Mikrobiologia - Page 11 of 19

Pietarsaaren alueen Lifecare-tilaajat: Virtsan soluissa ja bakteeriviljelyssä muutoksia 23.6.2022 lähtien

7.7.2022

Laboratoriotiedote 82/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Fimlab Pietarsaaren Lifecaren käyttöalueella pyydettävät virtsan solujen 0141 U-Solut ja 1155 U-BaktVi bakteeriviljelyn vastaustavat muuttuivat yhtenäisemmiksi 23.6.2022 ja tekopaikka vaihtui Pietarsaaren laboratoriosta Vaasan keskussairaalan kliiniseen laboratorioon. Pietarsaaresta Vaasaan näytekuljetus lähtee arkena klo 9:45 ja 13:45 sekä lauantaisin ja sunnuntaisin klo 12.

0141 U- Solut, virtsan solujen peruserittely

Virtsan partikkelien peruslaskennan kliinisiä käyttöaiheita ovat munuaissairauksien ja alempien virtsateiden sairauksien toteaminen ja seuranta. U-Solut tutkimuksen osana ilmoitetut bakteerit vastataan jatkossa:

U-BAKT-tulos alle 70 kpl/µl on NEG (aiemmin vastattu .)
U-BAKT-tulos 70 – 4200 kpl/µl on RAJA-ARVO (aiemmin vastattu +/++/+++)
U-BAKT-tulos yli 4200 kpl/µl on RUNS

1155 U- BaktVi, virtsan bakteeriviljely

Vastaustapamuutos naisille, miehille ja lapsille, virtsan partikkeliseulonnan perusteella annetaan seuraavat vastaukset ja lausunnot:

Kun tulokset ovat alle bakteeriviljelyn seulontarajojen:
U- BaktVi vastaus: NEG
Lausunto: Bakteeri- ja leukosyyttilaskentaan perustuva seulonta negatiivinen, näytettä ei viljellä.
Kun seulontarajat ylittyvät:
U- BaktVi vastaus: Viljelyyn
Lausunto: Bakteeri- tai leukosyyttilaskennan seulontarajat ylittyvät, näyte ohjattu viljelyyn.

Tuloksesta generoituu automaattisesti jatkoviljelypyyntö 3777 U-BaktJVi, joka viljellään maljalle ja tulos vastataan kuten aikaisemmin.

Edellisestä käytännöstä poiketen jatkossa seulotaan naisten, miesten ja lasten (alle 16v) näytteet ennen maljaviljelyä. Tämä tarkoittaa entistä nopeampaa negatiivista vastausta naisten, miesten ja lasten osalta. Seulontarajat perustuvat sukupuoleen, ikään, sekä bakteeri- ja leukosyyttimäärään.

Erityisryhmille (urologiset potilaat, munuaispotilaat, tehohoitopotilaat ja syvässä neutropeniassa olevat potilaat) pyydettävä jatkossakin erikoisviljely 1787 U -BaktEVi.

Virtsan perustutkimuksista virtsan kemiallista perusseulontaa (1881 U-KemSeul) käytetään päivystystutkimuksena ja se on edelleen saatavilla kiireellisenä Fimlab Pietarsaaren laboratoriosta.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksesta ja sen tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta http://www.vshp.fi/medserv/.

23349 F-MikrNhO	F-Mikrober, nukleinsyra (kval)
Metod:	Kvalitativ nukleinsyrapåvisningsundersökning (RT-PCR)
Indikation:	I brådskande fall vid misstanke om tarminfektion, speciellt hos resenärer och flyktingar, och för en omfattande etiologisk utredning av oklara tarmsymptom.
Provinformation:	Avföring (särskilt blodig eller slemmig avföring) tas i en avföringsprovburk. Provburken förpackas i en förslutningsbar plastpåse. Provet ska levereras till laboratoriet så snabbt som möjligt efter provtagning för att många avföringspatogener dör vid lång förvaring. Provet förvaras vid behov i kylskåp och levereras med kyltransport till laboratoriet.
Färdigt resultat:	Undersökningen utförs under mikrobiologiska laboratoriets öppethållningstider.
Tolkning:	Ett positivt resultat tyder på infektion orsakad av avföringspatogenen i fråga. Vissa positiva bakteriefynd (Yersinia enterocolitica, Salmonella spp., Campylobacter spp. och EHEC/STEC-fynd) svaras först preliminärt och bekräftas med odling.

