Mikrobiologia - Page 14 of 16

Ulosteen kalprotektiini tutkimuksen (4803 F-Calpro) tekopaikka vaihtuu 28.10.2020

27.10.2020

Laboratoriotiedote 109/2020 • Päijät-Häme

Fimlab yhdenmukaistaa tuotantoaan ja ulosteen kalprotektiini (4803 F-Calpro) -tutkimus siirtyy tehtäväksi Fimlabin Tampereen keskuslaboratorioon 28.10.2020 alkaen. Tutkimuksen menetelmä vaihtuu. Tampereen keskuslaboratoriossa on käytössä fluoroentsyymi-immunologinen menetelmä Phadia^TM 250 -automaattilaitteistolla. Menetelmä on ollut käytössä Fimlabissa vuodesta 2014 lähtien.

Omassa vertailussamme todettiin, että menetelmien tulokset ovat kvalitatiivisesti yhteneväiset, mutta tulostaso on aiempaan Päijät-Hämeessä käytössä olevaan menetelmään verrattuna hieman matalampi. Muutoksen suuruus yksittäisen potilaan kohdalla saattaa kuitenkin vaihdella.

Muutoksen jälkeen tuotanto- ja vastaustapa yhdenmukaistuu Pirkanmaan, Kanta-Hämeen, Keski-Suomen ja Vaasan kanssa.

Viitearvo	ALLE 100 ug/g
Tekotiheys	tutkimus tehdään 3 -4 x viikossa

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksesta ja sen tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Ammattilaisten palvelupuhelin 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

COVID-19-näytteistä ei tehdä muita NhO-tutkimuksia

27.10.2020

Laboratoriotiedote 108/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

COVID-19-näytteistä EI voida tehdä muita NhO-tutkimuksia kuten respiratoristen virusten tai bakteerien osoitustestejä. Tämä johtuu kevääseen verrattuna huomattavasti suuremmista näytevolyymeistä eikä täten muiden testien tekeminen COVID-näytteistä ole mahdollista hidastamatta analysoinnin kulkua merkittävästi.

Jokaiseen respiratoriseen osoitustestiin tarvitaan siis oma näyte ja omat pyynnöt.

Tiedustelut

Ammattilaisten palvelupuhelin 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Komplementterande undersökningar är på pausen

30.9.2020 • Tiedote päivitetty: 5.10.2021

Laboratoriemeddelande 104/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Komplementterande undersökningar är på pausen, därför att underleverantör laboratoriet kommer att fokusera resurser på att diagnostisera ett nytt coronavirus. Följande undersökningarna analyseras inte: S-C-Def, 3067 P-C4Aktt, 3066 P-C3Aktt, 4941 S-CH100, P-C1qAbG, P-C1q eikä P -SC5b-9.

Ett undantag är P-HAE -underöskning, som ska utföras normalt.

Förfrågningar

Servicenumret för professionella är 03 311 77800

Tapio Seiskari, Chef inom specialområdet (mikrobiologi)

Tulosta

Komplementtitutkimukset tauolla

30.9.2020

Laboratoriotiedote 104/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Komplementtitutkimukset ovat tauolla alihankintalaboratoriossa, heidän keskittyessään koronaviruksen diagnostiikan tekemiseen. Tällä hetkellä ei analysoida seuraavia tutkimuksia: S-C-Def, 3067 P-C4Aktt, 3066 P-C3Aktt, 4941 S-CH100, P-C1qAbG, P-C1q eikä P -SC5b-9.

Poikkeuksena P -HAE -tutkimus (Sisältää: P-C1INHBk, P-C1INH, P-C3, P-C4), joka analysoidaan normaalisti.

Tiedustelut

Ammattilaisten palvelupuhelin 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Ulosteen F- BaktNhO pyynnöt korvataan toistaiseksi F-BaktVi1-tutkimuksella

10.9.2020

Laboratoriotiedote 95/2020 • Päijät-Häme

Korona-pandemiasta johtuen tutkimukseen 9021 F -BaktNhO tarvittavia testejä ei ole saatavilla, eikä tutkimusta pystytä tekemään. Tutkimus korvataan toistaiseksi viljelytutkimuksella 3442 F-BaktVi1, Bakteeri, viljely 1. Molemmat pyynnöt sisältävät Salmonella, Shigella, Yersinia ja Kampylo- osatutkimukset.

