Tampereen koronanäytteenottopisteet auki myös pääsiäispyhinä
1.4.2021
Fimlabin koronanäytteenotto Tampereen Messu- ja Urheilukeskuksen E-hallissa sekä Hatanpäällä ja Taysissa palvelevat myös pääsiäispyhien ajan. 2.–5.4. välisenä aikana toimipisteet ovat auki seuraavasti: Messukeskus klo 10–18, Hatanpää klo 9–17 ja Tays klo 10–18.
Huomaathan, että koronanäytteenottoon tulo vaatii aina lähetteen ja ajanvarauksen.
Koronatestauksen tuotantovarmuus on hyvä
Fimlabin koronatestauksen tuotantovarmuus on hyvällä tasolla. Tutkimuslaitteistoa on jatkuvasti vahvistettu ja myös tarvikkeiden globaali saatavuus on tällä hetkellä hyvä. Nykyisellä laitteistolla on mahdollista tutkia noin 5000 koronanäytettä vuorokaudessa. Viime aikoina tutkimusmäärät ovat pyörineet 3000–4000 näytteen päivätasolla. Valtaosa testituloksista vastataan vuorokauden sisällä näytteenotosta.
Koronavirusten tarkempi tunnistaminen sekvensoinnilla on jatkunut Fimlabissa kuukauden päivät. Tällä hetkellä sekvensointiin päätyy 20–60 näytettä viikossa. Koko virusgenomin sekvensoinnilla näytteistä tunnistetaan paitsi yleisimmät maailmalla leviävät variantit myös mahdolliset uudet muunnokset.
Päijät-Häme: Yhtäaikaista asiakasmäärää rajoitetaan Fimlab Aleksanterin odotustiloissa 8.3. alkaen
2.3.2021
Aluehallintoviranomaisten päätökseen perustuen joudumme rajoittamaan samanaikaisesti asioivien asiakkaiden määrää Lahdessa näytteenottokeskus Fimlab Aleksanterissa maanantaista 8.3. alkaen.
Tästä johtuen varatut ajat eivät välttämättä pidä paikkaansa. Asiakkaita suositellaan saapumaan näytteenottoon juuri ennen varattua aikaa.
Toimi näin Fimlab Aleksanterissa 8.3. alkaen
- Saavu laboratoriolle juuri ennen sinulle varattua aikaa. Käytäthän suu-nenäsuojusta.
- Pidä riittävä turvaväli muihin asiakkaisiin sekä ulkona että laboratorion sisätiloissa.
- Odota rauhassa, että vartija päästää sinut sisälle laboratorioon. Varatut ajat eivät välttämättä pidä paikkaansa. Kaikki asiakkaat palvellaan.
- Ilmoittaudu itseilmoittautumisautomaatilla sisään tullessasi. Jos asioit Nopsa-pikapalvelussa, sinun ei tarvitse ilmoittautua, vaan voit siirtyä suoraan Nopsa-pisteelle.
- Hoitaja kutsuu sinut sisään näytteenottohuoneeseen.
- Vältä turhaa oleskelua laboratoriossa näytteenoton jälkeen.
Koronavirusmuunnosten sekvensointi aloitettu Fimlabissa
1.3.2021
Fimlabin Tampereen keskuslaboratoriossa on käynnistetty koronavirusmuunnosten tunnistaminen sekvensoinnilla. Sekvensointia käytetään virusvarianttien seurantaan nopeasti kehittyvässä pandemiassa. Mutaatioita seuraamalla voidaan tarkimmillaan selvittää yksittäisten tartuntaketjujen kulkua.
Sekvensointi on pystytetty tiiviissä yhteistyössä mikrobiologian ja genetiikan erikoisalojen sekä Tampereen yliopiston kanssa. Genetiikan laboratoriolla vakiintuneessa käytössä olleet menetelmät ja kokemus sekvensoinnista osana muun muassa syöpädiagnostiikkaa ovat edesauttaneet menetelmän käyttöönottoa myös virusvarianttien tunnistamiseen.
Sekvensoinnin tavoite on epidemiologinen seuranta
Koronaviruksen osoitus potilasnäytteistä perustuu PCR-testaukseen, jossa tutkitaan yhtä tai muutamaa ennalta määritettyä sekvenssipätkää kerrallaan. Tämän vuoksi menetelmä sopii hyvin viruksen osoittamiseen suurista näytemääristä.
Sekvensoinnin merkitys osana koronadiagnostiikkaa heräsi tarpeesta seurata maailmalla leviämään lähteneiden virusvarianttien kulkua. Nyt on selvää, että variantit leviävät vauhdilla, ja brittivariantista on tulossa uusi valtavirus myös Suomessa.
– Elämme murrosvaihetta sen suhteen, millainen testausstrategia virusvarianttien sekvensointiin tullaan linjaamaan. Resurssien turvaamisen näkökulmasta on tärkeää, ettei lähdetä ylimitoitettuun sekvensointiin. Tarvitsemme systemaattista sekvensointia tietääksemme, minkälaisia viruskantoja Suomessa on liikkeellä. Näin voimme varmistaa myös PCR-diagnostiikan toimivuuden, toteaa mikrobiologian erikoisalajohtaja, ylilääkäri Tapio Seiskari.
– Vallitsevassa tilanteessa on tarkoituksenmukaista pysytellä nimenomaan epidemiologisen tilannekuvan rakentamisen tasolla, koska tällä on merkitystä arvioitaessa esimerkiksi rokotteiden tehoa kiertäviin viruskantoihin, lisää mikrobiologian erikoislääkäri Minna Paloniemi.
