Laboratoriotiedote 48/2020 • Päijät-Häme

Tutkimus sitrulliinipeptidi, vasta-aineet (4744 S-CCPAb) siirtyy tehtäväksi Fimlabin Tampereen keskuslaboratorioon. Muutoksen yhteydessä tutkimuksen menetelmä ja viitealue muuttuvat. Uusi menetelmä perustuu fluoroentsyymi-immunologiaan (FEIA).

Omassa menetelmävertailussamme tulosten kvalitatiivinen tulkinta (pos, neg) ei muutu, mutta kvantitatiivinen tulostaso laskee selvästi. Kvantitatiivisen tulostason muuttumisen merkitys on kuitenkin vähäinen, sillä tason seurannasta ei tämän hetken tiedon mukaan ole merkittävää kliinistä hyötyä.

Lisätiedot                        

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja, joka päivitetään muutosajankohtana.

Tiedustelut                     

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800

Anna-Maija Haapala, Ylilääkäri

Laboratoriotiedote 38/2020 • Päijät-Häme

26466, -NCovNhO, COVID-19 (SARS-CoV-2) NUKLEIINIHAPPO (KVAL)

Koronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), on vaipallinen virus, jolla on yksisäikeinen RNA geneettisenä materiaalina. Virus aiheuttaa laajan skaalan hengitystieinfektioita hyvin lievästä flunssatyyppisestä taudista vakaviin, henkeä uhkaaviin keuhkokuumeisiin ja happeutumishäiriöihin.

Viruksen olemassaolo potilaassa voidaan todeta todentamalla viruksen RNA:ta hengitysteiden näytteistä käänteiskopiointi-PCR-menetelmällä.

Fimlabin Tampereen yksikössä on käytössä PCR-menetelmä viruksen osoittamiseksi (6466 -CV19NhO). Tätä tutkimusta täydentämään otetaan nyt myös Fimlabin Päijät-Hämeen yksikössä käyttöön vastaava menetelmä viruksen osoittamiseksi (26466 -NCovNhO).

Päijät-Hämeen tutkimuskapasiteetti on rajallinen ja tästä syystä uudella tutkimusnumerolla 26466 -NCovNhO tehtävät pyynnöt tulee tehdä pääsääntöisesti sairaalahoitoon joutuvilta, kiireellisiltä potilailta. Muut näytteet tutkitaan Fimlabin Tampereen yksikössä tutkimusnumerolla 6466 -CV19NhO.

Näytteenotossa ei ole eroja tutkimusnimikkeiden välillä

Näytteenotto-ohjeet löytyvät PHHYKY:n Infokanavalta kohdasta Laboratoriotutkimukset tai osoitteesta https://fimlab.fi/palvelut/ohjekirja.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800

Tapio Seiskari
Erikoisalajohtaja

Hannu Sarkkinen
Ylilääkäri

Laboratoriotiedote 35/2020 • Päijät-Häme

Tutkimus on tarkoitettu mikrobiperäisen meningiitin/enkefaliitin nopeaan erotusdiagnostiikkaan likvorin bakteeriviljelyn (1154 Li-BaktVi) rinnalla.

Li-MikrNhO-tutkimus kattaa yleisimmät akuuttia meningiittiä ja enkefaliittia aiheuttavat bakteerit, virukset ja sienet

Samalla tutkimuksen 1154 Li-BaktVi tekopaikaksi vaihtuu Tampereen keskuslaboratorio.

Tutkimuksen sisältö

Testipaneeli sisältää 14 kohdepatogeeniä.

Bakteerit

• Escherichia coli kanta K12
• Haemophilus influenzae
• Listeria monocytogenes
• Neisseria meningitidis (kapselillinen)
• Streptococcus agalactiae
• Streptococcus pneumoniae

Virukset

• Sytomegalovirus (CMV)
• Enterovirus (EV)
• Herpes simplex virus tyyppi 1 (HSV-1)
• Herpes simplex virus tyyppi 2 (HSV-2)
• Human herpesvirus 6 (HHV-6)
• Parechovirus (HPeV)
• Varicella-zoster virus (VZV)

Sienet

• Cryptococcus neoformans/gattii

Näytteenotto, tekoaika ja tekopaikka

Näytteeksi otetaan 0,5–1 ml likvoria tehdaspuhtaassa putkessa (tai steriiliputkessa). Näyte voidaan säilyttää 1 vrk huoneenlämmössä ja 7 vrk asti jääkaappilämpötilassa. Huom! Samanaikaisesti otettu 1154 Li-BaktVi-tutkimus otetaan mikrobikasvua rikastavaan, huoneenlämpöiseen tioglykolaattiputkeen.

