Johdanto
Menetelmä on ns. moniosoitustestipaneeli (multiplex), jolla voidaan osoittaa samanaikaisesti useita alempia hengitystieinfektioita aiheuttavia bakteereita ja viruksia sekä joidenkin bakteerien valikoituja resistenssiominaisuuksia.
Indikaatiot
Alempien hengitysteiden bakteeri- tai virusinfektioiden etiologian selvittäminen.
Lähete/tutkimuksen tilaaminen
ATK-pyyntö. Mikäli ATK-pyyntöä ei voida tehdä, tulee käyttää Fimlabin yleislähetettä.
Näyteastia
- tehdaspuhdas kierrekorkillinen koeputki tai purkki
- imuliman keruuputki
Näyte
- yskös
- imulima
- BAL-näyte
Näytemäärän minimi on 200 µl.
Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely
Näyte tulee toimittaa välittömästi laboratorioon.
Tarvittaessa näyte säilyy analysointikelpoisena jääkaapissa (2-8 °C) 24h.
Menetelmä
Menetelmä on ns. moniosoitustestipaneeli (multiplex), jolla voidaan osoittaa samanaikaisesti seuraavat alempien hengitysteiden infektioita aiheuttavat mikrobit sekä niiden valikoituja resistenssiominaisuuksia:
Bakteerit
- Acinetobacter calcoaceticus-baumannii complex
- Enterobacter cloacae complex
- Escherichia coli
- Haemophilus influenzae
- Klebsiella aerogenes
- Klebsiella oxytoca
- Klebsiella pneumoniae group
- Moraxella catarrhalis
- Proteus spp.
- Pseudomonas aeruginosa
- Serratia marcescens
- Staphylococcus aureus
- Streptococcus agalactiae
- Streptococcus pneumoniae
- Streptococcus pyogenes
- Chlamydia pneumoniae
- Legionella pneumophila
- Mycoplasma pneumoniae
Virukset
- Adenovirus
- Coronavirus (HKU1, NL63, 229E, OC43)
- Human metapneumovirus
- Human rhinovirus/enterovirus
- Influenza A -virus
- Influenza B -virus
- Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV)
- Parainfluenza virus (1-4)
- Respiratory syncytial virus (RSV)
- ESBL -resistenssi (CTX-M)
- karbapeneemiresistenssi (IMP, KPC, NDM, OXA-48-like, VIM)
- metisilliiniresistenssi (mecA/C ja MREJ)
Tulos valmiina
Tulos on valmiina saman tai seuraavan päivän aikana.
Tulkinta
Positiivinen tulos kertoo, että kyseisen bakteerin, viruksen tai bakteerien valikoitujen resistenssiominaisuuksien nukleiinihappoa on osoitettavissa näytteestä.
Positiivinen tulos FilmArray® Pneumonia Panel plus:lla ei suoraan merkitse, että potilaalla on pneumonia ja tulisi aloittaa antibioottihoito, koska monet mikrobit voivat kolonisoida hengitysteitä aiheuttamatta infektiota.
Tämän vuoksi tuloksen kliinistä merkitystä on arvioitava suhteessa potilaan kliinisiin oireisiin. Lisäksi vastauksessa ilmoitetaan bakteerilöydöksen perässä (+) -merkeillä semikvantitatiivisesti nukleiinihapon genominen kopioluku per millilitra (copies/mL) eli ns. BIN-luku seuraavasti 104 (+), 105 (++), 106 (+++), or ≥107 (++++).
BIN-luku ja (+) -merkit antavat semikvantitatiivisesti arvion bakteerin nukleiinihapon määrästä näytteessä (se ei vastaa kvantitatiivisessä viljelyssä saatua määrää).
Konsultoi tarvittaessa infektiolääkäriä.
|
Osatutkimus |
Osatutkimus sisältää |
|
| Virus | ||
| -AdenNhO | Adenovirus | |
| -KorNhO | Coronavirus (229E, OC43, HKU1, NL63) | |
| -hMPVNhO | Human metapneumovirus | |
| -PicoNhO | Human rhinovirus/enterovirus | |
| -InfANhO | Influenza A -virus | |
| -InfBNhO | Influenza B -virus | |
| -MERS-CoV | Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) | |
| -PinfNhO | Parainfluenza virus (1-4) | |
| -RSVNhO | Respiratory syncytial virus | |
| Bakteeri | ||
| -AcbaNhO | Acinetobacter calcoaceticus-baumannii complex | |
| -EnccNhO | Enterobacter cloacae complex | |
| -EscoNhO | Escherichia coli | |
| -HainNhO | Haemophilus influenzae | |
| -KlaeNhO | Klebsiella aerogenes | |
| -KloxNhO | Klebsiella oxytoca | |
| -KlpnNhO | Klebsiella pneumoniae group | |
| -MocaNhO | Moraxella catarrhalis | |
| -ProtNhO | Proteus spp. | |
| -PsaeNhO | Pseudomonas aeruginosa | |
| -SemaNhO | Serratia marcescens | |
| -StauNhO | Staphylococcus aureus | |
| -StrBNhO | Streptococcus agalactiae | |
| -StrpNhO | Streptococcus pneumoniae | |
| -StrANhO | Streptococcus pyogenes | |
| -ChpnNhO | Chlamydophila pneumoniae | |
| -LepnNhO | Legionella pneumophila | |
| -MypnNhO | Mycoplasma pneumoniae | |
| Resitenssiominaisuus | CTX-M -ESBL resistenssi | |
| IMP -karbapeneemiresistenssi | ||
| KPC -karbapeneemiresistenssi | ||
| mecA/C ja MREJ -metisilliiniresistenssi | ||
| NDM -karbapeneemiresistenssi | ||
| OXA-48-like -karbapeneemiresistenssi | ||
| VIM -karbapeneemiresistenssi |
Virhelähteet
Negatiivinen tulos ei poissulje bakteeri- tai virusinfektiota
- näytteessä voi olla jokin testiä inhiboiva tekijä
- näytettä on esikäsitelty aineella, joka inhiboi testiä
- infektiota aiheuttavan mikrobikannan kohdegeeni poikkeaa paneelissa olevasta
- infektion aiheuttaa mikrobi, joka ei ole ollenkaan mukana paneelissa
- potilaan lääkehoito aloitettu ennen näytteenottoa, jolloin infektion aiheuttajaa ei pystytä varmuudella osoittamaan
- mikrobimäärä näytteessä on liian alhainen