Mikrobiologia - Page 9 of 17

Keski-Suomi: Laboratorion valikoimasta 1.8.2022 alkaen poistuva tutkimus: Ps-Streptococcus pyogenes (A), antigeeni

25.7.2022 • Tiedote päivitetty: 22.7.2022

Laboratoriotiedote 85/2022 • Keski-Suomi

Laboratoriossa tehtävä nielun Streptococcus pyogenes (A), antigeeni -tutkimus (Ps-StrAAg) poistuu Fimlabin valikoimasta Keski-Suomen alueella vähäisen käytön vuoksi 1.8.2022 alkaen.

Fimlab tukee edelleen hoitoyksiköiden vieritoimintanaan tekemää StrAAg-diagnostiikkaa, jolloin tutkimus palvelee Käypä hoito -suosituksen mukaista käyttöä vastaanottokäyntien yhteydessä hoitopäätökseen vaikuttavana pikatestinä. Mikrobiologinen diagnostiikka vaatii aina terveydenhuollon yksikkökohtaisen toimiluvan.

Poistuva tutkimus voidaan tarvittaessa korvata olemassa olevalla nielun streptokokkiviljelyllä (tiedot alla).

2703, Ps-StrVi	STREPTOCOCCUS, VILJELY (hemolyytt. streptokokit nielusta)
Menetelmä:	Bakteeriviljely, bakteerin tunnistus ja herkkyysmääritys.
Näytetiedot:	Näytteenottotikulla pyyhkäistään molempien nielurisojen pintaa ja takanielua. Näytetikku laitetaan kuljetusgeeliputkeen (HUOM! Tikkua EI SAA katkaista). Näyte säilytetään jääkaappilämpötilassa ja kuljetetaan kylmäkuljetuksena.
Tulos valmiina:	1 – 3 vrk:n kuluessa näytteen saapumisesta.
Tulkinta:	Streptococcus pyogenes ryhmä A on selvä patogeeni. Sitä löytyy tosin terveiltäkin ihmisiltä jonkin verran. Määrä lisääntyy epidemian aikana. Runsasta C- ja G-ryhmän beetahemolyyttisten streptokokkien kasvua pidetään mahdollisesti merkitsevänä löydöksenä.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800.

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Päijät-Häme: Nielun streptokokkien nukleiinihapon osoitusta ei tehdä toistaiseksi testien toimitusvaikeuksista johtuen

14.7.2022

Laboratoriotiedote 83/2022 • Päijät-Häme

Nielun streptokokkien nukleiinihapon osoitusta ei tehdä toistaiseksi testien toimitusvaikeuksista johtuen:

Muutos koskee tutkimusta 23309 Ps -StrNhO, Streptococcus A, C, G, osoitus (kval.)

Korvaava tutkimus on 2703 Ps -StrVi, Streptococcus, viljely (hemolyytt. streptokokit nielusta)

Viljelytutkimusta tehdään normaalisti. Näyte otetaan kuljetusgeeliputkeen. Tulos valmistuu 1-3 vrk:n kuluessa näytteen saapumisesta laboratorioon.

Tarkemmat tiedot tutkimuksesta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Lifecare-beställare på Jakobstads område: Ändringar i urincellanalyser och bakterieodlingar fr.o.m. 23.6.2022

7.7.2022

Laboratoriemeddelande 82/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Svarssättet för undersökningarna celler i urin 0141 U-Solut och bakterieodling 1155 U-BaktVi beställda på Fimlab Jakobstads Lifecare-område förenligades 23.6.2022 och analysstället ändrades från Jakobstads laboratorium till Vasa centralsjukhus kliniska laboratorium. Transporten från Jakobstad till Vasa går vardagar kl. 9:45 och 13:45 samt lördagar och söndagar kl. 12.

0141 U- Solut, grundanalys av urinceller

Kliniska användningssyften för basanalysen av partiklar i urin är identifikation och uppföljning av njur- och nedre urinvägssjukdomar. Bakterierna som analyseras i U-Solut undersökningen svaras i framtiden på följande sätt:

U-BAKT-resultat under 70 st/µl svaras NEG (tidigare svarat .)
U-BAKT-resultat 70 – 4200 st/µl svaras RAJA-ARVO (tidigare svarat +/++/+++)
U-BAKT-resultat över 4200 st/µl svaras RUNS

1155 U- BaktVi, urinbakterieodling

Svarssätt ändras för kvinnor, män och barn och följande svar och utlåtanden ges på basen av partikelscreening:

När resultaten är under screeninggränsen för bakterieodling:
U- BaktVi resultat: NEG
Utlåtande: Bakteeri- ja leukosyyttilaskentaan perustuva seulonta negatiivinen, näytettä ei viljellä.
När screeninggränsen överskrids:
U- BaktVi resultat: Viljelyyn
Utlåtande: Bakteeri- tai leukosyyttilaskennan seulontarajat ylittyvät, näyte ohjattu viljelyyn.