Tutkimuksen tekopaikka on Päijät-Hämeen keskussairaalan mikrobiologian laboratorio. Tutkimusta tehdään käyttöönoton aluksi mikrobiologian laboratorion aukioloaikoina. Vasteaika on pääsääntöisesti saman tai seuraavan päivän aikana. Mikäli näytettä on jäljellä, bakteerilöydöksen suhteen positiivisesta näytteestä voidaan tehdä lisäpyynnöstä likvorin bakteeriviljely mikrobilääkeherkkyyden määrittämiseksi.

Tiedustelut                         

Päijät-Hämeen keskussairaalan laboratorio, Mikrobiologia, p. 044 719 5450
Asiakaspalvelu, p. 03 311 77800

Lisätiedot                            

Tarkemmat tiedot pyydetään tarkistamaan muutosajankohtana sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Laboratoriotiedote 73/2019

Bakteriologian viljelytutkimuksia siirtyy tehtäviksi Fimlabin Tampereen toimipisteeseen 23.12.2019 alkaen. Tekopaikan muutos saattaa aiheuttaa muutoksia mikrobilääkeherkkyysmäärityksissä ja vastausmuodoissa. Laboratorion asiantuntijat Lahdessa ja Tampereella vastaavat tarvittaessa kysymyksiin.

Virtsaviljelyt, siirtyvät osin 23.12.2019

Käytössä olevat nimikkeet, indikaatiot ja näytteen otto pysyvät ennallaan:

• 1155, U-BaktVi, Bakteeri, viljely (virtsasta): partikkelilaskentaan perustuva seulonta tehdään jatkossakin Lahdessa
• 3777, U-BaktJVi, Bakteeri, jatkoviljely (virtsasta)
• 3154, U-BaktAlV, Bakteeri, aluslasiviljely (virtsasta): seulontaviljely tehdään jatkossakin Lahdessa
• 1787, U-BaktEVi, Bakteeri, erikoisviljely (mm. immuunipuutteiset potilaat)
• 9076, Rp-BaktVi, Bakteeri, viljely (Rakkopunktiovirtsa): seulontaviljely tehdään jatkossakin Lahdessa

Märkäviljelyt, siirtyvät 7.1.2020

• 3491, Pu-BaktVi1, Bakteeri, viljely 1 (anaerobi ja aerobiviljely sekä värjäys)
  • Punktionesteet ja kudospalat (korvaa myös tutkimuksen Af -BaktVi)
• 3492, Pu-BaktVi2, Bakteeri, viljely 2 (aerobiviljely, pintamärkä)
  • Pinnalliset tikkunäytteet

Nieluviljely, siirtyy 7.1.2020

• 2703, Ps-StrVi, Streptococcus, viljely (-hemolyytt. streptokokit nielusta)
• 4167, Ps-StrJVi, Streptococcus, jatkoviljely
  • Nieluviljelyiden rinnalla on mahdollista tilata Lahdessa tehtävää nopeampaa ja hinnaltaan kalliimpaa nukleiinihapon osoitusta 9004, Ps-StrNhO, Ps-Streptococcus A, C, G osoitus (kval.). Tutkimus löytää tonsilliittia aiheuttavat beetahemolyyttiset streptokokit.

Moniresistenttien bakteerien viljely, siirtyy 7.1.2020

• 9690, -MDRsVi, Moniresistentit gramnegatiiviset sauvat, viljely
  • Tutkimus sisältää ESBL-viljelyn

MRSA-viljely, siirtyy 7.1.2020

• 4358, -MRSAVi, Staphylococcus aureus, metisilliiniresistentti (MRSA), viljely
  • Korvaa tutkimukset Ns- MRSAVi ja Ps -MRSAVi
  • Pyyntöä tehtäessä anatomiatieto lisätään pyyntöön; tieto välittyy myös vastaukseen.
• 9953, U-MRSA, Staphylococcus aureus, metisilliiniresistentti (MRSA), viljely (virtsasta)
  • Uusi tutkimus

Yskösviljely, siirtyy 7.1.2020

• 3493, Ex-BaktVi, Bakteeri, viljely (ysköksestä, sisältää värjäyksen)

Myös muiden, harvinaisempien bakteeriviljelyiden tekopaikka vaihtuu 7.1.2020 alkaen

• 1506, -GcVi, Neisseria gonorrhoeae, viljely
• 2608, F-SalmVi, F-Salmonella, viljely