Sekvensointimenetelmiin kohdistuvat vaatimukset kasvavat, kun genomia määritetään tarkemmin, eikä vain seurata tiettyjen, yksittäisten varianttien leviämistä.
– Yhden sekvenssinäyte-erän kattava analysointi koko virusgenomin osalta on vaativaa ja kestää kaikkine vaiheineen useamman päivän. Siksi sekvensointi ei varsinaisesti palvele taudin diagnostiikkaa, vaan enemmänkin juuri epidemian seurantaa, sanoo genetiikan erikoisalajohtaja Mauri Keinänen.
Koronaviruksen testauskapasiteetti kasvaa jatkuvasti
4.9.2020
• Tiedote päivitetty: 7.9.2020
Elokuun lopulla annettu valtakunnallinen koronatestausstrategia nostaa testauksen määrää koskevan tavoitteen 20 000 näytteeseen vuorokaudessa. Tavoitteena on, että testeihin pääsee vuorokaudessa ja että testitulos on käytettävissä vuorokauden kuluessa näytteenotosta. Fimlabin tavoitteena on saavuttaa tarvittava testauskapasiteetti syys–lokakuun aikana.
Suurin osa Kanta-Hämeen, Keski-Suomen, Pirkanmaan ja Vaasan sairaanhoitopiirien sekä Päijät-Hämeen hyvinvointikuntayhtymän alueiden koronanäytteistä analysoidaan Fimlabin keskuslaboratoriossa Tampereella. Näytemäärä on kasvanut elokuussa nopeasti yli 2 000 näytteeseen vuorokaudessa.
– Elokuun aikana näytemäärän kasvu on ollut eksponentiaalista, minkä johdosta vastausviive on ajoittain ollut yli neljä vuorokautta. Eri puolilla tapahtunut testausjonojen purkaminen on tuottanut niin suuria näyte-eriä, että niistä on muodostunut ruuhkia. PCR-testaus suuren kapasiteetin laitteilla kestää jopa yhdeksän tuntia, eikä koneaikaa ole mahdollista lyhentää. Lisäksi tähän on laskettava päälle aikaa vievä näytekäsittely, toteaa mikrobiologian erikoisalajohtaja Tapio Seiskari.
Haasteita testauskapasiteetin nostamiselle on aiheuttanut myös testauksessa tarvittavien reagensseihin ja kulutustarvikkeisiin kohdistuva massiivinen globaali kysyntä.
– Tarvikkeita allokoidaan nyt globaalisti maiden todellisen tarpeen mukaan. Suomen tilanteen ollessa vielä rauhallinen, emme ole ensimmäisten joukossa toimituslistalla, Seiskari sanoo.
Uudet laitehankinnat kaksinkertaistavat testauskapasiteetin
Fimlab pyrkii nostamaan koronatestauskapasiteettiaan syksyn aikana, ja onkin jo keväällä tilannetta ennakoiden tehnyt kaksi uutta laitehankintaa analytiikkalinjastoansa täydentämään. Nämä laitteet mahdollistavat kapasiteetin kaksinkertaistamisen.
– Nämä syksyllä saapuvat täydentävät laitetoimitukset lisäävät toimintavarmuutta ja nopeuttavat tulosten saamista. Tavoitteena on vastauksen tuottaminen 1–2 vuorokaudessa, kertoo Seiskari.
Kasvavat näytemäärät edellyttävät myös työvuorojen ja henkilöstön lisäämistä ja perehdyttämistä. Fimlabiin onkin syksyn mittaan tulossa lisälaitteiston lisäksi lisää henkilökuntaa, joka osaltaan auttaa tavoitteen saavuttamisessa.
Lue: Fimlab selätti koronatestauksen viiveet
Uusia toimintamalleja koronanäytteenottoon
Testauskapasiteetin kasvattaminen ei yksin riitä vastaamaan haasteeseen, sillä ongelmaksi on monilla alueilla muodostunut näytteenottoruuhkat. Fimlab ottaa vain osan toiminta-alueensa näytteistä. Pirkanmaalla tämä on noin puolet kaikista julkisen puolen koronanäytteenotoista. Muilla alueilla pääosin hoitoyksiköt ottavat näytteet itse.
Pirkanmaalla toimivat drive-in-näytteenottopisteet ovat osoittautuneet erittäin tehokkaiksi ja nopeiksi toimintamalleiksi. Niiden avulla on jo nyt saatu purettua ruuhkia, ja testiin pääsee päivässä.
– Elokuun lopussa avatussa Tampereen Messu- ja Urheilukeskuksen drive-in-testauspisteessä pystytään ottamaan tällä hetkellä noin tuhat testiä päivässä. Määrää on mahdollista kasvattaa, kun näytteenottolinjoja avataan lisää, kertoo Fimlabin Pirkanmaan aluejohtaja ja ylilääkäri Anna-Maija Haapala.
Messu- ja Urheilukeskuksen drive-in-näytteenottopisteen ohella koronanäytteenottoa on Pirkanmaalla TAYSin alueella ja Hatanpään sairaalassa. Näihin näytteenottopisteisiin tulisi ohjata erityisesti autotta kulkevat asiakkaat.
– Koronanäytteenotto toimii ajanvarauksella. Näytteenottoon tulo vaatii aina hoitoyksikön tekemän arvion ja lähetteen, Haapala muistuttaa.
Tampereen Messu- ja Urheilukeskuksen testauspiste on avoinna seitsemänä päivänä viikossa. Lue lisää täältä.