Johdanto

Menetelmät eri toimipisteissä ovat ns. moniosoitustestipaneeleita (multiplex), joilla voidaan osoittaa samanaikaisesti seuraavat hengitystieinfektioita aiheuttavat mikrobit. 

Huomioi eri toimipisteiden erilaiset mikrobipaneelit.

Kanta-Häme ja Pohjanmaa:

Virukset: Influenza A (H1N1/2009, H1 ja H3), influenssa B, coronavirus (229E, HKU1, NL63 ja OC43), SARS-CoV-2, parainfluenzavirus (1-4), Respiratory Syncytial Virus (RSV) A/B, humaani Metapneumovirus A/B, Adenovirus, Bocavirus, Rhinovirus/Enterovirus

Bakteerit: Mycoplasma pneumoniae, Legionella pneumophila ja Bordetella pertussis

Päijät-Häme: 

Virukset: Influenza A (H1N1/2009, H1 ja H3), influenssa B, coronavirus (229E, HKU1, NL63 ja OC43), SARS-CoV-2, parainfluenzavirus (1-4), Respiratory Syncytial Virus (RSV) A/B, Human Metapneumovirus, Adenovirus, Human Rhinovirus/Enterovirus

Bakteerit: Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Bordetella pertussis ja Bordetella parapertussis

Indikaatiot

Hengitysteiden bakteeri- tai virusinfektioiden etiologian selvittäminen.

Lähete/tutkimuksen tilaaminen

ATK-pyyntö. Mikäli ATK-pyyntöä ei voida tehdä, tulee käyttää Fimlabin yleislähetettä.

Näyteastia

Kanta-Häme, Pohjanmaa ja Päijät-Häme:  

• Ensisijainen näyteastia: COPAN UTM-RT MINI -kuljetusputki 3ml (353C, kirkkaanpunainen korkki, punertava liuos) ja erillinen taipuisavartinen nukkatikku tai jäykkävartinen nukkatikku. 

• Vacuette 2ml Virus stabilization tube ref. 456162 sekä taipuisa- tai jäykkävartinen nukkatikku.
• COPAN ESwab-kuljetusputkikitti: 482CE, sininen korkki, kirkas liuos ja taipuisavartinen COPAN-nukkatikku.
• COPAN ESwab-kuljetusputkikitti: 490CE, vaaleanpunainen korkki, kirkas liuos ja jäykkävartinen COPAN-nukkatikku.

Näyte

Nenänielunäyte

Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely

Näyte tulee toimittaa välittömästi laboratorioon. 

Tarvittaessa näyte säilyy analysointikelpoisena

• huoneenlämmössä (15-25 °C) 4h
• jääkaapissa (2-8 °C) 72h
• pakkasessa (≤-15 °C or ≤-70°C) 1kk

Menetelmä

Menetelmät eri toimipisteissä ovat ns. moniosoitustestipaneeleita (multiplex), jolla voidaan osoittaa samanaikaisesti seuraavia hengitystieinfektioita aiheuttavia mikrobeja: 

Bakteerit

• Bordetella parapertussis (vain Päijät-Häme)
• Bordetella pertussis
• Chlamydia pneumoniae (vain Päijät-Häme)
• Legionella pneumophila (vain Kanta-Häme ja Pohjanmaa)
• Mycoplasma pneumoniae

Virukset

• Adenovirus
• Bocavirus (vain Kanta-Häme ja Pohjanmaa)
• Coronavirus (229E, HKU1, NL63 ja OC43)
• Human Metapneumovirus
• Human Rhinovirus/Enterovirus
• Influenza A (H1N1/2009, H1 ja H3)
• Influenza B
• MERS-CoV (vain Päijät-Häme)
• Parainfluenzavirus (1-4)
• Respiratory Syncytial Virus (RSV) A/B
• SARS-CoV-2

Tulos valmiina

Tulos on valmiina saman tai seuraavan päivän aikana.

Tulkinta

Positiivinen tulos kertoo, että kyseisen bakteerin tai viruksen nukleiinihappoa on osoitettavissa näytteestä. 

Virhelähteet

Tuloksen kliinistä merkitystä pitää aina arvioidan potilaan kliinisten tietojen kanssa.

Negatiivinen tulos ei myöskään poissulje bakteeri- tai virusinfektiota

• näytteessä voi olla jokin testiä inhiboiva tekijä
• näyte on otettu, säilytetty tai kuljetettu väärin
• infektiota aiheuttavan mikrobikannan kohdegeeni poikkeaa paneelissa olevasta
• infektion aiheuttaa mikrobi, joka ei ole ollenkaan mukana paneelissa 
• potilaan lääkehoito on aloitettu ennen näytteenottoa, jolloin infektion aiheuttajaa ei pystytä varmuudella osoittamaan
• mikrobimäärä näytteessä on liian alhainen