Resultat genererar automatiskt en tilläggsodlingsbegäran 3777 U-BaktJVi, som odlas på skål och resultatet svaras som tidigare.

I framtiden screenas prov på kvinnor, män och barn (under 16 år) före skålodling vilket avviker från tidigare tillvägagångssätt. Det innebär snabbare negativa resultat för kvinnor, män och barn. Screeninggränserna baseras på kön och ålder samt bakterie- och leukocytmängd.

För specialgrupper (urologiska patienter, njurpatienter, intensivvårdspatienter och patienter med svår neutropeni) begärs som tidigare 1787 U -BaktEVi.

Av grundurinundersökningarna används kemisk basanalys av urin (1881 U-KemSeul) som dejourundersökning och den kan fortfarande beställas som brådskande i Fimlab Jakobstads laboratorium.

Tilläggsuppgifter

Noggrannare information om undersökningen och tolkning av resultat kan ses från den elektroniska laboratoriehandboken http://www.vshp.fi/medserv/.

Tulosta

Pietarsaaren alueen Lifecare-tilaajat: Virtsan soluissa ja bakteeriviljelyssä muutoksia 23.6.2022 lähtien

7.7.2022

Laboratoriotiedote 82/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Fimlab Pietarsaaren Lifecaren käyttöalueella pyydettävät virtsan solujen 0141 U-Solut ja 1155 U-BaktVi bakteeriviljelyn vastaustavat muuttuivat yhtenäisemmiksi 23.6.2022 ja tekopaikka vaihtui Pietarsaaren laboratoriosta Vaasan keskussairaalan kliiniseen laboratorioon. Pietarsaaresta Vaasaan näytekuljetus lähtee arkena klo 9:45 ja 13:45 sekä lauantaisin ja sunnuntaisin klo 12.

0141 U- Solut, virtsan solujen peruserittely

Virtsan partikkelien peruslaskennan kliinisiä käyttöaiheita ovat munuaissairauksien ja alempien virtsateiden sairauksien toteaminen ja seuranta. U-Solut tutkimuksen osana ilmoitetut bakteerit vastataan jatkossa:

U-BAKT-tulos alle 70 kpl/µl on NEG (aiemmin vastattu .)
U-BAKT-tulos 70 – 4200 kpl/µl on RAJA-ARVO (aiemmin vastattu +/++/+++)
U-BAKT-tulos yli 4200 kpl/µl on RUNS

1155 U- BaktVi, virtsan bakteeriviljely

Vastaustapamuutos naisille, miehille ja lapsille, virtsan partikkeliseulonnan perusteella annetaan seuraavat vastaukset ja lausunnot:

Kun tulokset ovat alle bakteeriviljelyn seulontarajojen:
U- BaktVi vastaus: NEG
Lausunto: Bakteeri- ja leukosyyttilaskentaan perustuva seulonta negatiivinen, näytettä ei viljellä.
Kun seulontarajat ylittyvät:
U- BaktVi vastaus: Viljelyyn
Lausunto: Bakteeri- tai leukosyyttilaskennan seulontarajat ylittyvät, näyte ohjattu viljelyyn.

Tuloksesta generoituu automaattisesti jatkoviljelypyyntö 3777 U-BaktJVi, joka viljellään maljalle ja tulos vastataan kuten aikaisemmin.

Edellisestä käytännöstä poiketen jatkossa seulotaan naisten, miesten ja lasten (alle 16v) näytteet ennen maljaviljelyä. Tämä tarkoittaa entistä nopeampaa negatiivista vastausta naisten, miesten ja lasten osalta. Seulontarajat perustuvat sukupuoleen, ikään, sekä bakteeri- ja leukosyyttimäärään.

Erityisryhmille (urologiset potilaat, munuaispotilaat, tehohoitopotilaat ja syvässä neutropeniassa olevat potilaat) pyydettävä jatkossakin erikoisviljely 1787 U -BaktEVi.

Virtsan perustutkimuksista virtsan kemiallista perusseulontaa (1881 U-KemSeul) käytetään päivystystutkimuksena ja se on edelleen saatavilla kiireellisenä Fimlab Pietarsaaren laboratoriosta.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksesta ja sen tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta http://www.vshp.fi/medserv/.

Tulosta

Päijät-Häme: Muistutus veriviljelyvastaamisen käytännöistä

31.5.2022

Laboratoriotiedote 74/2022 • Päijät-Häme

Muistutus Fimlabin Lahden laboratorion veriviljelyvastaamisesta:

Positiivinen veriviljelyseulonnan tulos vastataan heti pullon tullessa positiiviseksi. Suurimmassa osassa positiivisista veriviljelyistä näin tapahtuu kahden vuorokauden sisällä näytteenotosta, mutta osassa näytteistä kasvu ilmenee hitaammin. Mikäli kasvua ei ilmene, veriviljelypulloja kasvatetaan 5 vrk (tai erityistapauksissa osaston pyynnöstä 10 vrk), jonka jälkeen ne vastataan negatiivisina.

