Mikrobiologia - Page 12 of 19

Utförda PCR-undersökningar från likvor under strejken inom vårdbranschen

5.4.2022 • Tiedote päivitetty: 7.4.2022

Laboratoriemeddelande 49/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

På grund av strejken inom vårdbranschen kan en del av Fimlabs undersökningar som analyseras vid andra universitetssjukhuslaboratorier inte produceras eller så är undersökningarnas svarstid avsevärt fördröjd.

Vid misstanke om infektioner i centrala nervsystemet rekommenderas följande undersökningar för nukleinsyrapåvisning från likvor.

Li -HSVNhO, -EVirNhO, Li -MikrNhO

Li -MikrNhO är en multiplex-PCR-undersökning för påvisning av följande mikrober:

Bakterier

Escherichia coliK12
Haemophilus influenzae
Listeria monocytogenes
Neisseria meningitidis (inkapslad)
Streptococcus agalactiae
Streptococcus pneumoniae

Virus

Sytomegalovirus (CMV)
Enterovirus (EV)
Herpes simplex virus 1 (HSV-1)
Herpes simplex virus 2 (HSV-2)
Human herpesvirus 6 (HHV-6)
Human parechovirus (HPeV)
Varicella zoster virus (VZV)

Svampar

Cryptococcus neoformans/gattii

Undersökningen beställs med ATK-beställning (23052). Om en ATK-beställning inte kan göras så ska man använda Fimlabs allmänna remiss. Undersökningen utförs vid Fimlabs laboratorier i Lahtis och Jyväskylä. Underleverantörernas undersökningar för nukleinsyrapåvisning av enskilda patogener (HHV6, VZV) är inte tillgängliga under strejken.

Förfrågningar

Kundrådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786.

Tapio Seiskari, direktör för specialområdet

Vanha 25.3.2022 poistunut tutkimus:
6001 P -BKVNh	P -BK-virus, nukeliinihappo (kvant)
Menetelmä	Kvantitatiivinen PCR (polymeraasiketjureaktio).
Viiteväli	Tutkimuksen kvantitatiivinen määritysraja on 22 IU/ml. Positiivisen tuloksen yhteydessä ilmoitetaan BKV-genomien määrä IU per ml plasmaa (IU/ml).

12811 -PoVNh	Polyoomavirus, nukleiinihappo
Näytetiedot	Veri: 2 ml EDTA -plasmaa, joka on eroteltava mahdollisimman nopeasti (viimeistään 4-6 tunnin kuluttua näytteenotosta) Muut näytelaadut (virtsa, likvor, kudos): 2 ml Säilytetään jääkaapissa max.3 vrk, lähetys huoneenlämmössä. Pidempiaikainen säilytys ja lähetys pakastettuna.
Menetelmä	Kvantitatiivinen PCR (polymeraasiketjureaktio)
Tulos valmiina	Noin kahden viikon kuluessa
Tulkinta	Tulos ilmoitetaan kopioiden määränä/ml. BK- tai JCV-DNA:n toteaminen on merkki aktivoituneesta infektiosta ja kopioiden määrä kuvaa infektion aktiivisuutta ja vakavuusastetta.

4521 S-PuumAbO	Puumalavirus, IgM-antikroppar (kval)
Metod:	Kvalitativt immunokromatografiskt snabbtest.
Provinformation:	Provtagningskärl: 5 ml serumrör eller 4 ml Li-heparinrör. För provet behövs åtminstone 0,5 ml serum eller plasma.
Färdigt resultat:	Undersökningen görs varje dag under laboratoriets öppethållningstider.
Tolkning:	Ett negativt resultat betyder att det inte finns specifika IgM-antikroppar mot Puumalaviruset i provet och att patienten inte har akut Puumalavirus infektion. Om man fortfarande misstänker akut infektion hos patienten så ska provet tas på nytt om några dagar. Ett positivt resultat betyder att patienten lider av akut sorkfeber. En tidigare infektion orsakar inte positivt resultat.

S-TBEAbM	Fästingburet encefalit virus, IgM-antikroppar (kval)
Metod:	Kvalitativt immunokromatografiskt snabbtest.
Provinformation:	Provtagningskärl: 5 ml serumrör eller 4 ml Li-heparinrör. För provet behövs åtminstone 0,5 ml serum eller plasma.
Färdigt resultat:	Undersökningen görs varje dag under laboratoriets öppethållningstider.
Tolkning:	Ett negativt resultat betyder att det inte finns specifika IgM-antikroppar mot viruset i provet och att patienten inte har akut fästingburen encefalit infektion. Om man fortfarande misstänker akut infektion hos patienten så ska provet tas på nytt om några dagar. Ett positivt resultat betyder att patienten lider av akut fästingburen encefalit infektion. En tidigare infektion orsakar inte positivt resultat.

