Tulosta

Tutkimus:
Apinarokkovirus (Orthopoxvirus), nukleiinihappo (kval)

Luokitus:
Mikrobiologia

Päivitetty:
12.10.2024

4608 • -PoxNhO

Tutkimusnumero ei ole käytössä. Kts kohta Lähete.

Johdanto

M-rokko (apinarokko) on Orthopoxvirusten sukuun kuuluvan apinarokkoviruksen (Monkeypox virus, MPXV) aiheuttama infektiotauti. Samaan sukuun kuuluvat muun muassa lehmärokkovirus ja isorokkoa aiheuttava variolavirus. M-rokkoa esiintyy pääasiassa Länsi- ja Keski-Afrikassa, jossa se leviää yleensä zoonoottisesti esim. jyrsijöiden välityksellä. Keväästä 2022 alkaen m-rokkoa on esiintynyt myös Afrikan ulkopuolella, etenkin Euroopassa ja Pohjois-Amerikassa, jossa tartunnat ovat pääosin liittyneet miesten väliseen seksiin ja aiheuttajana on ollut apinarokkoviruksen kehityslinja II. Vuoden 2024 aikana Kongon demokraattisessa tasavallassa ja sen naapurimaissa on todettu lisääntyviä määriä kehityslinja I:n (etenkin Ib) aiheuttamia tapauksia, joissa ihmisten väliset tartunnat ovat olleet merkittävässä roolissa, etenkin seksivälitteinen tartuntatapa. 

Apinarokkovirus tarttuu ensisijaisesti kosketustartuntana, mutta myös pisaratartunta tai tartunta esim. rakkulaeritteellä kontaminoituneiden vuodevaatteiden välityksellä on mahdollista. Klassinen taudinkuva muistuttaa isorokkoa, jossa alkuvaiheen yleisoireiden jälkeen ilmaantuu muutamassa päivässä rakkulainen ihottuma. Valtaosassa tapauksia oireet ovat lieviä tai kohtalaisia, mutta vakavat taudinkuvat ovat mahdollisia erityisesti immuunipuutteisilla henkilöillä. Myös taudin aiheuttanut viruksen kehityslinja vaikuttaa taudin vakavuuteen, siten, että kehityslinja II:n aiheuttamat infektiot ovat keskimäärin lievempiä kuin kehityslinja I:n aiheuttamat.

Tutkimusnimike 4608 viittaa kuntaliiton nimikkeistön mukaisesti Orthopoxviruksiin, mutta tutkimus on pääasiallisesti tarkoitettu ja epidemiologisen tilanteen mukaisesti validoitu apinarokkoviruksen osoittamiseen.

Indikaatiot

M-rokko (apinarokko) -epäily

Lähete/tutkimuksen tilaaminen

Tutkimus tehdään toistaiseksi HUSLAB:ssa. Huomioitava, että tutkimusta tilattaessa hoitoyksikön on aina jo ennen näytteenottoa otettava yhteys tutkivaan laboratorioon (HUSLAB, Virologia). Yhteydenotot virka-aikaan: p. 040 659 2117. Yhteydenotot virka-ajan ulkopuolella: Päivystävä laboratoriohoitaja p. 040 837 4010 tai 040 837 4011

Tutkimuspyyntö tehdään Huslabin paperisella virustutkimuslähetteellä https://huslab.fi/ohjekirjan_liitteet/lahetteet/laboratoriotutkimuslahetteet/virustutkimus.pdf , josta tulee ilmetä pyydetty tutkimus ja puhelinnumero, johon mahdollinen positiivinen vastaus soitetaan. Lisäksi näytteille tehdään sähköiset pyynnöt alla olevien hyvinvointialuekohtaisten lisäohjeistusten mukaan. 

  • Pirkanmaa: Laboratoriosta käsin jokaiselle näytteelle tehdään lisäksi -MikErik pyyntö. Mikäli näytepaketti on Fimlabiin tullessaan sinetöity, on paketin mukana oltava kopio paperilähetteestä mistä ilmenee potilaan tiedot ja pyydetyt tutkimukset, jotta MikErik-pyyntö voidaan tehdä. 
  • Pohjanmaa: Hoitoyksikkö tekee sähköisen paperilähetepyynnön 92200 -MikErik. Lähetteelle kirjataan haluttu tutkimus ja tekopaikka (4608 -PoxNhO, HUSLAB). Näyteputkeen liimataan 92200-pyyntötarra. 
  • Päijät-Häme: Hoitoyksikkö tekee -MikErik pyynnön. Pyynnön lisätietoihin kirjataan haluttu tutkimus ja tekopaikka (4608 -PoxNhO, HUSLAB).
  • Kanta-Häme: Laboratoriosta lähetetään Fimlabin Tampereen yksikköön normaalin reittikuljetuksen mukana kopio Huslabin paperilähetteestä ja siihen mukaan tieto, että halutaan -MikErik pyyntö.
  • Keski-Suomi: Hoitoyksikkö tekee -MikErik pyynnön. Pyynnön lisätietoihin kirjataan haluttu tutkimus ja tekopaikka (4608 -PoxNhO, HUSLAB).