Näytteet ohjataan Tampereen toimipisteeseen viljelyä varten. Negatiivinen vastaus saadaan 3 vrk:n sisällä, positiivisen löydöksen kohdalla jatkoviljely kestää 1-3 vrk pidempään.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 3117 7800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Muutoksia alihankittavissa tutkimuksissa 9.9.2020 alkaen

1.9.2020

Laboratoriotiedote 90/2020 • Päijät-Häme

Siirrämme alihankinnasta omaan tuotantoon Tampereelle 9.9.2020 alkaen seuraavat tutkimukset, joihin tulee tekopaikan, tutkimusmenetelmän ja viitearvojen muutos. Näytteiden säilytys ja tekotiheys eivät muutu.

4949 S -IgLcV

Menetelmä ja viitearvot muuttuvat.

Uusi menetelmä:	Immunonefelometria
Uusi viiteväli:
Vapaa kappaketju:	S -IgLcK-V	3.3 – 19.4 mg/l
Vapaa lambdaketju:	S -IgLcL-V	5.7 – 26.3 mg/l
Kappa-lambda-suhde:	S -K/L-s-V	0.26 – 1.65

4237 U -Legi-O

Tutkimus korvaa aiemmin käytössä olleen tutkimuksen 4632 U -LepnAg. Näyte säilyy huoneenlämmössä 24 tuntia ja jääkaapissa (+ 2 – 8°C) 14 vuorokautta.

Uusi Näyteastia:

tehdaspuhdas muoviputki 3-10 ml

Samalla Päijät-Hämeen tutkimusvalikoimasta poistuu tutkimuksia vähäisen kysynnän vuoksi:

21367	-HHV8NhO	Human herpes virus 8, nukleiinihappo (kval)
3281	S-C3Nef	C3-nefriittitekijä
1953	Li-FTAABs	Treponema pallidum, FTA-absorptio, likvorista
4171	S-FTAABs	Treponema pallidum, FTA-absorptio, seerumista
9373	S-GoodpK	Goodpasturen syndrooma, vasta-aineet, kiireellinen tutkimus
9422	B-BorecVr	Borrelia recurrentis (toisintokuume), värjäys
21151	S-CaKNAb	Kalsiumkanava (N-tyyppi), vasta-aineet, seerumista
6038	S-ChikVAb	Chikungunyavirus, vasta-aineet
21140	S-CRMP5Ab	CRMP-5/CV2, vasta-aineet (kval), seerumista
21123	S-HuAb	Hu-D, vasta-aineet, seerumista
6076	S-AnplAbG	Anaplasma, IgG-vasta-aineet
21152	S-CaKPQAb	Kalsiumkanava (PQ-tyyppi), vasta-aineet, seerumista
21141	Li-CRMP5Ab	CRMP-5/CV2, vasta-aineet (kval), likvorista
21359	B-FiloNhO	Filovirus, nukleiinihappo (kval)
20840	S-GnatAb	Gnathostoma-vasta-aineet
21470	S-HHV7NhO	Human herpesvirus 7, nukleiinihappo (kval), seerumista
1865	S-HistpAb	Histoplasma, vasta-aineet
21124	Li-HuAb	Hu-D, vasta-aineet, likvorista
21136	S-Ma1Ab	Ma1, vasta-aineet, seerumista
21137	Li-Ma1Ab	Ma1, vasta-aineet, likvorista

Muutokset koskevat niitä tutkimuksia, joiden pyyntöpäivä on 9.9.2020 ja siitä eteenpäin.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Ammattilaisten palvelupuhelin 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Ändringar i undersökningen P -Haptog 8378 fr.o.m. 4.8.2020

29.7.2020 • Tiedote päivitetty: 30.7.2020

Laboratoriemeddelande 88/2020 • Pohjanmaa/Österbotten

Analysstället, provmaterial och undersökningsnummer för undersökningen P -Haptoglobin (P -Haptog 8378) ändras fr.o.m. 4.8.2020. Undersökningar som beställts före ändringen styras automatiskt till det nya analysstället.

Nytt analysställe: Fimlab Laboratoriot oy Tampere

Nytt undersökningsnummer/namn: 1545 S -Haptog. I fortsättningen används alltså serum som provmaterial.

Analysmetoden, resultatnivån och referensvärdena för vuxna förblir som tidigare.

Referensvärden för barn anges inte i fortsättningen. Barns haptoglobinhalter är obefintliga eller mycket låga, och därför lämpar undersökningen sig inte för påvisning av hemolys hos barn.