4521 S-PuumAbO	Puumalavirus, IgM-vasta-aineet (kval)
Menetelmä:	Kvalitatiivinen immunokromatografinen pikatesti.
Näytetiedot:	Näyteastiana 5 ml seerumiputki tai 4 ml Li-hepariiniputki. Näytteeksi tarvitaan vähintään 0,5 ml seerumia tai plasmaa.
Tulos valmiina:	Tutkimusta tehdään joka päivä laboratorion aukioloaikoina.
Tulkinta:	Negatiivinen tulos tarkoittaa, että näytteessä ei ole Puumalavirukselle spesifisiä IgM-vasta-aineita ja potilaalla ei ole akuuttia Puumalavirus-infektiota. Jos akuuttia infektiota epäillään edelleen, tulee ottaa uusi näyte muutaman päivän kuluttua. Positiivinen tulos tarkoittaa, että potilas sairastaa akuuttia myyräkuumetta. Aiemmin sairastettu infektio ei aiheuta positiivista tulosta.

S-TBEAbM	Puutiaisenkefaliittivirus, IgM-vasta-aineet (kval)
Menetelmä:	Kvalitatiivinen immunokromatografinen pikatesti.
Näytetiedot:	Näyteastiana 5 ml seerumiputki tai 4 ml Li-hepariiniputki. Näytteeksi tarvitaan vähintään 0,5 ml seerumia tai plasmaa.
Tulos valmiina:	Tutkimusta tehdään joka päivä laboratorion aukioloaikoina.
Tulkinta:	Negatiivinen tulos tarkoittaa, että näytteessä ei ole Puutiaisenkefaliittivirukselle spesifisiä IgM-vasta-aineita ja potilaalla ei ole akuuttia infektiota. Jos akuuttia infektiota epäillään edelleen, tulee ottaa uusi näyte muutaman päivän kuluttua. Positiivinen tulos tarkoittaa, että potilas sairastaa akuuttia puutiaisenkefaliittiviruksen aiheuttamaa infektiota. Aiemmin sairastettu infektio ei aiheuta positiivista tulosta.

Li-TBEAbM	Puutiaisenkefaliittivirus, IgM-vasta-aineet likvorista
Menetelmä:	Kvalitatiivinen immunokromatografinen pikatesti.
Näytetiedot:	Näyteastiana tehdaspuhdas korkillinen putki ilman säilöntäainetta. Näytteeksi tarvitaan vähintään 0,5 ml likvoria.
Tulos valmiina:	Tutkimusta tehdään joka päivä laboratorion aukioloaikoina.
Tulkinta:	Ks. tulkinta laboratorio-ohjekirjasta.

4075 -HPVNhO	Papillomvirus (HPV), nukleinsyra (kval)
Metod:	PCR-amplifikationsmetod som identifierar 14 högrisk HPV-genotyper, (16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 68). Genotyperna 16 och 18 identifieras skilt från de andra genotyperna.
Provinformation:	Provtagningskärl: Roche Cell Collection Medium. I provtagningsburken håller provet 3 månader I rumstemperatur. I undersökningsmetoden finns en intern kontroll som berättar ifall provet inte innehöll tillräckligt med celler.
Färdigt resultat:	Inom två veckor.
Tolkning:	Undersökningen svaras med ett utlåtande.

1738 -CtNgNhO (tidigare -CtGcNhO)	Chlamydia trachomatis och Neisseria gonorrhoeae, nukleinsyra (kval)
Metod:	Nukleinsyrapåvisning (polymeraskedjereaktion, PCR). Ifall provet innehåller specifika DNA-sekvenser för klamydia och gonorré amplifieras och påvisas dessa med hjälp av specifika DNA-sonder.
Provinformation:	Provtagningskärl: cobas® PCR Media Dual Swab Sample Kit, Roche, 07958021190, IVD. ( För prover från livmoderhalskanalen-, vagina-, ändtarmen och svalget). Förvaring i rumstemperatur.
Färdigt resultat:	Inom 3 vardagar efter att provet anlänt till laboratoriet.
Tolkning:	Resultatet svaras som positivt eller negativt. Ett positivt resultat påvisar infektion.