Positiivinen seulonta johtaa jatkoviljelyyn, josta vastaus saadaan joitakin päiviä myöhemmin (yleensä 1-2 vrk, joskus pidempään), riippuen bakteerin kasvunopeudesta.

Negatiivista välitulosta ei anneta tutkimuksen ollessa kesken. Eli jos positiivista löydöstä ei ole vastattu, on tulos toistaiseksi negatiivinen, kunnes tulos vastataan viimeistään 5 vrk kasvatuksen jälkeen.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800.

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Österbotten: En ny PCR-undersökning för påvisning av avföringspatogener tas i bruk i Vasa fr.o.m. 12.5.2022

12.5.2022

Laboratoriemeddelande 62/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Den nya undersökningen 23349 F-MikrNhO tas i bruk i Vasa fr.o.m. 12.5.2022. Inledningsvis är undersökningen endast beställbar vid Vasa centralsjukhus och rekommenderas användas endast i brådskande fall. Undersökningen är en kvalitativ multiplex-PCR-undersökning som påvisar följande tarminfektionsorsakande virus, bakterier och parasiter ur avföringsprov:

Parasiter (ParaNhO): Entamoeba histolytica, Cryptosporidium spp., Giardia lamblia, Cyclospora cayetanensis

Bakterier (BaktNhO): Vibrio vulnificus, V. parahaemolyticus, V. cholerae, Campylobacter spp. (innehåller. C. jejuni, C. upsaliensis, C. coli), Salmonella spp., Clostridioides difficile (tcdA/tcdB), Yersinia enterocolitica, enterotoxigen Escherichia coli (ETEC), enteropatogen E. coli (EPEC), enteroaggregativ E. coli (EAEC), Shiga-liknande toxinproducerande E. coli (STEC [enterohemorragisk E. coli]), Shiga-toxinproducerande E. coli (STEC) -serotyp O157:H7, enteroinvasiv E. coli (EIEC)/Shigella, Plesiomonas shigelloides

Virus (VirusNhO): Humant adenovirus F40/F41, Norovirus GI, Norovirus GII, Rotavirus A, Astrovirus, Sapovirus GI, GII, GIV ja GV.

23349 F-MikrNhO	F-Mikrober, nukleinsyra (kval)
Metod:	Kvalitativ nukleinsyrapåvisningsundersökning (RT-PCR)
Indikation:	I brådskande fall vid misstanke om tarminfektion, speciellt hos resenärer och flyktingar, och för en omfattande etiologisk utredning av oklara tarmsymptom.
Provinformation:	Avföring (särskilt blodig eller slemmig avföring) tas i en avföringsprovburk. Provburken förpackas i en förslutningsbar plastpåse. Provet ska levereras till laboratoriet så snabbt som möjligt efter provtagning för att många avföringspatogener dör vid lång förvaring. Provet förvaras vid behov i kylskåp och levereras med kyltransport till laboratoriet.
Färdigt resultat:	Undersökningen utförs under mikrobiologiska laboratoriets öppethållningstider.
Tolkning:	Ett positivt resultat tyder på infektion orsakad av avföringspatogenen i fråga. Vissa positiva bakteriefynd (Yersinia enterocolitica, Salmonella spp., Campylobacter spp. och EHEC/STEC-fynd) svaras först preliminärt och bekräftas med odling.

Tilläggsinformation

För mera detaljerad information om undersökningar och tolkningen av resultaten kan ni konsultera den elektroniska laboratoriehandboken: http://www.vshp.fi/medserv/klkemi/search.asp

Roosa Jämsén, sjukhusmikrobiolog

Tapio Seiskari, direktör för specialområdet

Tulosta

Pohjanmaa: Uusi PCR-tutkimus ulostepatogeenien osoittamiseen otetaan käyttöön Vaasassa 12.5.2022 alkaen

12.5.2022

Laboratoriotiedote 62/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Uusi tutkimus 23349 F-MikrNhO otetaan käyttöön Vaasan toimipisteessä 12.5.2022 alkaen. Tutkimus on aluksi tilattavissa vain Vaasan keskussairaalassa ja sitä on suositeltavaa käyttää ainoastaan kiireistä selvittelyä vaativissa tapauksissa. Tutkimus on kvalitatiivinen multiplex-PCR-tutkimus, jolla voidaan osoittaa ulostenäytteestä seuraavia suolistoinfektiota aiheuttavia viruksia, bakteereita ja parasiitteja:

Parasiitit (ParaNho): Entamoeba histolytica, Cryptosporidium spp., Giardia lamblia, Cyclospora cayetanensis

Bakteerit (BaktNhO): Vibrio vulnificus, V. parahaemolyticus, V. cholerae, Campylobacter spp. (sis. C. jejuni, C. upsaliensis, C. coli), Salmonella spp., Clostridioides difficile (tcdA/tcdB), Yersinia enterocolitica, enterotoksigeeninen Escherichia coli (ETEC), enteropatogeeninen E. coli (EPEC), enteroaggregatiivinen E. coli (EAEC), Shigan kaltaista toksiinia tuottava E. coli (STEC [enterohemorraginen E. coli]), Shiga-toksiinia tuottava E. coli (STEC) -serotyyppi O157:H7, enteroinvasiivinen E. coli (EIEC)/Shigella, Plesiomonas shigelloides

Virukset (VirusNhO): Ihmisen adenovirus F40/F41, Norovirus GI, Norovirus GII, Rotavirus A, Astrovirus, Sapovirus GI, GII, GIV ja GV.