Ytterligare information:

Kemist Katja Viitala tel. 041 730 4070

Tulosta

Muutoksia tutkimuksessa P -Haptog, 8378, 4.8.2020 alkaen

29.7.2020 • Tiedote päivitetty: 30.7.2020

Laboratoriotiedote 88/2020 • Pohjanmaa/Österbotten

Tutkimuksen P -Haptoglobiini (P -Haptog 8378) tekopaikka, näytemuoto ja tutkimusnumero vaihtuvat 4.8.2020 alkaen. Ennen muutosta tehdyt tutkimuspyynnöt ohjautuvat automaattisesti uuteen tekopaikkaan.

Uusi tekopaikka: Fimlab Laboratoriot Oy Tampere

Uusi tutkimusnumero/nimi: 1545 S -Haptog. Jatkossa näytemuotona käytetään siis seerumia.

Tutkimusmenetelmä, tulostaso ja aikuisten viitearvot eivät muutu.

Lapsille ei vastaisuudessa ilmoiteta viitearvoja. Lapsilla haptoglobiinipitoisuudet ovat olemattomat tai erittäin alhaiset, eikä tutkimus siten sovellu hemolyysin osoittamiseen lapsilla.

Lisätiedot:

Kemisti Katja Viitala puh. 041 730 4070

Tulosta

Förändring av paketundersökningar för antikroppar vid Autoimmun encefalit, fr.o.m. 3.8.2020

27.7.2020

Laboratoriemeddelande 86/2020 • Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Autoimmun encefalit, antikroppar

21780 S -EnkefAb	Autoimmun encefalit, antikroppar i serum
21781 Li-EnkefAb	Autoimmun encefalit, antikroppar i spinalvätska

Byte av underleveranslaboratorium fr.o.m. 3.8.2020.

Förändringen inverkar på undersökningsförkortningarna.

Tidigare förkortningar:	21780 S-AitNeu 21781 Li-AitNeu
Provmaterial:	2 ml serum (minimimängd 1 ml serum) 2 – 3 ml spinalvätska
Förvaring:	2-3 dygn i kylskåp, långvarig förvaring kräver frysning. Sänds i rumstemperatur. Svaret fås inom 3 veckor.
Metod:	Indirekt immunfluorescens
Referensområde:	Normalt negativt resultat. Ett utlåtande ges.
Tolkning:	Antikroppbestämningarnas resultat rapporteras kvalitativt (positiv/negativ). Vid positivt resultat anges även ettt kvantitativt värde.
Paketens innehåll:	Undersökningen innehåller följande antikroppsbestämningar: Hu, Ri, ANNA3, Yo, Tr/DNER, myelin, Ma/Ta, GAD65, amfifysin, akvaporin 4, NMDA-receptor, AMPA-receptor, GABA-a-receptor, GABA-b-receptor, LGI1, CASPR2, Zic4, DPPX, glycinreceptor, mGluR1, mGluR5, Rho-GTPas-aktiverande protein 26, ITPR1, homer 3, MOG, recoverin, neurokondrin, GluRD2, flotillin, IgLON5, CARPVIII, neurexin- 3a, ERC1, Sez6I2, AP3B2, kontaktin 1, neurofascin 155, neurofascin 186, AT1A3, KCNA2, dopaminreceptor 2.

Undersökningarnas underleverantör är Labor Winfried Stöcker i Tyskland, dit prov har skickats tidigare via HUSLAB. I framtiden skickar Fimlab prov direkt till Tyskland.

Förändringarna gäller undersökningar med beställningsdatum 3.8.2020 eller senare.

Tilläggsinformation

Mer information om undersökningar (t.o.m. tolkningar) finns i elektronisk handbok fimlab.fi

Förfrågningar

Servicenumret för professionell personal 03 311 77800

Tapio Seiskari
Chef inom specialområde (mikrobiologi)

Tulosta

Muutos Autoimmuunienkefaliitti vasta-ainepaketeissa 3.8.2020 alkaen

23.7.2020 • Tiedote päivitetty: 27.7.2020

Laboratoriotiedote 85/2020 • Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Autoimmuunienkefaliitti, vasta-aineet

21780 S -EnkefAb	Autoimmuunienkefaliitti, vasta-aineet seerumista
21781 Li-EnkefAb	Autoimmuunienkefaliitti, vasta-aineet likvorista

Alihankintalaboratorion vaihdos 3.8.2020 alkaen. Muutos vaikuttaa tutkimuslyhenteeseen.