23349 F-MikrNhO	F-Mikrobit, nukleiinihappo (kval)
Menetelmä:	Kvalitatiivinen nukleiinihaponosoitustutkimus (RT-PCR)
Indikaatiot:	Kiireistä selvittelyä edellyttävä suolistoinfektioepäily erityisesti matkailijoilla ja pakolaisilla, myös epäselvien suolisto-oireiden laaja-alainen etiologinen selvittely.
Näytetiedot:	Ulostetta ulostenäytepurkissa, erityisesti verinen tai limainen uloste. Näytepurkki pakataan suljettavaan muovipussiin. Näyte tulee toimittaa laboratorioon mahdollisimman pian näytteenoton jälkeen, koska monet ulostepatogeenit kuolevat pitkään säilytettäessä. Näyte säilytetään tarvittaessa jääkaapissa ja toimitetaan laboratorioon kylmäkuljetuksena.
Tulos valmiina:	Tutkimusta tehdään mikrobiologian laboratorion aukioloaikoina.
Tulkinta:	Positiivinen tulos viittaa ko. ulostepatogeenin aiheuttamaan infektioon. Tietyt positiiviset bakteerilöydökset (Yersinia enterocolitica, Salmonella spp., Campylobacter spp. ja EHEC/STEC-löydökset) vastataan ensin alustavana ja varmistetaan viljelemällä.

3635 Ps-StrAAg	*Streptococcus pyogenes* (A), antigen
Metod:	Kvalitativt immunokromatografiskt snabbtest.
Indikation:	Snabbdiagnostik för påvisning av tonsillit orsakad av Streptococcus pyogenes (grupp A).
Provinformation:	Svalgprovet tas med en steril bomullsticka från svalgets bakre delar, halsmandlar och andra inflammerade områden. Undvik att röra stickan i tungan, kinderna eller tänderna. Undvik också mycket slem eller blod. Stickan bryts av i ett fabriksrent rör. Använd inte andra provtagningsstickor.
Färdigt resultat:	Inom ca. två timmar efter att provet mottagits vid laboratoriet.
Tolkning:	Ett negativt resultat tyder på något annat än tonsillit orsakad av A-streptokocker eller så kan det bero på att testet är okänsligt för identifiering av små mängder antigen. Snabbtestet kan inte skilja på akut infektion och symptomfritt bärande.

Vanha 25.3.2022 poistunut tutkimus:
6001 P -BKVNh	P -BK-virus, nukeliinihappo (kvant)
Menetelmä	Kvantitatiivinen PCR (polymeraasiketjureaktio).
Viiteväli	Tutkimuksen kvantitatiivinen määritysraja on 22 IU/ml. Positiivisen tuloksen yhteydessä ilmoitetaan BKV-genomien määrä IU per ml plasmaa (IU/ml).

12811 -PoVNh	Polyoomavirus, nukleiinihappo
Näytetiedot	Veri: 2 ml EDTA -plasmaa, joka on eroteltava mahdollisimman nopeasti (viimeistään 4-6 tunnin kuluttua näytteenotosta) Muut näytelaadut (virtsa, likvor, kudos): 2 ml Säilytetään jääkaapissa max.3 vrk, lähetys huoneenlämmössä. Pidempiaikainen säilytys ja lähetys pakastettuna.
Menetelmä	Kvantitatiivinen PCR (polymeraasiketjureaktio)
Tulos valmiina	Noin kahden viikon kuluessa
Tulkinta	Tulos ilmoitetaan kopioiden määränä/ml. BK- tai JCV-DNA:n toteaminen on merkki aktivoituneesta infektiosta ja kopioiden määrä kuvaa infektion aktiivisuutta ja vakavuusastetta.

4521 S-PuumAbO	Puumalavirus, IgM-antikroppar (kval)
Metod:	Kvalitativt immunokromatografiskt snabbtest.
Provinformation:	Provtagningskärl: 5 ml serumrör eller 4 ml Li-heparinrör. För provet behövs åtminstone 0,5 ml serum eller plasma.
Färdigt resultat:	Undersökningen görs varje dag under laboratoriets öppethållningstider.
Tolkning:	Ett negativt resultat betyder att det inte finns specifika IgM-antikroppar mot Puumalaviruset i provet och att patienten inte har akut Puumalavirus infektion. Om man fortfarande misstänker akut infektion hos patienten så ska provet tas på nytt om några dagar. Ett positivt resultat betyder att patienten lider av akut sorkfeber. En tidigare infektion orsakar inte positivt resultat.

