pakkaukseen mahtuu 8 Falcon-putkea
  • avaa Pathopak kartonkipakkaus ja tyhjennä sen sisältö (muovinen kuljetuspurkki, varoitustarra ja sinetöintitarra) työtasolle
  • avaa muovinen kuljetuspurkki ja tyhjennä sen sisältö työtasolle (kuplamuovipussi ja imeytyshuopa 1 litran pakkauksessa, kuplamuovipussi, kuplamuovia ja imeytyshuopataskut 2 litran pakkauksessa)
  • ota tavanomaista kuplamuovia sekä selluvanua lähettyville
  1. Laita näyteputket Falcon-putkien sisään ja sulje ne napakasti.
    1. mikäli näyte analysoidaan paikallisessa (Tampere) laboratoriossa ilman lähetystä talon ulkopuolelle, suljetaan kuljetusputkessa (Falcon) olevat näytteet suuremman salpapussin sisään ja toimitetaan laboratorioon. Näin voidaan toimia myös mikäli varsinainen pakkaus suoritetaan muualla kuin näytteenottopaikalla. Huom. pusseihin on selvästi merkittävä ”Apinarokkoepäily” ja informoitava laboratorion työntekijää, jolle näyte viedään. Mikäli näytteet lähetetään eteenpäin, jatketaan pakkaamista alla olevan ohjeen mukaisesti.
  2. Avaa muovinen Pathopak -kuljetuspurkki.
  3. Laita imeytyshuopaa purkin pohjalle.
  4. Laita suljettava kuplamuovipussi Pathopak- kuljetuspurkin sisään.
  5. Kääri Falcon-kuljetusputket kuplamuoviin yksitellen.
  6. Laita kuplamuoviin käärityt Falcon-kuljetusputket Pathopak -kuljetuspurkkiin.
  7. Sulje kuplamuovipussi.
  8. Tiivistä Pathopak-kuljetuspurkki sellulla ja purkissa olevalla imeytyskankaalla kanteen asti.
  9. Sulje purkin kansi huolellisesti.
  10. Kirjoita kuljetuspurkin kylkeen permanent-tussilla, montako näyteputkea kuljetuspurkissa on (esimerkiksi 3 putkea) sekä teksti ”Apinarokkoepäily”.
  11. Laita Pathopak -kuljetuspurkki takaisin pahviseen kuljetuslaatikkoonsa.
  12. Sulje laatikko ja sinetöi laatikko sinetöintitarralla.
  13. Laita laatikon mukaan (ei laatikon sisään) paperinen liite/yleislähete, josta selviää mikä näyte pakkauksessa on (-PoxNho) ja kenelle mahdollisesta positiivisesta vastauksesta soitetaan.
  14. Näytteet lähetetään kategoria B-lähetyksenä, jolloin ulkolaatikossa on oltava näkyvillä merkintä UN3373 ja BIOLOGINEN MATERIAALI, KATEGORIA B. Lisäksi ulkolaatikon kylkeen merkintä ”Apinarokkoepäily.
  15. Kirjoita laatikon ”to/consignee” kenttään vastaanottajan (Fimlabin keskuslaboratorio, mikrobiologia) tiedot ja läheta normaalin reittikuljetuksen mukana Tampereelle.
  16. Näytteet tulisi säilyttää jääkaappilämpötilassa ja toimittaa tutkittavaan laboratorioon mieluiten kylmäkuljetuksena (+4°C). 
Pohjanmaa: Pakkaa näyteputket omiin falcon-putkiinsa ja laita falcon-putket salpapussiin, ja merkitse päälle selkeästi ”Apinarokkoepäily”. Toimita näytteet ja paperilähete Vaasan keskussairaalan laboratorioon (B2 Kliininen mikrobiologia, päivystysaikana B3 Kliinisen kemian kylmätiski). Informoi laboratorion työntekijää näytteistä. Kl. mikrobiologian laboratoriossa näytteet pakataan yllä olevan ohjeen mukaan ja lähetetään Tampereelle reittikuljetuksen mukana.

Pirkanmaa: Mikäli näytteet otetaan TAYS:ssa, näytteenottajat vievät näytepakkaukset Fimlabin näytteiden vastaanottoon 3krs:een, mistä huolehditaan näytteet mikrobiologialle. 

Menetelmä

Nukleiinihappo-osoitus (PCR)

Tulos valmiina

Tutkimusta tehdään arkipäivisin, joten tuloksen valmistuminen riippuu näytteenottoajankohdasta, n. 1-3 vrk.

Tulkinta

Positiivinen tulos Apinarokkoviruksen nukleiinihappo-osoituksessa on merkki infektiosta. 

Soitettavat hälyttävät tulokset

Positiiviset tulokset ilmoitetaan paperilähetteessä olevaan puhelinnumeroon.

Lisätiedot

Apinarokkoepäilyssä otettavien muiden tutkimusten osalta katso ohjekirjan ohje, Apinarokko; muut tutkimukset, näytteet ja näytteiden käsittely sekä lähetys