23349 F-MikrNhO	F-Mikrobit, nukleiinihappo (kval)
Menetelmä:	Kvalitatiivinen nukleiinihaponosoitustutkimus (RT-PCR)
Indikaatiot:	Kiireistä selvittelyä edellyttävä suolistoinfektioepäily erityisesti matkailijoilla ja pakolaisilla, myös epäselvien suolisto-oireiden laaja-alainen etiologinen selvittely.
Näytetiedot:	Ulostetta ulostenäytepurkissa, erityisesti verinen tai limainen uloste. Näytepurkki pakataan suljettavaan muovipussiin. Näyte tulee toimittaa laboratorioon mahdollisimman pian näytteenoton jälkeen, koska monet ulostepatogeenit kuolevat pitkään säilytettäessä. Näyte säilytetään tarvittaessa jääkaapissa ja toimitetaan laboratorioon kylmäkuljetuksena.
Tulos valmiina:	Tutkimusta tehdään mikrobiologian laboratorion aukioloaikoina.
Tulkinta:	Positiivinen tulos viittaa ko. ulostepatogeenin aiheuttamaan infektioon. Tietyt positiiviset bakteerilöydökset (Yersinia enterocolitica, Salmonella spp., Campylobacter spp. ja EHEC/STEC-löydökset) vastataan ensin alustavana ja varmistetaan viljelemällä.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta: http://www.vshp.fi/medserv/klkemi/search.asp

Roosa Jämsén, sairaalamikrobiologi

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Österbotten: Provtagningsstickorna till snabbtestet för A-streptokocker från svalget ändrar

21.4.2022

Laboratoriemeddelande 53/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Provtagningsstickorna till snabbtestet för A-streptokocker från svalget (undersökning 3635 Ps-StrAAg) byts ut på grund av undersökningens metodförändring. I fortsättningen ska svalgproverna tas med de sterila bomullsprovtagningsstickorna som medföljer i testförpackningen. Övriga provtagningsstickor passar inte för undersökningen. Provtagningsstickorna fås från laboratoriet.

Efter svalgprovtagningen bryts stickan av i ett fabriksrent rör och provet levereras till laboratoriet. Fördelen med snabbdiagnostik fås endast om undersökningen görs så fort som möjligt. I övriga fall beställs en svalgodling (undersökning 2703 Ps-StrVi) som också påvisar infektioner orsakade av andra streptokocker.

3635 Ps-StrAAg	*Streptococcus pyogenes* (A), antigen
Metod:	Kvalitativt immunokromatografiskt snabbtest.
Indikation:	Snabbdiagnostik för påvisning av tonsillit orsakad av Streptococcus pyogenes (grupp A).
Provinformation:	Svalgprovet tas med en steril bomullsticka från svalgets bakre delar, halsmandlar och andra inflammerade områden. Undvik att röra stickan i tungan, kinderna eller tänderna. Undvik också mycket slem eller blod. Stickan bryts av i ett fabriksrent rör. Använd inte andra provtagningsstickor.
Färdigt resultat:	Inom ca. två timmar efter att provet mottagits vid laboratoriet.
Tolkning:	Ett negativt resultat tyder på något annat än tonsillit orsakad av A-streptokocker eller så kan det bero på att testet är okänsligt för identifiering av små mängder antigen. Snabbtestet kan inte skilja på akut infektion och symptomfritt bärande.

Tilläggsinformation

För mera detaljerad information om undersökningar och tolkningen av resultaten kan ni konsultera den elektroniska laboratoriehandboken.

Förfrågningar

Kundrådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786.

Roosa Jämsén, sjukhusmikrobiolog
Tapio Seiskari, direktör för specialområdet

Tulosta

Pohjanmaa: Nielun streptokokki A -pikatestin näytteenottotikkujen muutos

21.4.2022

Laboratoriotiedote 53/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Nielun streptokokki A -pikatestin (tutkimus 3635 Ps-StrAAg) menetelmämuutoksen myötä myös näytteenottotikut muuttuvat. Jatkossa nielunäytteet otetaan testipakkauksen mukana tulevilla steriileillä pumpulitikuilla. Muut näytteenottotikut eivät sovellu tutkimukseen. Näytteenottotikkuja saa laboratoriosta.

Nielunäytteenoton jälkeen tikku katkaistaan tehdaspuhtaaseen putkeen, ja näyte toimitetaan laboratorioon. Pikadiagnostinen hyöty saadaan vain, jos tutkimus tehdään mahdollisimman nopeasti. Muussa tapauksessa tulee tilata viljelytutkimus (2703 Ps-StrVi), jolla voidaan osoittaa myös muiden streptokokkien aiheuttamat infektiot.