S-TBEAbM	Fästingburet encefalit virus, IgM-antikroppar (kval)
Metod:	Kvalitativt immunokromatografiskt snabbtest.
Provinformation:	Provtagningskärl: 5 ml serumrör eller 4 ml Li-heparinrör. För provet behövs åtminstone 0,5 ml serum eller plasma.
Färdigt resultat:	Undersökningen görs varje dag under laboratoriets öppethållningstider.
Tolkning:	Ett negativt resultat betyder att det inte finns specifika IgM-antikroppar mot viruset i provet och att patienten inte har akut fästingburen encefalit infektion. Om man fortfarande misstänker akut infektion hos patienten så ska provet tas på nytt om några dagar. Ett positivt resultat betyder att patienten lider av akut fästingburen encefalit infektion. En tidigare infektion orsakar inte positivt resultat.

4521 S-PuumAbO	Puumalavirus, IgM-vasta-aineet (kval)
Menetelmä:	Kvalitatiivinen immunokromatografinen pikatesti.
Näytetiedot:	Näyteastiana 5 ml seerumiputki tai 4 ml Li-hepariiniputki. Näytteeksi tarvitaan vähintään 0,5 ml seerumia tai plasmaa.
Tulos valmiina:	Tutkimusta tehdään joka päivä laboratorion aukioloaikoina.
Tulkinta:	Negatiivinen tulos tarkoittaa, että näytteessä ei ole Puumalavirukselle spesifisiä IgM-vasta-aineita ja potilaalla ei ole akuuttia Puumalavirus-infektiota. Jos akuuttia infektiota epäillään edelleen, tulee ottaa uusi näyte muutaman päivän kuluttua. Positiivinen tulos tarkoittaa, että potilas sairastaa akuuttia myyräkuumetta. Aiemmin sairastettu infektio ei aiheuta positiivista tulosta.

S-TBEAbM	Puutiaisenkefaliittivirus, IgM-vasta-aineet (kval)
Menetelmä:	Kvalitatiivinen immunokromatografinen pikatesti.
Näytetiedot:	Näyteastiana 5 ml seerumiputki tai 4 ml Li-hepariiniputki. Näytteeksi tarvitaan vähintään 0,5 ml seerumia tai plasmaa.
Tulos valmiina:	Tutkimusta tehdään joka päivä laboratorion aukioloaikoina.
Tulkinta:	Negatiivinen tulos tarkoittaa, että näytteessä ei ole Puutiaisenkefaliittivirukselle spesifisiä IgM-vasta-aineita ja potilaalla ei ole akuuttia infektiota. Jos akuuttia infektiota epäillään edelleen, tulee ottaa uusi näyte muutaman päivän kuluttua. Positiivinen tulos tarkoittaa, että potilas sairastaa akuuttia puutiaisenkefaliittiviruksen aiheuttamaa infektiota. Aiemmin sairastettu infektio ei aiheuta positiivista tulosta.

Li-TBEAbM	Puutiaisenkefaliittivirus, IgM-vasta-aineet likvorista
Menetelmä:	Kvalitatiivinen immunokromatografinen pikatesti.
Näytetiedot:	Näyteastiana tehdaspuhdas korkillinen putki ilman säilöntäainetta. Näytteeksi tarvitaan vähintään 0,5 ml likvoria.
Tulos valmiina:	Tutkimusta tehdään joka päivä laboratorion aukioloaikoina.
Tulkinta:	Ks. tulkinta laboratorio-ohjekirjasta.

