Johdanto

Tutkimuksen menetelmät eri toimipisteissä ovat ns. moniosoitustestipaneeleita (multiplex), joilla voidaan osoittaa samanaikaisesti seuraavat hengitystieinfektioita aiheuttavat mikrobit. 

Huomioi eri toimipisteiden erilaiset mikrobipaneelit.

Kanta-Häme, Pohjanmaa ja Pirkanmaa:

Virukset: Influenssa A (H1N1/2009, H1 ja H3) -virus, Influenssa B -virus, Koronavirus (229E, HKU1, NL63 ja OC43), Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), Parainfluenssavirus (1-4), Respiratory Syncytial -virus (RSV) A/B, Ihmisen metapneumovirus, Adenovirus, Bokavirus, Rinovirus/Enterovirus

Bakteerit: Mycoplasma pneumoniae, Legionella pneumophila, Bordetella pertussis ja Chlamydia pneumoniae

Päijät-Häme ja Keski-Suomi: 

Virukset: Influenssa A (H1N1/2009, H1 ja H3) -virus, Influenssa B -virus, Koronavirus (229E, HKU1, NL63 ja OC43), Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV), Parainfluenssavirus (1-4), Respiratory Syncytial -virus (RSV) A/B, Ihmisen metapneumovirus, Adenovirus, Rinovirus/Enterovirus

Bakteerit: Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Bordetella pertussis ja Bordetella parapertussis

Indikaatiot

Hengitysteiden bakteeri- tai virusinfektioiden etiologian selvittäminen kiireellisissä tapauksissa. Huom. ensisijaisesti hengitystie-infektioiden diagnosoimiseen käytetään tutkimuksia 20956 -RVirNhO ja 9877 -RBaktNhO, joita tehdään laboratoriossa arkipäivisin ja joiden vastaus on valmiina pääsääntöisesti näytteen Tampereen keskuslaboratorioon saapumista seuraavana arkipäivänä. 

Lähete/tutkimuksen tilaaminen

ATK-pyyntö. Mikäli ATK-pyyntöä ei voida tehdä, tulee käyttää Fimlabin yleislähetettä.

Näyteastia

• Nenänielunäyte: COPAN UTM-RT MINI -kuljetusputki 3ml (353C, kirkkaanpunainen korkki, punertava liuos) ja erillinen taipuisavartinen nukkatikku.

Näyte

Nenänielunäyte

Näyte otetaan syvältä nenänielusta taipuisavartisella steriilillä nukkatikulla (Copan FLOQswabs). Näytteeksi kerätään limakalvon soluja kiertämällä tikkua nenänielussa. Näytteenoton jälkeen tikku katkaistaan putkeen.

Imulima tai BAL (näytelaatua ei ole validoitu tutkimusmenetelmälle, joten negativiinen tulos ei ole täysin luotettava)

Näytteeksi voidaan ottaa myös esim. imulimaa tai BAL-nestettä. Imuun kytketyn limanäyteputken letku työnnetään nenän kautta nenänieluun ja näyteputkeen imetään limaa molemmista sieraimista. Tarvittaessa sieraimia voidaan kostuttaa 1 ml keittosuolaa ennen näytteenottoa. Imulimanäyte (1-2 ml) lähetetään sellaisenaan limankeruupurkissa (imuletku irroitetaan purkista ja purkki suljetaan huolellisesti osastolla). BAL-näytettä otetaan n. 2-3 ml tehdaspuhtaaseen, kierrekorkilliseen koeputkeen/tehdaspuhtaaseen purkkiin.

 

HUOM! Näyte otetaan hoitavan tahon tai hoitoyksikön toimesta. Näytettä EI oteta Fimlabin näytteenotossa lukuun ottamatta ajanvarauksella toimivia Fimlabin infektionäytteenottopisteitä (Hatanpää, Jyväskylän näytteenottokeskus, Karstula, Kinnula, Pihtipudas, Saarijärvi, Viitasaari). Ajanvarauksen tekee hoitoyksikkö.

Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely

Näytteenoton jälkeen varmistetaan, että näyteputken korkki on tiiviisti suljettu ja että näyteputkessa on näytetarra. Tämän jälkeen näyteputki laitetaan sekundaariastiaan esim. 50ml Falcon-putkeen tai salpa-pussiin (minigrip tms.).

Näyte säilyy analysointikelpoisena

• huoneenlämmössä (15-25 °C) 4h
• jääkaapissa (2-8 °C) 72h
• pakkasessa (≤-15 °C or ≤-70°C) 1kk

Menetelmä

Menetelmät eri toimipisteissä ovat ns. moniosoitustestipaneeleita (multiplex), jolla voidaan osoittaa samanaikaisesti seuraavia hengitystieinfektioita aiheuttavia mikrobeja: 

Bakteerit

• Bordetella parapertussis (vain Päijät-Häme ja Keski-Suomi)
• Bordetella pertussis
• Chlamydia pneumoniae
• Legionella pneumophila (vain Kanta-Häme, Pohjanmaa ja Pirkanmaa)
• Mycoplasma pneumoniae

Virukset

• Adenovirus
• Bokavirus (vain Kanta-Häme, Pohjanmaa ja Pirkanmaa)
• Koronavirus (229E, HKU1, NL63 ja OC43)
• Ihmisen metapneumovirus
• Rinovirus/Enterovirus
• Influenssa A (H1N1/2009, H1 ja H3)
• Influenssa B
• MERS-CoV (vain Päijät-Häme ja Keski-Suomi)
• Parainfluenssavirus (1-4)
• Respiratory Syncytial virus (RSV) A/B
• SARS-CoV-2

Tekotiheys

Päivittäin

Tulos valmiina

Tulos on valmiina saman tai seuraavan päivän aikana.

Tulkinta

Positiivinen tulos kertoo, että kyseisen bakteerin tai viruksen nukleiinihappoa on osoitettavissa näytteestä. 

	OSATUTKIMUS	OSATUTKIMUS SISÄLTÄÄ SEURAAVAT MIKROBIT
Virukset
	-AdenNhO	Adenovirus
	-BokaNhO	Bokavirus
	-KoroNhO	Koronavirus HKU1
		Koronavirus NL63
		Koronavirus 229E
		Koronavirus OC43
	-MERS-CoV	Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV)
	-CV19NhO	Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
	-hMPVNhO	Ihmisen metapneumovirus
	-PicoNhO	Rinovirus/enterovirus
	-InfANhO	Influenssa A (A/H1, A/H3,  A/H1-2009) -virus
	-InfBNhO	Influenssa B -virus
	-PinfNhO	Parainfluenssavirus 1
		Parainfluenssavirus 2
		Parainfluenssavirus 3
		Parainfluenssavirus 4
	-RSVNhO	Respiratory Syncytial Virus (RSV)
Bakteerit
	-BoppNhO	Bordetella  parapertussis
	-BopeNhO	Bordetella pertussis
	-ChpnNhO	Chlamydia pneumoniae
	-LepnNhO	Legionella pneumophila
	-MypnNhO	Mycoplasma pneumoniae

 

Virhelähteet

Tuloksen kliinistä merkitystä pitää aina arvioida potilaan kliinisten tietojen kanssa.

Negatiivinen tulos ei myöskään poissulje bakteeri- tai virusinfektiota

• näytteessä voi olla jokin testiä inhiboiva tekijä
• näyte on otettu, säilytetty tai kuljetettu väärin
• infektiota aiheuttavan mikrobikannan kohdegeeni poikkeaa paneelissa olevasta
• infektion aiheuttaa mikrobi, joka ei ole ollenkaan mukana paneelissa 
• potilaan lääkehoito on aloitettu ennen näytteenottoa, jolloin infektion aiheuttajaa ei pystytä varmuudella osoittamaan
• mikrobimäärä näytteessä on liian alhainen