Vanhat lyhenteet:	21780 S-AitNeu 21781 Li-AitNeu
Näyte:	2 ml seerumia (mininimimäärä 1 ml seerumia) 2 – 3 ml likvoria
Säilytys:	2 – 3 vrk jääkaapissa, pidempiaikainen pakastettuna. Lähetys huoneenlämmössä. Vastaus valmiina kolmen viikon kuluessa.
Menetelmä:	Epäsuoraimmunofluoresenssi
Viiteväli:	Normaalisti negatiivinen. Tulos annetaan lausuntona.
Tulkinta:	Tutkimuspaketin tulos annetaan lausuntona, jossa vasta-ainemääritysten tulos ilmoitetaan kvalitatiivisena (positiivinen/negatiivinen). Positiivinen tulos ilmoitetaan myös kvantitatiivisena arvona.
Paketin sisältö:	Tutkimuspaketti sisältää seuraavat vasta-ainemääritykset: Hu, Ri, ANNA3, Yo, Tr/DNER, myeliini, Ma/Ta, GAD65, amfifysiini, akvaporiini 4, NMDA-reseptori, AMPA-reseptori, GABA-a-reseptori, GABA-b-reseptori, LGI1, CASPR2, Zic4, DPPX, glysiinireseptori, mGluR1, mGluR5, Rho-GTPaasin aktivaatioproteiini 26, ITPR1, homer 3, MOG, rekoveriini, neurokondriini, GluRD2, flotilliini, IgLON5, CARPVIII, neurexin-3a, ERC1, Sez6I2, AP3B2, kontaktiini 1, neurofaskiini 155, neurofaskiini 186, AT1A3, KCNA2, dopamiinireseptori 2. Tutkimukset siirretään tehtäväksi alihankintaan Labor Winfried Stöckerille Saksaan. Aikaisemmin näytteet kulkeneet Huslabin kautta, nyt lähetämme suoraan Saksaan.

Muutokset koskevat niitä tutkimuksia, joiden pyyntöpäivä on 3.8.2020 ja siitä eteenpäin.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi

Tiedustelut

Ammattilaisten palvelupuhelin 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Muutos Autoimmuunienkefaliitti vasta-ainepaketeissa 3.8.2020 alkaen

23.7.2020

Laboratoriotiedote 84/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi

Autoimmuunienkefaliitti, vasta-aineet

21780 S -EnkefAb	Autoimmuunienkefaliitti, vasta-aineet seerumista
21781 Li-EnkefAb	Autoimmuunienkefaliitti, vasta-aineet likvorista

Alihankintalaboratorion vaihdos 3.8.2020 alkaen. Muutos vaikuttaa paketin sisältöön.

Näyte:	2 ml seerumia (mininimimäärä 1 ml seerumia) 2 – 3 ml likvoria
Säilytys:	2 – 3 vrk jääkaapissa, pidempiaikainen pakastettuna. Lähetys huoneenlämmössä. Vastaus valmiina kolmen viikon kuluessa.
Vanha menetelmä:	Epäsuoraimmunofluoresenssi
Vanha viiteväli:	Normaalisti negatiivinen. Tulos annetaan lausuntona
Vanha paketin sisältö:	AMPA-reseptorit 1 ja 2, CASPR2, DPPX, GABA B-reseptori, LGI-1, NMDA-reseptori ja VGKC.
Uusi menetelmä:	Epäsuoraimmunofluoresenssi
Uusi viiteväli:	Normaalisti negatiivinen. Tulos annetaan lausuntona.
Tulkinta:	Tutkimuspaketin tulos annetaan lausuntona, jossa vasta-ainemääritysten tulos ilmoitetaan kvalitatiivisena (positiivinen/negatiivinen). Positiivinen tulos ilmoitetaan myös kvantitatiivisena arvona.
Uusi paketin sisältö:	Tutkimuspaketti sisältää seuraavat vasta-ainemääritykset: Hu, Ri, ANNA3, Yo, Tr/DNER, myeliini, Ma/Ta, GAD65, amfifysiini, akvaporiini 4, NMDA-reseptori, AMPA-reseptori, GABA-a-reseptori, GABA-b-reseptori, LGI1, CASPR2, Zic4, DPPX, glysiinireseptori, mGluR1, mGluR5, Rho-GTPaasin aktivaatioproteiini 26, ITPR1, homer 3, MOG, rekoveriini, neurokondriini, GluRD2, flotilliini, IgLON5, CARPVIII, neurexin-3a, ERC1, Sez6I2, AP3B2, kontaktiini 1, neurofaskiini 155, neurofaskiini 186, AT1A3, KCNA2, dopamiinireseptori 2 Tutkimukset siirretään tehtäväksi Labor Winfried Stöckerille Saksaan.

Muutokset koskevat niitä tuloksia, joiden pyyntöpäivä on 3.8.2020 ja siitä eteenpäin.

