Innehållet i undersökningen av DPYD-genen utvidgas
11.3.2022
Laboratoriemeddelande 32/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten
Undersökning av DPYD-genvarianter, B-DPYD-D, 14379
DPYD-genen kodar för enzymet dihydropyrimidindehydrogenas (DPD), som är ett enzym som begränsar metabolismens hastighet för läkemedel som innehåller fluoropyrimidin. Det finns flera kända förändringar i DPYD-genen och vissa av dem påverkar hur aktivt DPD-enzymet är. En nedsatt DPD-enzymaktivitet fördröjer metabolismen för läkemedlen i fråga och ökar mottagligheten för allvarliga biverkningar på grund av dem. Europeiska läkemedelsmyndigheten (EMA) rekommenderar att aktiviteten hos DPD-enzymet testas innan patienter med cancer behandlas med fluoropyrimidin.
Genom en metod med CE-IVD-märkning fastställs i undersökningen sex punktmutationer för DPYD-genen:
- c.1905+1 G>A (DPYD*2A, rs3918290)
- c.1679 T>G (p.Ile560Ser, DPYD*13, rs55886062)
- c.2846A>T (p.Asp949Val, rs67376798)
- c.1236G>A (HapB3, rs56038477)
- c.483+18G>A (HapB3, rs56276561)
- c.1129-5923C>G (HapB3, rs75017182)
Framöver utreds som en utvidgning i undersökningsinnehållet en eventuell deletion av exon 4 i DPYD-genen med hjälp av laboratoriets egna PCR-metod. Det har rapporterats att deletion har en koppling till nedsatt DPD-enzymaktivitet i synnerhet hos befolkningen i Finland. Trots att det för närvarande inte finns ”genaktivitetspoäng” som styr vårdbeslut för förändringen i fråga, liksom för mer kända punktmutationer, ska förändringen i fråga beaktas då läkemedelsbehandling med fluoropyrimidin inleds.
Tilläggsinformation
Mer information om undersökningen, provrören och om beställning finns i Fimlabs elektroniska handbok. Undersökningarnas priser kan kontrolleras hos Fimlabs försäljningsorganisation myynti[at]fimlab.fi.
Litteratur
Saarenheimo J, Wahid N, Eigeliene N, Ravi R, Salomons GS, Ojeda MF, Vijzelaar R, Jekunen A, van Kuilenburg ABP. Preemptive screening of DPYD as part of clinical practice: high prevalence of a novel exon 4 deletion in the Finnish population. Cancer Chemother Pharmacol. 2021 May;87(5):657-663. doi: 10.1007/s00280-021-04236-y. Epub 2021 Feb 5. PMID: 33544210.
Saarenheimo J, Wahid N, Tornio A, Ristamäki R, Keinänen M, Niemi M, Turpeinen M, Jekunen A. DPYD-geenitestaus kliinisessä käytössä. Duodecim 2021;137(23):2560-6
Förfrågningar
Leena Huhti, sjukhusgenetiker, tfn 041 730 6148
Virpi Laitinen, sjukhusgenetiker, tfn 041 730 6149
Sara Lehtinen, genetiker, tfn 041 730 6150
Mauri Keinänen, direktör för specialområdet