3635 Ps-StrAAg	*Streptococcus pyogenes* (A), antigeeni
Menetelmä:	Kvalitatiivinen immunokromatografinen pikatesti.
Indikaatiot:	Streptococcus pyogeneksen (ryhmä A) aiheuttaman tonsilliitin pikadiagnostiikka.
Näytetiedot:	Nielunäyte kerätään steriilillä pumpulitikulla nielun takaosasta, nielurisoista ja muilta tulehtuneilta alueilta. Vältä koskemasta tikulla kieltä, poskia tai hampaita. Vältä myös liiallista limaa tai verta. Tikku katkaistaan tyhjään tehdaspuhtaaseen putkeen. Älä käytä muita näytteenottotikkuja.
Tulos valmiina:	Noin kahden tunnin sisällä näytteen saapumisesta laboratorioon.
Tulkinta:	Negatiivinen tulos viittaa muuhun kuin A-ryhmän streptokokin aiheuttamaan tonsilliittiin tai se voi johtua myös testin epäherkkyydestä tunnistaa pieniä antigeenimääriä. Pikatesti ei erota akuuttia infektiota sairastavia oireettomista kantajista.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta.

Tiedustelut

Pohjanmaan ammattilaisten asiakaspalvelu p. 041 7314 786

Roosa Jämsén, sairaalamikrobiologi
Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Utförda PCR-undersökningar från likvor under strejken inom vårdbranschen

5.4.2022 • Tiedote päivitetty: 7.4.2022

Laboratoriemeddelande 49/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

På grund av strejken inom vårdbranschen kan en del av Fimlabs undersökningar som analyseras vid andra universitetssjukhuslaboratorier inte produceras eller så är undersökningarnas svarstid avsevärt fördröjd.

Vid misstanke om infektioner i centrala nervsystemet rekommenderas följande undersökningar för nukleinsyrapåvisning från likvor.

Li -HSVNhO, -EVirNhO, Li -MikrNhO

Li -MikrNhO är en multiplex-PCR-undersökning för påvisning av följande mikrober:

Bakterier

Escherichia coliK12
Haemophilus influenzae
Listeria monocytogenes
Neisseria meningitidis (inkapslad)
Streptococcus agalactiae
Streptococcus pneumoniae

Virus

Sytomegalovirus (CMV)
Enterovirus (EV)
Herpes simplex virus 1 (HSV-1)
Herpes simplex virus 2 (HSV-2)
Human herpesvirus 6 (HHV-6)
Human parechovirus (HPeV)
Varicella zoster virus (VZV)

Svampar

Cryptococcus neoformans/gattii

Undersökningen beställs med ATK-beställning (23052). Om en ATK-beställning inte kan göras så ska man använda Fimlabs allmänna remiss. Undersökningen utförs vid Fimlabs laboratorier i Lahtis och Jyväskylä. Underleverantörernas undersökningar för nukleinsyrapåvisning av enskilda patogener (HHV6, VZV) är inte tillgängliga under strejken.

Förfrågningar

Kundrådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786.

Tapio Seiskari, direktör för specialområdet

Tulosta

Likvorista tehtävät PCR-tutkimukset hoitoalan lakon aikana

5.4.2022

Laboratoriotiedote 49/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Hoitoalan lakosta johtuen osaa Fimlabin muista yliopistosairaaloiden laboratorioista alihankkimista tutkimuksista ei pystytä tuottamaan tai tutkimusten valmistumisessa on merkittäviä viiveitä.

Keskushermostoinfektioiden epäilyissä likvorin nukleiinihappotutkimuksista suositellaan käytettävän seuraavia tutkimuksia:

Li -HSVNhO, -EVirNhO, Li -MikrNhO

Li -MikrNhO on multiplex-PCR-tutkimus, joka sisältää seuraavien mikrobien osoituksen:

Bakteerit

Escherichia coliK12
Haemophilus influenzae
Listeria monocytogenes
Neisseria meningitidis (kapselillinen)
Streptococcus agalactiae
Streptococcus pneumoniae

Virukset

Sytomegalovirus (CMV)
Enterovirus (EV)
Herpes simplex virus 1 (HSV-1)
Herpes simplex virus 2 (HSV-2)
Human herpesvirus 6 (HHV-6)
Human parechovirus (HPeV)
Varicella zoster virus (VZV)

Sienet

Cryptococcus neoformans/gattii

Tutkimus tilataan ATK-pyynnöllä (23052). Mikäli ATK-pyyntöä ei voida tehdä, tulee käyttää Fimlabin yleislähetettä. Tutkimusta tehdään Fimlabin Lahden ja Jyväskylän laboratorioissa. Normaalisti alihankintana tuotettavia yksittäisiin taudinaiheuttajiin (HHV6, VZV) kohdennettuja nukleiinihappotutkimuksia ei ole lakon aikana saatavilla.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

COVID-19 -koronavirussjukdom, antikroppar -undersökningens innehåll ändras fr.o.m. 5.4.2022

4.4.2022

Laboratoriemeddelande 48/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

COVID-19 -koronavirussjukdom, antikroppar (6476 S -CV19Ab) -undersökningens innehåll ändras fr.o.m. 5.4.2022. Det sker inga förändringar i beställningen av proven eller i provtagningen. I fortsättningen bestäms både helhetsantikropparna mot nukleokapsid (N) och IgG antikropparna mot spikprotein (S) i alla prov. N-antikropparna berättar om insjuknad SARS-CoV-2 infektion (COVID-19), och S-antikropparna berättar mer om skyddande immunitet som bildats till följd av infektion och/eller vaccination.