Akuuttien tutkimuspakettien, 23031 Li-AkEnkef ja 23032 S -AkEnkef lähetyspaikkana on edelleen Svar, Ruotsi.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi

Tiedustelut

Ammattilaisten palvelupuhelin 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

U -CtNgNhO ja -CtGcNhO -tutkimusten näytteenottovälineet muuttuvat kesän 2020 aikana

24.6.2020

Laboratoriotiedote 73/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

4816 U -CtNgNhO Chlamydia trachomatis ja Neisseria gonorrhoeae, nukleiinihappo (kval), virtsa

1738 -CtGcNhO Chlamydia trachomatis ja Neisseria gonorrhoeae, nukleiinihappo (kval), muut näytelaadut

Cobas® PCR Urine Sample Kit -putkea käytetään virtsanäytteille.

Ennen näytteen ottamista potilaan tulisi olla virtsaamatta vähintään 2 tuntia. Alapesua ei tule suorittaa ennen näytteenottoa. Näytteeksi otetaan n. 50 ml alkuvirtsaa puhtaaseen muoviastiaan. Alkuvirtsasta siirretään näytteenottopakkauksen pipetillä virtsaa pakkauksen putkeen, kunnes nestepinta on putkeen merkityn ikkunan puolessa välissä. HUOM! Putkea ei saa täyttää liian täyteen.

Cobas PCR Media Dual Swab Sample Packet -tarvikkeita käytetään vagina-, nielu-, rectum-, silmä- ja urethranäytteille. Näistä silmä- ja urethranäytteet eivät ole testivalmistajan validoimia näytelaatuja.
Näytteenottopakkaus sisältää kaksi (2) tikkua, joista toinen on paksu vanupuikko ja toinen on pienempi ja pehmeämpi näytteenottotikku.

Silmä- ja urethranäytteille käytetään pienempää tikkua. Vagina-, rectum- ja nielunäytteet otetaan paksummalla vanupuikolla. Kohdunkaulakanavanäytteissä lima poistetaan aluksi paksummalla vanupuikolla ja varsinainen näyte otetaan ohuemmalla tikulla.

Siirtymäaikana voi eri toimipisteissä olla jonkin aikaa käytössä myös vanhoja Abbott Multi Collect -näytteenottovälineitä. Tutkimusohjekirjassa on toistaiseksi näytteenotto-ohjeet sekä vanhoille että uusille näytteenottovälineille. Uusien näytteenottovälineiden mukana toimitetaan tarkempi ohje näytteenotosta.

Tapio Seiskari, mikrobiologian erikoisalajohtaja

Tulosta

Syvämärkäviljelyn (Pu- BaktVi1) suositellut näytteenottoastiat

12.6.2020

Laboratoriotiedote 72/2020 • Päijät-Häme

Syvämärkäviljelytutkimuksen (3491 Pu-BaktVi1) näytteenottoon suositellaan käytettäväksi seuraavia näyteastioita:

Anaerobikuljetuspullo (esim. Portagerm^RK500450 ): Kaikki nestemäiset näytteet esimerkiksi nivelneste, pleuraneste, märkänäyte vatsaontelosta, abskessi sijainnista riippumatta, muut nestemäiset steriilin tai ei- steriilin alueen näytteet.

Erikoistapauksissa (nivelnesteet lapsilla) voidaan käyttää aerobiveriviljelypulloa. Huom. Veriviljelypulloa käytettäessä vastausviive on pidempi, kuin anaerobikuljetuspulloa käytettäessä.

eSwab- putki (K705497): Kiinteät näytteet, kuten kudos- ja luupalat. Vaihtoehtoisesti nämä voidaan lähettää kostean harsotaitoksen sisällä tehdaspuhtaassa/steriilissä purkissa, mikäli näyte saadaan tutkivaan laboratorioon saman päivän kuluessa.

Anaerobikuljetuspulloon, eSwab- putkeen tai steriiliin harsotaitokseen otetusta näytteestä tehdään tutkimukseen sisältyvä gramvärjäys. Mikäli näyte on otettu tikkuun (ei suositeltava näytteenottotapa syvämärkänäytteille), gramvärjäystä ei tehdä.

Huom. Kanyylien ja katetrien kärjistä tehtävät bakteeriviljelytutkimukset pyydetään 15.6. alkaen tutkimusnumerolla 4753 Ca-BaktVi. Kanyylin/katetrin kärki otetaan tehdaspuhtaaseen/steriiliin purkkiin.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 3117 7800

Tapio Seiskari, Erikoisalajohtaja
Hannu Sarkkinen, Ylilääkäri

Tulosta

Fimlabille jättiapuraha koronatutkimukseen

26.5.2020

Tampereen tuberkuloosisäätiö on päättänyt myöntää Fimlab Laboratoriot Oy:lle 0,5 miljoonan euron suuruisen apurahan COVID-19 -infektion diagnostiikkaa koskevaan tutkimukseen ja -tuotekehitykseen.

