Tulosta

Tutkimus:
RESPIRATORISET MIKROBIT, NUKLEIINIHAPPO (kval)

Luokitus:
Mikrobiologia

Päivitetty:
26.3.2024

23077 • -RMikNhO

Johdanto

Menetelmät eri toimipisteissä ovat ns. moniosoitustestipaneeleita (multiplex), joilla voidaan osoittaa samanaikaisesti seuraavat hengitystieinfektioita aiheuttavat mikrobit. 

Huomioi eri toimipisteiden erilaiset mikrobipaneelit.

Kanta-Häme ja Pohjanmaa:

Virukset: Influenssa A (H1N1/2009, H1 ja H3) -virus, Influenssa B -virus, Koronavirus (229E, HKU1, NL63 ja OC43), Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), Parainfluenssavirus (1-4), Respiratory Syncytial -virus (RSV) A/B, Ihmisen metapneumovirus, Adenovirus, Bokavirus, Rinovirus/Enterovirus

Bakteerit: Mycoplasma pneumoniaeLegionella pneumophila, Bordetella pertussis ja Chlamydia pneumoniae

Päijät-Häme ja Keski-Suomi: 

Virukset: Influenssa A (H1N1/2009, H1 ja H3) -virus, Influenssa B -virus, Koronavirus (229E, HKU1, NL63 ja OC43), Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV), Parainfluenssavirus (1-4), Respiratory Syncytial -virus (RSV) A/B, Ihmisen metapneumovirus, Adenovirus, Rinovirus/Enterovirus

Bakteerit: Mycoplasma pneumoniaeChlamydia pneumoniaeBordetella pertussis ja Bordetella parapertussis

Indikaatiot

Hengitysteiden bakteeri- tai virusinfektioiden etiologian selvittäminen.

Lähete/tutkimuksen tilaaminen

ATK-pyyntö. Mikäli ATK-pyyntöä ei voida tehdä, tulee käyttää Fimlabin yleislähetettä.

Näyteastia

  • Ensisijainen näyteastia: COPAN UTM-RT MINI -kuljetusputki 3ml (353C, kirkkaanpunainen korkki, punertava liuos) ja erillinen taipuisavartinen nukkatikku. 
Mikäli ensisijaista näyteastiaa ei ole saatavilla, voidaan näyte tarvittaessa ottaa seuraaviin näyteastioihin
  • Vacuette 2ml Virus stabilization tube ref. 456162 sekä taipuisavartinen nukkatikku.
  • COPAN ESwab-kuljetusputkikitti: 482CE, sininen korkki, kirkas liuos ja taipuisavartinen COPAN-nukkatikku.
HUOM! Cobas PCR Media putki ei sovellu tälle tutkimukselle
  • Imulima- ja BAL-näyte: omat kierrekorkilliset tehdaspuhtaat näyteastiat

Näyte

Päijät-Häme, Kanta-Häme, Keski-Suomi ja Pohjanmaa:

Nenänielunäyte

Näyte otetaan syvältä nenänielusta taipuisavartisella steriilillä nukkatikulla (Copan FLOQswabs). Näytteeksi kerätään limakalvon soluja kiertämällä tikkua nenänielussa. Näytteenoton jälkeen tikku katkaistaan putkeen.

Imulima tai BAL (näytelaatua ei ole validoitu tutkimusmenetelmille, joten negativiinen tulos ei ole täysin luotettava)

Näytteeksi voidaan ottaa myös esim. imulimaa tai BAL-nestettä. Imuun kytketyn limanäyteputken letku työnnetään nenän kautta nenänieluun ja näyteputkeen imetään limaa molemmista sieraimista. Tarvittaessa sieraimia voidaan kostuttaa 1 ml keittosuolaa ennen näytteenottoa. Imulimanäyte (1-2 ml) lähetetään sellaisenaan limankeruupurkissa (imuletku irroitetaan purkista ja purkki suljetaan huolellisesti osastolla). BAL-näytettä otetaan n. 2-3 ml tehdaspuhtaaseen, kierrekorkilliseen koeputkeen/tehdaspuhtaaseen purkkiin.

Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely

Näytteenoton jälkeen varmistetaan, että näyteputken korkki on tiiviisti suljettu ja että näyteputkessa on näytetarra. Tämän jälkeen näyteputki laitetaan sekundaariastiaan esim. 50ml Falcon-putkeen tai salpa-pussiin (minigrip tms.).

Näyte säilyy analysointikelpoisena

  • huoneenlämmössä (15-25 °C) 4h
  • jääkaapissa (2-8 °C) 72h
  • pakkasessa (≤-15 °C or ≤-70°C) 1kk

Menetelmä

Menetelmät eri toimipisteissä ovat ns. moniosoitustestipaneeleita (multiplex), jolla voidaan osoittaa samanaikaisesti seuraavia hengitystieinfektioita aiheuttavia mikrobeja: 

Bakteerit

  • Bordetella parapertussis (vain Päijät-Häme ja Keski-Suomi)
  • Bordetella pertussis
  • Chlamydia pneumoniae
  • Legionella pneumophila (vain Kanta-Häme ja Pohjanmaa)
  • Mycoplasma pneumoniae

Virukset

  • Adenovirus
  • Bokavirus (vain Kanta-Häme ja Pohjanmaa)
  • Koronavirus (229E, HKU1, NL63 ja OC43)
  • Ihmisen metapneumovirus
  • Rinovirus/Enterovirus
  • Influenssa A (H1N1/2009, H1 ja H3)
  • Influenssa B
  • MERS-CoV (vain Päijät-Häme ja Keski-Suomi)
  • Parainfluenssavirus (1-4)
  • Respiratory Syncytial virus (RSV) A/B
  • SARS-CoV-2

Tulos valmiina

Tulos on valmiina saman tai seuraavan päivän aikana.

Tulkinta

Positiivinen tulos kertoo, että kyseisen bakteerin tai viruksen nukleiinihappoa on osoitettavissa näytteestä. 

 

OSATUTKIMUS

OSATUTKIMUS SISÄLTÄÄ SEURAAVAT MIKROBIT

Virukset    
  -AdenNhO Adenovirus
  -BokaNhO Bokavirus
  -KoroNhO Koronavirus HKU1  
    Koronavirus NL63
    Koronavirus 229E
    Koronavirus OC43
  -MERS-CoV Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV)
  -CV19NhO Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
  -hMPVNhO Ihmisen metapneumovirus
  -PicoNhO Rinovirus/enterovirus
  -InfANhO Influenssa A (A/H1, A/H3,  A/H1-2009) -virus
  -InfBNhO Influenssa B -virus
  -PinfNhO Parainfluenssavirus 1
    Parainfluenssavirus 2
    Parainfluenssavirus 3
    Parainfluenssavirus 4
  -RSVNhO Respiratory Syncytial Virus (RSV)
Bakteerit    
  -BoppNhO Bordetella  parapertussis
  -BopeNhO Bordetella pertussis
  -ChpnNhO Chlamydia pneumoniae
  -LepnNhO Legionella pneumophila
  -MypnNhO Mycoplasma pneumoniae

 

Virhelähteet

Tuloksen kliinistä merkitystä pitää aina arvioidan potilaan kliinisten tietojen kanssa.

Negatiivinen tulos ei myöskään poissulje bakteeri- tai virusinfektiota

  • näytteessä voi olla jokin testiä inhiboiva tekijä
  • näyte on otettu, säilytetty tai kuljetettu väärin
  • infektiota aiheuttavan mikrobikannan kohdegeeni poikkeaa paneelissa olevasta
  • infektion aiheuttaa mikrobi, joka ei ole ollenkaan mukana paneelissa 
  • potilaan lääkehoito on aloitettu ennen näytteenottoa, jolloin infektion aiheuttajaa ei pystytä varmuudella osoittamaan
  • mikrobimäärä näytteessä on liian alhainen