3635 Ps-StrAAg	*Streptococcus pyogenes* (A), antigeeni
Menetelmä:	Kvalitatiivinen immunokromatografinen pikatesti.
Indikaatiot:	Streptococcus pyogeneksen (ryhmä A) aiheuttaman tonsilliitin pikadiagnostiikka.
Näytetiedot:	Nielunäyte kerätään steriilillä pumpulitikulla nielun takaosasta, nielurisoista ja muilta tulehtuneilta alueilta. Vältä koskemasta tikulla kieltä, poskia tai hampaita. Vältä myös liiallista limaa tai verta. Tikku katkaistaan tyhjään tehdaspuhtaaseen putkeen. Älä käytä muita näytteenottotikkuja.
Tulos valmiina:	Noin kahden tunnin sisällä näytteen saapumisesta laboratorioon.
Tulkinta:	Negatiivinen tulos viittaa muuhun kuin A-ryhmän streptokokin aiheuttamaan tonsilliittiin tai se voi johtua myös testin epäherkkyydestä tunnistaa pieniä antigeenimääriä. Pikatesti ei erota akuuttia infektiota sairastavia oireettomista kantajista.

4075 -HPVNhO	Papillomvirus (HPV), nukleinsyra (kval)
Metod:	PCR-amplifikationsmetod som identifierar 14 högrisk HPV-genotyper, (16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 68). Genotyperna 16 och 18 identifieras skilt från de andra genotyperna.
Provinformation:	Provtagningskärl: Roche Cell Collection Medium. I provtagningsburken håller provet 3 månader I rumstemperatur. I undersökningsmetoden finns en intern kontroll som berättar ifall provet inte innehöll tillräckligt med celler.
Färdigt resultat:	Inom två veckor.
Tolkning:	Undersökningen svaras med ett utlåtande.

1738 -CtNgNhO (tidigare -CtGcNhO)	Chlamydia trachomatis och Neisseria gonorrhoeae, nukleinsyra (kval)
Metod:	Nukleinsyrapåvisning (polymeraskedjereaktion, PCR). Ifall provet innehåller specifika DNA-sekvenser för klamydia och gonorré amplifieras och påvisas dessa med hjälp av specifika DNA-sonder.
Provinformation:	Provtagningskärl: cobas® PCR Media Dual Swab Sample Kit, Roche, 07958021190, IVD. ( För prover från livmoderhalskanalen-, vagina-, ändtarmen och svalget). Förvaring i rumstemperatur.
Färdigt resultat:	Inom 3 vardagar efter att provet anlänt till laboratoriet.
Tolkning:	Resultatet svaras som positivt eller negativt. Ett positivt resultat påvisar infektion.

4816 U -CtNgNhO (tidigare U -CtGcNhO)	Chlamydia trachomatis och Neisseria gonorrhoeae, nukleinsyra (kval), urin
Metod:	Nukleinsyrapåvisning (polymeraskedjereaktion, PCR). Ifall provet innehåller specifika DNA-sekvenser för klamydia och gonorré amplifieras och påvisas dessa med hjälp av specifika DNA-sonder.
Provinformation:	Provtagningskärl: cobas® PCR Urine Sample Kit, Roche, 05170486190, IVD. (För urinprov). Förvaring i rumstemperatur.
Färdigt resultat:	Inom 3 vardagar efter att provet anlänt till laboratoriet.
Tolkning:	Resultatet svaras som positivt eller negativt. Ett positivt resultat påvisar infektion.

Varaa aika netissä

Varaa aika puhelimitse

Laboratoriotiedote 82/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

0141 U- Solut, virtsan solujen peruserittely

1155 U- BaktVi, virtsan bakteeriviljely

Lisätiedot

Laboratoriotiedote 74/2022 • Päijät-Häme

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 62/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Tilläggsinformation

Laboratoriotiedote 62/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot

Laboratoriemeddelande 53/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Tilläggsinformation

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 53/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 49/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 49/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 48/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Tilläggsinformation

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 48/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 44/2022 • Keski-Suomi

Polyoomavirusten nukleiinihapon osoitus

Uusi käyttöön otettu tutkimus:

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 43/2022 • Päijät-Häme

Päijät-Hämeen osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Laboratoriotiedote 42/2022 • Kanta-Häme

Kanta-Hämeen osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Laboratoriotiedote 41/2022 • Pirkanmaa

Pirkanmaan osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Laboratoriotiedote 30/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme

Putkien vertailu

Puritan MRSA medium

Copan eSwab

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 21/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Tilläggsinformation

Laboratoriotiedote 21/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot

Laboratoriemeddelande 16/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Tilläggsinformation

Förfrågningar