Hoitavien tahojen tulee lisäksi soittaa m-rokko epäilyissä ennen näytteenottoa Fimlabiin. 

FIMLAB:

Pirkanmaa: näytteiden vastaanotto p. 03311 76536

Pohjanmaa: Vaasa, näytteiden vastaanotto ja postitus p. 041-731 2347. Pietarsaari, erottelu (näytteiden vastaanotto ja postitus) p. 041-730 8368 

Keski-Suomi: Sairaala Novan ensiavun näytteenottaja p. 014-269 3193

Päijät-Häme: Kliininen mikrobiologia klo 7-20 p. 041-731 3778, Päivystysaikaan kemian päivystäjä klo 20-7 p. 041 731 6292

Kanta-Häme: päivystävä laboratoriohoitaja  p. 041-732 0860.

Näytteet lähetetään HUSLAB:iin normaalin reittikujetuksen mukana, mutta lähetysvaiheessa myös laboratoriosta ollaan yhteydessä HUSLAB:iin (Yhteydenotot virka-aikaan: p. 040 659 2117. Yhteydenotot virka-ajan ulkopuolella: Päivystävä laboratoriohoitaja p. 040 837 4010 tai 040 837 4011).

Näyteastia

Copan UTM-putki (3 ml)

Näyte

  • Näyte otetaan ensisijaisesti rakkulaeritteestä/leesiosta. 

    • Selvästi altistuneella yleisoireilevalla, jolla ei vielä ole ihottumaa voidaan tutkimus ottaa myös nielunäytteenä, mutta negatiivinen nielunäyte ei poissulje infektiota.

    • Tarvittaessa myös plasmanäyte voidaan tutkia
  • Näytteenotossa on huomioitava paikalliset suojautumisohjeet ja muut käytännön ohjeet, kuten näytteenottotila ja tila, jossa pakkaaminen suoritetaan.

  • Ennen näytteenottoa näyteputkiin laitetaan pyyntötarrat. Näytteenottaja pukee asianmukaiset suojavarusteet (suojatakki, suojakäsineet, hengityssuojain FFP2/3, suojalasit tai visiiri).

  • Näyte otetaan steriilillä dacron– tai nailontikulla hankaamalla rikotun rakkulan pohjalta tai leesiosta viruskuljetusputkeen (3ml UTM-putki). Tikku jätetään putkeen (tikun vartta katkaistaessa tulee olla tarkkana ettei näytettä roiskahda putkesta ulos). 

    • Sulje näyteputki napakasti.  

    • Pyyhi näyteputken pinta 2% Erisan Oxy:llä.

    • Aseta näyteputki puhtaaseen kertakäyttömaljaan tai suoraan Falcon-putkeen. 

    • Riisu muut suojaimet paitsi pään alueen suojaimet, desinfioi kädet. 

    • Näyte/näytteet pakataan alla olevan ohjeen mukaan paikallisesti sovitussa tilassa

  • On suositeltavaa ottaa vähintään kaksi erillistä näytettä ja mikäli rakkuloita on useita niin näytteitä kannattaa ottaa useammasta rakkulasta

  • Infektiolääkärin paikallisen ohjeistuksen mukaan rakkulaeritteistä pyydetään myös erotusdiagnostisia testejä. Esim. VZVNhO (1781) ja HSVNhO (1860) sekä harkiten osalta myös enterovirusnäyte EVirNhO (4392). Jokaista pyyntöä varten otetaan oma näyte ja ne pakataan/lähetetään yhdessä -PoxNho -näytteen kanssa HUSLAB:iin. Tarkempia ohjeita muiden näytteiden ottoon liittyen ohjekirjan ohjeessa ”M-rokko (apinarokko); muut tutkimukset, näytteet ja näytteiden käsittely sekä lähetys”

Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely

Näytteiden pakkaus:

  • valitse lähetyspakkauksen (Pathopak) koko lähetettävän putkimäärän mukaan; 1 litran pakkaukseen mahtuu 4 Falcon-putkea, 2 litran pakkaukseen mahtuu 8 Falcon-putkea
  • avaa Pathopak kartonkipakkaus ja tyhjennä sen sisältö (muovinen kuljetuspurkki, varoitustarra ja sinetöintitarra) työtasolle
  • avaa muovinen kuljetuspurkki ja tyhjennä sen sisältö työtasolle (kuplamuovipussi ja imeytyshuopa 1 litran pakkauksessa, kuplamuovipussi ja imeytyshuopataskut 2 litran pakkauksessa)
  • ota tavanomaista kuplamuovia sekä selluvanua lähettyville
  1. Laita näyteputket Falcon-putkien sisään ja sulje ne napakasti.
    1. mikäli varsinainen pakkaus suoritetaan muualla kuin näytteenottopaikalla, suljetaan kuljetusputkessa (Falcon) olevat näytteet suuremman salpapussin sisään ja toimitetaan laboratorioon. Huom. pusseihin on selvästi merkittävä ”M-rokko (apinarokko)-epäily” ja informoitava laboratorion työntekijää, jolle näyte viedään. Pakkaamista jatketaan alla olevan ohjeen mukaisesti.
  2. Avaa muovinen Pathopak -kuljetuspurkki.
  3. Laita imeytyshuopaa purkin pohjalle.
  4. Laita suljettava kuplamuovipussi Pathopak- kuljetuspurkin sisään.
  5. Kääri Falcon-kuljetusputket kuplamuoviin yksitellen tai laita ne sellaisenaan kuljetuspurkin sisällä olevaan kuplamuovipussiin ja tiivistä sellulla.
  6. Sulje kuplamuovipussi.
  7. Tiivistä Pathopak-kuljetuspurkki sellulla ja purkissa olevalla imeytyskankaalla kanteen asti.
  8. Sulje purkin kansi huolellisesti.
  9. Kirjoita kuljetuspurkin kylkeen permanent-tussilla, montako näyteputkea kuljetuspurkissa on (esimerkiksi 3 putkea) sekä teksti ”Infektiohälytys -POX -epäily”.
  10. Laita Pathopak -kuljetuspurkki takaisin pahviseen kuljetuslaatikkoonsa.
  11. Laita laatikkoon paperilähete, huom. paperilähetteestä selvittävä kenelle mahdollinen positiivinen tulos soitetaan. Ennen lähetteen pakkaamista laatikkoon, ota lähetteestä kopio, joka toimitetaan pakkauksen mukana Fimlabiin (pakkauksen ulkopuolella).
  12. Sulje laatikko ja sinetöi laatikko sinetöintitarralla.
  13. Näytteet lähetetään Fimlabista kategoria B-lähetyksenä, jolloin ulkolaatikossa on oltava näkyvillä merkintä UN3373 ja BIOLOGINEN MATERIAALI, KATEGORIA B. Lisäksi ulkolaatikon kylkeen merkintä ”Infektiohälytys -POX -epäily.
  14. Kirjoita laatikon ”to/consignee” kenttään vastaanottajan (HUSLAB-talo, Kliinisen mikrobiologian näytteiden vastaanotto, Haartmaninkatu 1-3, 00290 Helsinki) tiedot ja läheta normaalin reittikuljetuksen mukana HUSLAbiin.
  15. Kirjoita ”from/consignor” kenttään Fimlabin paikallinen osoite
  16. Näytteet tulisi säilyttää jääkaappilämpötilassa ja toimittaa tutkittavaan laboratorioon mieluiten kylmäkuljetuksena (+4°C). 
Pohjanmaa: Vaasa: näytteet toimitetaan Vaasan keskussairaalaan kemian laboratorion kylmätiskiin (B3), Pietarsaari: näytteet toimitetaan Pietarsaaren laboratorioon.

Pirkanmaa: Mikäli näytteet otetaan TAYS:ssa, näytteenottajat vievät näytepakkaukset Fimlabin näytteiden vastaanottoon 3krs:een, josta huolehditaan näytteet Lähteviin-näytteisiiin. 

Menetelmä

Nukleiinihappo-osoitus (PCR)

Tekotiheys

Tutkimusta tehdään tarpeen mukaan noin 2 x viikossa.

Tulkinta

Positiivinen tulos Apinarokkoviruksen nukleiinihappo-osoituksessa on merkki infektiosta. 

Soitettavat hälyttävät tulokset

Positiiviset tulokset ilmoitetaan paperilähetteessä olevaan puhelinnumeroon.

Lisätiedot

M-rokko-epäilyssä otettavien muiden tutkimusten osalta katso ohjekirjan ohje, M-rokko (apinarokko); muut tutkimukset, näytteet ja näytteiden käsittely sekä lähetys