Undersökningen 6476 S -CV19Ab svaras fortsättningsvis kvalitativt (POS, POS/NEG eller NEG) baserat på helhetsresultatet av delundersökningarna. Delundersökningarnas resultat berättas kvalitativt i undersökningens utlåtande och kommenteras.

Tilläggsinformation

Janne Aittoniemi, avdelningsöverläkare, janne.aittoniemi[at]fimlab.fi, tel. 03 3117 6012

Se elektroniska laboratoriehandboken för noggrannare information om undersökningen och dess tolkning: fimlab.fi/ohjekirja.

Förfrågningar

Kundrådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786.

Tapio Seiskari, direktör för specialområdet

Tulosta

COVID-19 -koronavirustauti, vasta-aineet -tutkimuksen sisältö muuttuu 5.4.2022 alkaen

4.4.2022

Laboratoriotiedote 48/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

COVID-19 -koronavirustauti, vasta-aineet (6476 S -CV19Ab) -tutkimuksen sisältö muuttuu 5.4.2022 alkaen. Pyyntökäytännössä ja näytteenotossa ei tapahdu muutoksia. Jatkossa kaikista näytteistä määritetään sekä kokonaisvasta-aineet nukleokapsidia (N) että IgG vasta-aineet piikkiproteiinia (S) kohtaan. N-vasta-aineet kertovat sairastetusta SARS-CoV-2 infektiosta (COVID-19), kun taas S-vasta-aineet kertovat enemmän infektion ja/tai rokotuksen seurauksena muodostuneesta suojaavasta immuniteetista.

Päätutkimus 6476 S -CV19Ab vastataan edelleen kvalitatiivisesti (POS, POS/NEG TAI NEG) perustuen osatutkimusten kokonaistulokseen. Osatutkimusten tulokset puolestaan kerrotaan kvalitatiivisesti tutkimuksen lausunto-osiossa ja niitä kommentoidaan.

Lisätiedot

Janne Aittoniemi, osastonylilääkäri, janne.aittoniemi [at] fimlab.fi, p. 03 3117 6012

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta fimlab.fi/ohjekirja.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu ja neuvonta, p. 03 311 77800.

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Keski-Suomi: Tilausmuutos alihankittavassa Polyoomaviruksen, nukleiinihapon tutkimuksessa 25.3.2022 alkaen

28.3.2022

Laboratoriotiedote 44/2022 • Keski-Suomi

Polyoomavirusten nukleiinihapon osoitus

Vanha 25.3.2022 poistunut tutkimus:
6001 P -BKVNh	P -BK-virus, nukeliinihappo (kvant)
Menetelmä	Kvantitatiivinen PCR (polymeraasiketjureaktio).
Viiteväli	Tutkimuksen kvantitatiivinen määritysraja on 22 IU/ml. Positiivisen tuloksen yhteydessä ilmoitetaan BKV-genomien määrä IU per ml plasmaa (IU/ml).

Uusi käyttöön otettu tutkimus:

Tutkimuksen tekopaikka muuttuu Huslab:sta Tykslab:iin. Menetelmän viiteväli ja vastausyksikkö muuttuvat. Samassa määrityksessä voidaan jatkossa osoittaa BK-viruksen lisäksi JC-viruksen nukleiinihappo.

12811 -PoVNh	Polyoomavirus, nukleiinihappo
Näytetiedot	Veri: 2 ml EDTA -plasmaa, joka on eroteltava mahdollisimman nopeasti (viimeistään 4-6 tunnin kuluttua näytteenotosta) Muut näytelaadut (virtsa, likvor, kudos): 2 ml Säilytetään jääkaapissa max.3 vrk, lähetys huoneenlämmössä. Pidempiaikainen säilytys ja lähetys pakastettuna.
Menetelmä	Kvantitatiivinen PCR (polymeraasiketjureaktio)
Tulos valmiina	Noin kahden viikon kuluessa
Tulkinta	Tulos ilmoitetaan kopioiden määränä/ml. BK- tai JCV-DNA:n toteaminen on merkki aktivoituneesta infektiosta ja kopioiden määrä kuvaa infektion aktiivisuutta ja vakavuusastetta.

Lisätiedot

Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta.