Poistuvat tutkimusnimikkeet

• 2257, -ListVi, -Listeria, viljely
  • Listeria kasvaa hyvin tavallisissa bakteeriviljelyissä. Esimerkiksi ulosteesta tehtävän listeriaviljelyn herkkyys listeriainfektiossa tunnetaan huonosti; toisaalta ulosteen listeria löydöstä ei voida pitää osoituksena infektiosta. Listeriainfektiota epäiltäessä tulee ottaa tapauskohtaisesti veren ja/tai likvorin bakteeriviljely
• 8077, Af-Baktvi, Af-Punktionäyte, bakteeriviljely
  • Korvaava tutkimus: 3491, Pu-BaktVi1
• 9010, Ns-MRSAVi, viljely, nenäeritteestä
• 9015, Ps-MRSAVi, viljely, nielueritteestä
• 4817, -ESBLVi, ESBL, viljely
  • Korvaava tutkimus: 9690, -MDRsVi

Lisätietoa

Tutkimusohjeet ovat luettavissa PHHYKY:n Infokanavalta kohdasta Laboratoriotutkimukset ja osoitteesta Fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja
Hannu Sarkkinen, ylilääkäri

Laboratoriotiedote 70/2019

Otsikossa mainittu analytiikka siirtyy tehtäväksi Fimlabin Tampereen toimipisteeseen 18.12.2019 alkaen.

Käytössä olevat tutkimusnimikkeet:

• 1738, -CtNgNhO (muut kuin virtsanäytteet), Chlamydia trachomatis ja Neisseria gonorrhoeae, nukleiinihappo (kval)
• 4816, U-CtNgNhO (virtsanäytteet), Chlamydia trachomatis ja Neisseria gonorrhoeae, nukleiinihappo (kval)
• 4075, -HPVNhO, Papilloomavirus (HPV), nukleiinihappo (kval)

Näytteenottotarvikkeet muuttuvat tässä yhteydessä:

• Limakalvonäytteet: Abbott multi-Collect Specimen Collection Kit
• Virtsanäytteet: puhdas muoviastia ja 10 ml:n kierrekorkillinen muoviputki
• HPV -näytteet: Abbott Cervi-Collect

Lisätietoa

Tutkimusohjeet ovat luettavissa PHHYKY:n Infokanavalta kohdasta Laboratoriotutkimukset ja osoitteesta Fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja
Hannu Sarkkinen, ylilääkäri

Laboratoriotiedote 68/2019

Käytössä olevat viljelytutkimukset

4027 Ex-TbVi, tarkoitettu vain yskösnäytteille, sisältää värjäyksen ja viljelyn, positiivisista viljelynäytteistä lisäksi laji- ja herkkyysmääritykset (KORVAA PYYNNÖN 8569, -TbVrVi, muutos otetaan käyttöön 7.1.2020). Tekopaikka on HUSLAB.

4437 -TbEVi, tarkoitettu punktionäytteille (myös BAL-nesteet), bronkuslimanäytteille ja kudospaloille, sisältää värjäyksen ja viljelyn, positiivisista viljelynäytteistä lisäksi laji- ja herkkyysmääritykset. Tekopaikka on Fimlab, Tampereen toimipiste.

4438 B -TbEVi, tarkoitettu veri- ja luuydinnäytteille, sisältää viljelyn (ei värjäystä), positiivisista viljelynäytteistä lisäksi laji- ja herkkyysmääritykset. Tekopaikka on Fimlab, Tampereen toimipiste. 

2812 -TbVi, tarkoitettu vain virtsa- ja ihonäytteille, sisältää viljelyn (ei värjäystä), positiivisista viljelynäytteistä lisäksi laji- ja herkkyysmääritykset. Tekopaikka on Fimlab, Tampereen toimipiste.

Käytössä olevat nukleiinihappomonistukseen perustuvat tutkimukset

9930, Ex-TbNhO, tarkoitettu yskös- ja imulimanäytteille, saatavissa 7 päivänä viikossa mikrobiologian laboratorion aukioloaikoina. Tekopaikka on Fimlab, Päijät-Hämeen toimipiste.

4490, -TbNhO, tarkoitettu muille kuin yllä mainituille näytetyypeille. Tekopaikka on Fimlab, Tampereen toimipiste.

Mikäli laboratorioon tuleva pyyntö ei vastaa ilmoitettua näytetyyppiä, se muutetaan tämän ohjeistuksen mukaiseksi. Tarkemmat näytteenotto-ohjeet ovat luettavissa PHHYKY:n Infokanavalta kohdasta Laboratoriotutkimukset.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja
Hannu Sarkkinen, ylilääkäri