Apuraha myönnettiin tutkimukseen, jonka tavoitteena on tutkia koronaviruksen diagnostiikan vaikuttavuutta ja kustannustehokkuutta. Hankkeessa pyritään paitsi arvioimaan erilaisten diagnostisen menetelmien toimivuutta myös optimoimaan diagnostinen polku epidemian mahdollisten myöhempien aaltojen torjumiseksi. Tutkimus- ja kehitystyö tehdään yhteistyössä Tampereen yliopistollisen sairaalan ja Tampereen yliopiston kanssa.

Koronaviruksen käyttäytymistä ja olemassa olevien testien toimivuutta ei vielä tarpeeksi tunneta. Kyseessä on merkittävä ja tärkeä panostus täysin uuden taudin diagnostiikkaa koskevaan tutkimukseen.

Fimlabin toimitusjohtaja Ari Miettinen

– Ulkopuolisen tutkimusrahoituksen merkitys korostuu erityisesti nyt, kun koronakriisin johdosta terveydenhuollon talous on poikkeuksellisella koetuksella, Miettinen kiittelee.

Tutkimustulokset auttavat kehittämään Suomen terveydenhuollon kykyä torjua epidemian mahdollisia myöhempiä aaltoja ja myös muita pandemioita.

– Markkinoilla olevista erilaisista koronavirustesteistä kertyvää aineistoa analysoidaan jo tämän vuoden aikana. Dataa pyritään rinnastamaan esimerkiksi THL:n tietoihin siitä, mikä osuus väestöstä on testattu sekä tietoihin sairastuvuudesta ja kuolleisuudesta, kertoo osastonylilääkäri, dosentti Janne Aittoniemi.

Päämääränä on optimoida koko diagnostiikkaprosessi aina näytteenotosta siihen asti, kun tiedot päätyvät asiakkaille ja lääkäreille.

– Tavoite on, että terveydenhuollolla on käytettävissään tutkitusti parhaat menetelmät ja toimintamallit kustannustehokkaaseen ja vaikuttavaan toimintaan, sanoo ylilääkäri Tapio Seiskari.

Tampereen tuberkuloosisäätiön tarkoitus on tukea tieteellistä tuberkuloosin ja hengityselinsairauksien tutkimustyötä Suomessa. Lahjoituksessa yhdistyvät säätiön tarkoitus ja tutkijoiden edellytykset käytännönläheiseen ja taudin vastustamistyötä välittömästi hyödyttävään tutkimukseen.

– Säätiön myöntämillä apurahoilla on merkittävä vaikutus hengityselinsairauksien tieteellisen tutkimustyön edistämisessä varsinkin Pirkanmaalla, jonne pääosa säätiön rahoituksesta suuntautuu. Myönnetty apuraha on säätiön 65-vuotisen historian selvästi suurin. Säätiö haluaa tällä apurahalla tukea Fimlabin merkittävää ja ajankohtaista tutkimushanketta koronaviruksen aiheuttaman vakavan pandemian torjunnassa, sanoo Tampereen tuberkuloosisäätiön puheenjohtaja Markku Lilja.

Tulosta

COVID-19 tautia aiheuttavan viruksen toteamiseen perustettu uusi tutkimusnimike

22.5.2020

Laboratoriotiedote 60/2020 • Keski-Suomi

26466, -NCovNhO, COVID-19 (SARS-CoV-2) NUKLEIINIHAPPO (KVAL)

Koronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), on pandeeminen virus, joka aiheuttaa COVID-19-tautia. Fimlabin Tampereen yksikössä on käytössä PCR-menetelmä viruksen osoittamiseksi (6466 -CV19NhO). Tätä tutkimusta täydennetään maanantaista 25.5. alkaen Keski-Suomessa vastaavalla tutkimuksella -NCoVNhO (26466), jonka tekopaikka on Keski-Suomen keskussairaalan laboratorio. Kumpikin tutkimuksista perustuu samaan menetelmään, virus-RNA:n osoittamiseen hengitystienäytteistä käänteiskopiointi-PCR-menetelmällä.