Tiedustelut

Ammattilaisten palvelupuhelin 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Tulosta

Päijät-Häme: Fimlab toteuttaa tietoturvapäivityksen keskiviikkona 30.3.2022 klo 18.30-21

24.3.2022 • Tiedote päivitetty: 25.3.2022

Laboratoriotiedote 43/2022 • Päijät-Häme

Fimlab toteuttaa tietoturvapäivityksen keskiviikkona 30.3.2022 klo 18.30-21. Päivityksen vuoksi osassa Fimlabin palveluja on käyttökatkoja. Katkoon on varauduttu huolellisesti, mutta siitä huolimatta katkolla on joitakin vaikutuksia palveluumme. Pahoittelemme katkosta mahdollisesti aiheutuvaa haittaa.

Päijät-Hämeen osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Mikrobiologia -järjestelmässä on käyttökatko keskiviikkona 30.3.2022 klo 18.30-21, jonka vuoksi vastauksissa saattaa olla viivettä.

Katkon aikana positiiviset veriviljelyt soitetaan, mutta tulos tulee viiveellä tietojärjestelmiin.

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Palvelinympäristön tietoturvapäivitys aiheuttaa käyttökatkon My+ Verikeskuksen sanomaliikenteeseen. Pyyntöjen ja vastausten siirtymisessä My+ Verikeskuksen ja WebFimlabin välillä on katko keskiviikkona 30.3.2022 klo 18.30-21.

Pyynnöt ja vastaukset siirtyvät katkon päätyttyä. Katkon aikana valmistuneet veriryhmä- ja sopivuusnäytevastaukset näkyvät vain My+ Verikeskuksessa.

Veritilaukset, lähetyspyynnöt ja verensiirtojen kirjaaminen My+ Verikeskuksessa toimivat normaalisti.

Katkon aikana 30.3.2022 klo 19.30-21 osastoilla My+ Verikeskuksesta tehtävistä sopivuusnäytepyynnöistä pitää soittaa.
– Päijät-Hämeen keskussairaala p. 044 719 5428 (näytteenottaja)

Tiedustelut: Fimlab verikeskus, Satu Rohkimainen, asiantuntijahoitaja, p.050 569 4437

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja, mikrobiologia
Tomi Koski, erikoisalajohtaja, hematologia

Tulosta

Kanta-Häme: Fimlab toteuttaa tietoturvapäivityksen keskiviikkona 30.3.2022 klo 18.30-21

24.3.2022

Laboratoriotiedote 42/2022 • Kanta-Häme

Kanta-Hämeen osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Mikrobiologia -järjestelmässä on käyttökatko keskiviikkona 30.3.2022 klo 18.30-21, mikä vaikuttaa tuona päivänä tehtävään Covid-analytiikkaan sekä veriviljelyihin.

Covid-pyynnöistä tehdään sekä Lifecare-lähete että paperilähete, joka toimitetaan laboratorioon. Covidit vastataan paperilla (lähetetään putkipostilla).

Veriviljelypyynnöistä tehdään Lifecare-lähete.

Tulokset vastataan Lifecareen katkon jälkeen mahdollisimman pian.

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Palvelinympäristön tietoturvapäivitys aiheuttaa käyttökatkon My+ Verikeskuksen sanomaliikenteeseen. Pyynnöt eivät siirry Lifecaresta My+ Verikeskukseen katkon aikana keskiviikkona 30.3.2022 klo 18.30-21.

Pyynnöt ja vastaukset siirtyvät katkon päätyttyä. Katkon aikana valmistuneet veriryhmä- ja sopivuusnäytevastaukset näkyvät vain My+ Verikeskuksessa.

Veritilaukset, lähetyspyynnöt ja verensiirtojen kirjaaminen My+ Verikeskuksessa toimivat normaalisti.

Tiedustelut: Fimlab verikeskus, Satu Rohkimainen, asiantuntijahoitaja, p.050 569 4437

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja, mikrobiologia
Tomi Koski, erikoisalajohtaja, hematologia

Tulosta

Pirkanmaa: Fimlab toteuttaa tietoturvapäivityksen keskiviikkona 30.3.2022 klo 18.30-21

24.3.2022 • Tiedote päivitetty: 25.3.2022

Laboratoriotiedote 41/2022 • Pirkanmaa

Pirkanmaan osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Mikrobiologia -järjestelmässä on käyttökatko keskiviikkona 30.3.2022 klo 18.30-21, mikä vaikuttaa tuona päivänä tehtävään Covid-analytiikkaan.

Käyttökatkon vuoksi Covid-vastauksissa voi olla viivettä keskiviikkona 30.3.2022 Pika-Covidin osalta pyynnöt tehdään normaalisti sähköisenä. Näyte ajetaan ja tulos soitetaan pyytävään yksikköön sen valmistuessa. Huom! Pika-Covid näytteiden mukana tulee lähettää puhelinnumero, johon näytteen tulos soitetaan.

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Pyynnöt ja vastaukset siirtyvät katkon päätyttyä. Katkon aikana valmistuneet veriryhmä- ja sopivuusnäytevastaukset näkyvät vain My+ Verikeskuksessa.