Keski-Suomen tutkimuskapasiteetti on rajallinen ja tästä syystä uudella tutkimusnumerolla 26466 -NCovNhO tehtävät pyynnöt tulee tehdä pääsääntöisesti sairaalahoitoon joutuvilta, kiireellisiltä potilailta erillisen infektiolääkärien ohjeistuksen mukaisesti. Muut näytteet tutkitaan Fimlabin Tampereen yksikössä tutkimusnumerolla 6466 -CV19NhO. Uutta 26466 -NCovNhO -tutkimusta tehdään mikrobiologian laboratorion aukioloaikoina.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03-311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja
Jaakko Uksila, ylilääkäri

Tulosta

S -COVID-19 -koronavirustauti, vasta-aineet -tutkimus on otettu käyttöön

18.5.2020

Laboratoriotiedote 55/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

S -COVID-19 -koronavirustauti, vasta-aineet (KL 6476 S -CV19Ab) -tutkimus on otettu käyttöön. Tutkimuksen vastausmuoto on kvalitatiivinen (POS, POS/NEG tai NEG), ja tulokseen liitetään lausunto. Tutkimusta tehdään 2-5 kertaa viikossa.

COVID-19-vasta-aineita muodostuu vereen yleensä 3 viikon kuluessa tartunnasta/oireiden alkamisesta. Täten testitulos kertoo, onko potilas sairastanut COVID-19-taudin. Positiivisen tuloksen perusteella ei voi kuitenkaan päätellä, onko henkilö suojassa uudelta tartunnalta, koska toistaiseksi ei tiedetä, millainen immuniteetti on suojaava ja kuinka pitkään.

Koska sairastettu COVID-19-tauti on Suomessa toistaiseksi ilmeisen harvinainen ja testitulokseen liittyy väärien positiivisten ja negatiivisten tuloksen mahdollisuus, tuloksen tulkinnassa on noudatettava varovaisuutta. Tutkimus soveltuu lähinnä epidemiologisten tilanteiden selvittelyyn ja seroepidemiologiseen seurantaan. Yksittäisen potilaan kohdalla vasta-ainetestiä voidaan käyttää harkiten apuna epäselvän ja/tai pitkittyneen diagnostisen tilanteen selvittelyssä. Vasta-ainetesti ei sovellu tuoreen infektion diagnostiikkaan.

Lisätiedot

Janne Aittoniemi, etunimi.sukunimi@fimlab.fi, p. 03-311 76012

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03-311 77800

Tapio Seiskari
ylilääkäri, erikoisalajohtaja

Tulosta

COVID-19 tautia aiheuttavan viruksen toteamiseen perustettu uusi tutkimusnimike

15.5.2020

Laboratoriotiedote 54 • Kanta-Häme

23077, -RMikNhO, Respiratorinen SARS-CoV-2 -paneeli, nukleiinihapon osoitus, QIAstat-Dx

Koronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), on vaipallinen virus, jolla on yksisäikeinen RNA geneettisenä materiaalina. Virus aiheuttaa laajan skaalan hengitystieinfektioita hyvin lievästä flunssatyyppisestä taudista vakaviin, henkeä uhkaaviin keuhkokuumeisiin ja happeutumishäiriöihin.

Koronaviruksen, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), olemassaolo potilaassa voidaan todeta todentamalla viruksen RNA:ta hengitysteiden näytteistä PCR-menetelmällä.

Fimlabin Tampereen yksikössä on käytössä PCR-menetelmä viruksen osoittamiseksi (6466 -CV19NhO). Tätä tutkimusta täydentämään otetaan nyt myös Fimlabin Kanta-Hämeen yksikössä käyttöön vastaava menetelmä viruksen osoittamiseksi (23077 -RMikNhO).

SARS-CoV-2 viruksen lisäksi PCR-paneeli tunnistaa Adeno-, Boka-, Ihmisen metapneumo-, Influenssa A ja B-, korona-, Parainfluenssa-, Pikorna-, RS-virukset sekä Bordetella pertussis-, Mycoplasma pneumoniae– ja Legionella pneumoniae -bakteerit, jotka vastataan erikseen lausunnossa.

Kanta-Hämeen tutkimuskapasiteetti on rajallinen ja tästä syystä uudella tutkimusnumerolla 23077 -RMikNhO tehtävät pyynnöt tulee tehdä infektiolääkärin harkinnan mukaan. Muut näytteet tutkitaan Fimlabin Tampereen yksikössä tutkimusnumerolla 6466 -CV19NhO.

Tutkimus otetaan käyttöön 18.05.2020 alkaen ja se on tilattavissa joka päivä klo 8-19 välisenä aikana.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800

Tapio Seiskari, Erikoisalajohtaja

Tulosta

Muutoksia mikrobiologisissa tutkimuksia 14.5.2020 alkaen

12.5.2020 • Tiedote päivitetty: 15.5.2020

Laboratoriotiedote 53/2020 • Päijät-Häme

1153 B-Baktvi, Bakteeri, viljely (verestä)

Veriviljelypullot inkuboidaan ja seulotaan veriviljelyautomaatilla Päijät-Hämeessä. Lisäksi veriviljelyautomaatin ensimmäisestä positiiviseksi ilmoittamasta pullosta tehdään gramvärjäys ja alustava mikrobitunnistus FilmArray Blood Culture Identification (BCID) Paneelilla multiplex-PCR-menetelmällä.

FilmArrayn BDID-tunnistuspaneeli kattaa useimmat stafylokokki-, enterokokki- streptokokki-, enterobakteeri- ja Candida-sukujen lajit sekä Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Listeria monocytogenes, Haemophilus influenzae -lajit. Tunnistuspaneeli kattaa noin 90 % kaikista Suomessa esiintyvistä veriviljelylöydöksistä. FilmArray BCID-paneeli ei tunnista anaerobibakteereita, eikä harvinaisempia mikrobilöydöksiä. Alustava vastaus saadaan pääsääntöisesti saman tai seuraavan päivän aikana.

Tämän jälkeen veriviljelypullot lähetetään Tampereelle, missä alustava tunnistus varmistetaan jatkoviljelyllä ja samalla määritetään mikrobilääkeherkkyys. HUOM. Jatkoviljelyn poikkeavat tulokset eivät enää nouse *-merkinnällä.

Näytteenotto-ohjeet löytyvät osoitteesta www.fimlab.fi

9021 F-BaktNhO, Bakteeri, nukleiinihapon osoitus (Salmonella, Shigella, Kampylo, Yersinia), ulosteesta

9021 F-BaktNhO tutkimus tehdään edelleen Päijät-Hämeessä reaaliaikaisella PCR-menetelmällä. Jos F-BaktNhO antaa positiivisen tuloksen, näyte lähetetään Tampereelle jatkoviljelyyn löydöksen mukaisesti

2608 F -Salmonella, viljely
2620 F -Shigella, viljely
2989 F -Yersinia, viljely
2021 F -Kampylobakteeri, viljely

3952 F-HepyAg, Helicobacter pylori, antigeeni ulosteesta

Tutkimus siirtyy tehtäväksi Tampereen toimintayksikköön. Näyteastiaksi vaihtuu tiivis, mahdollisuuksien mukaan ei-lusikallinen, ulostepurkki. Kyseistä purkkia hoitoyksiköt voivat tilata laboratoriosta.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja
Hannu Sarkkinen, ylilääkäri

Varaa aika netissä

Varaa aika puhelimitse

Laboratoriotiedote 109/2020 • Päijät-Häme

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 108/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 104/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 104/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 95/2020 • Päijät-Häme

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 90/2020 • Päijät-Häme

4949 S -IgLcV

4237 U -Legi-O

Samalla Päijät-Hämeen tutkimusvalikoimasta poistuu tutkimuksia vähäisen kysynnän vuoksi:

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 88/2020 • Pohjanmaa/Österbotten

Ytterligare information:

Laboratoriotiedote 88/2020 • Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot:

Laboratoriemeddelande 86/2020 • Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Autoimmun encefalit, antikroppar

Tilläggsinformation

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 85/2020 • Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Autoimmuunienkefaliitti, vasta-aineet

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 84/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi

Autoimmuunienkefaliitti, vasta-aineet

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 73/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Laboratoriotiedote 72/2020 • Päijät-Häme

Tiedustelut

Koronaviruksen käyttäytymistä ja olemassa olevien testien toimivuutta ei vielä tarpeeksi tunneta. Kyseessä on merkittävä ja tärkeä panostus täysin uuden taudin diagnostiikkaa koskevaan tutkimukseen.

Laboratoriotiedote 60/2020 • Keski-Suomi

26466, -NCovNhO, COVID-19 (SARS-CoV-2) NUKLEIINIHAPPO (KVAL)

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 55/2020 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 54 • Kanta-Häme

23077, -RMikNhO, Respiratorinen SARS-CoV-2 -paneeli, nukleiinihapon osoitus, QIAstat-Dx

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 53/2020 • Päijät-Häme

1153 B-Baktvi, Bakteeri, viljely (verestä)

9021 F-BaktNhO, Bakteeri, nukleiinihapon osoitus (Salmonella, Shigella, Kampylo, Yersinia), ulosteesta

3952 F-HepyAg, Helicobacter pylori, antigeeni ulosteesta

Lisätiedot

Tiedustelut