Veritilaukset, lähetyspyynnöt ja verensiirtojen kirjaaminen My+ Verikeskuksessa toimivat normaalisti.

Katkon aikana 30.3.2022 klo 19.30-21 osastoilla My+ Verikeskuksesta tehtävistä kiireellisistä sopivuusnäytepyynnöistä pitää soittaa.
– TAYS kantasairaala p. (03) 311 7551 (verikeskus)

Tiedustelut: Fimlab verikeskus, Satu Rohkimainen, asiantuntijahoitaja, p.050 569 4437

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja, mikrobiologia
Tomi Koski, erikoisalajohtaja, hematologia

Tulosta

Pirkanmaa, Keski-Suomi, Kanta-Häme, Päijät-Häme: Muutos MRSA-näytteenottoputken ulkonäössä – Huomio: Sekaannuksen riski eSwab-putken kanssa

9.3.2022

Laboratoriotiedote 30/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme

Fimlabissa käytössä olevan MRSA-näytteenottoputken (Puritan MRSA) ulkonäkö on muuttunut. Putken sisältö, käyttötapa tai -tarkoitus ei muutu, ainoastaan putken ulkonäkö ja pakkaustapa muuttuu.

Uusi putki on vaaleanpunakorkkinen (aiemmin valkokorkkinen) ja toimitetaan sellaisenaan ilman muovipakkausta (aiemmin muovipakkauksessa). Putken mukana toimitetaan näytteenottotikku.

Uusi putki on ulkonäöltään lähes identtinen toisen mikrobiologisen näytteenottoputken, Copanin eSwab-putken kanssa.

Koska putkien käyttötarkoitus eroaa huomattavasti, pyydämme näytteenottajia olemaan erityisen huolellisia oikean putken valinnassa näytteenoton yhteydessä.

Putkien vertailu

Puritan MRSA medium

Käyttö
- Vain tutkimuksessa STAPHYLOCOCCUS AUREUS, METISILLIINIRESISTENTTI (MRSA), VILJELY (4358, -MRSAVi)
Ulkonäkö ja toimitus
- Toimitetaan ilman muovipakkausta
- Merkinnät: Puritan, MRSA MEDIUM
- Kellertävä kirkas neste (2 ml)

Copan eSwab

Käyttö
- Useissa molekyylibiologisissa ja bakteeriviljelytutkimuksissa, tutkimuskohtaisten ohjeiden mukaan
Ulkonäkö ja toimitus
- Toimitetaan muovipakkauksessa
- Merkinnät: copan, eSwab
- Väritön kirkas neste (1 ml)

Kuvassa vasemmalta oikealle:
– MRSA-viljelyputki (toimitusyksikkö ilman näytteenottotikkua)
– eSwab-putki (purettu toimitusyksikkö ilman näytteenottotikkua)
– eSwab-putki (toimitusyksikkö)

Vanhat, voimassa olevat, valkokorkkiset putket voidaan käyttää loppuun ennen siirtymistä uusiin. Jos vanhojen putkien käyttöaika on ohitettu eikä uusia putkia ole vielä saatavilla, voidaan valkokorkkisia putkia käyttää yhden (1) kuukauden ajan eräpäivän jälkeen edellyttäen, että putken liemi ei ole silminnähden samentunut.

Tiedustelut

Fimlab asiakaspalvelu, p. 03 311 77800

Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja

Varaa aika netissä

Varaa aika puhelimitse

Laboratoriotiedote 85/2022 • Keski-Suomi

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 83/2022 • Päijät-Häme

Muutos koskee tutkimusta 23309 Ps -StrNhO, Streptococcus A, C, G, osoitus (kval.)

Korvaava tutkimus on 2703 Ps -StrVi, Streptococcus, viljely (hemolyytt. streptokokit nielusta)

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 82/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

0141 U- Solut, grundanalys av urinceller

1155 U- BaktVi, urinbakterieodling

Tilläggsuppgifter

Laboratoriotiedote 82/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

0141 U- Solut, virtsan solujen peruserittely

1155 U- BaktVi, virtsan bakteeriviljely

Lisätiedot

Laboratoriotiedote 74/2022 • Päijät-Häme

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 62/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Tilläggsinformation

Laboratoriotiedote 62/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot

Laboratoriemeddelande 53/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Tilläggsinformation

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 53/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 49/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 49/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 48/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Tilläggsinformation

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 48/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 44/2022 • Keski-Suomi

Polyoomavirusten nukleiinihapon osoitus

Uusi käyttöön otettu tutkimus:

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 43/2022 • Päijät-Häme

Päijät-Hämeen osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Laboratoriotiedote 42/2022 • Kanta-Häme

Kanta-Hämeen osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Laboratoriotiedote 41/2022 • Pirkanmaa

Pirkanmaan osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Laboratoriotiedote 30/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme

Putkien vertailu

Puritan MRSA medium

Copan eSwab

Tiedustelut