4816 U -CtNgNhO (tidigare U -CtGcNhO)	Chlamydia trachomatis och Neisseria gonorrhoeae, nukleinsyra (kval), urin
Metod:	Nukleinsyrapåvisning (polymeraskedjereaktion, PCR). Ifall provet innehåller specifika DNA-sekvenser för klamydia och gonorré amplifieras och påvisas dessa med hjälp av specifika DNA-sonder.
Provinformation:	Provtagningskärl: cobas® PCR Urine Sample Kit, Roche, 05170486190, IVD. (För urinprov). Förvaring i rumstemperatur.
Färdigt resultat:	Inom 3 vardagar efter att provet anlänt till laboratoriet.
Tolkning:	Resultatet svaras som positivt eller negativt. Ett positivt resultat påvisar infektion.

1738 -CtNgNhO (aiemmin -CtGcNhO)	Chlamydia trachomatis ja Neisseria gonorrhoeae, nukleiinihappo (kval)
Menetelmä:	Nukleiinihappomonistus (polymeraasiketjureaktio, PCR), jossa näytteen mahdollisesti sisältämä klamydialle ja gonokokille spesifinen DNA-jakso monistetaan ja osoitetaan spesifisellä koettimella.
Näytetiedot:	Näyteastia: cobas® PCR Media Dual Swab Sample Kit, Roche, 07958021190, IVD. (kohdunkaulakanava-, emätin-, peräsuoli- ja nielunäytteet). Säilytys huoneenlämmössä.
Tulos valmiina:	3 arkipäivän kuluessa näytteen saapumisesta laboratorioon.
Tulkinta:	Vastaus ilmoitetaan muodossa negatiivinen/positiivinen. Positiivinen tulos on osoitus infektiosta.

4816 U -CtNgNhO (aiemmin U -CtGcNhO)	Chlamydia trachomatis ja Neisseria gonorrhoeae, nukleiinihappo (kval), virtsa
Menetelmä:	Nukleiinihappomonistus (polymeraasiketjureaktio, PCR), jossa näytteen mahdollisesti sisältämä klamydialle ja gonokokille spesifinen DNA-jakso monistetaan ja osoitetaan spesifisellä koettimella.
Näytetiedot:	Näyteastia: cobas® PCR Urine Sample Kit, Roche, 05170486190, IVD. (virtsanäyte). Säilytys huoneenlämmössä.
Tulos valmiina:	3 arkipäivän kuluessa näytteen saapumisesta laboratorioon.
Tulkinta:	Vastaus ilmoitetaan muodossa negatiivinen/positiivinen. Positiivinen tulos on osoitus infektiosta.

Undersökning	Undre gräns	Övre gräns	Avvikelser
B-Hb	vuxna: 70 g/l barn under 17 år: 70 g/l	vuxna: 200 g/l
B-Leuk	vuxna: 0.5 x10⁹/l barn under 17 år: 1×10⁹/l	vuxna: 200×10⁹/l barn: 50×10⁹/l
B-Tromb	vuxna: 20×10⁹/l barn under 17 år: 20×10⁹/l	vuxna: 1000×10⁹/l
B-Diffi (blastit)	mistanke av akut leukemi
B-Plas-O	positiva resultat		även patient på avdelning
P-APTT			alla som kommer på trombolys
P-INR			alla som kommer på trombolys
fP-Gluk	2.5 mmol/l	30 mmol/l
uS-TSH		40 mU/l	förlossningsavdelningar, om man inte kan analysera provet, begär man P-TSH på babyn.
S -GBMAb, S -Pr3Ab	nya positiva fynd
B-BaktVi, Li-BaktVi	positiva i färgningen/ växer i odlingen		även patient på avdelningen
Pu-BaktVi1	ledgångsvätska som är positiva i färgningen		även patient på avdelningen

Tutkimus	Alaraja	Yläraja	Poikkeus/ huomioitavaa
B-Hb	aikuiset: 70 g/l lapset alle 17v: 70 g/l	aikuiset: 200 g/l
B-Leuk	aikuiset: 0.5 x10⁹/l lapset alle 17v: alle 1×10⁹/l	aikuiset: 200×10⁹/l lapset: 50×10⁹/l
B-Tromb	aikuiset: 20×10⁹/l lapset alle 17v: 20×10⁹/l	aikuiset: 1000×10⁹/l
B-Diffi (blastit)	akuutti leukemia epäily
B-Plas-O	positiiviset löydökset		myös osastoilla olevat
P-APTT			kaikki liuotushoitoon tulevat
P-INR			kaikki liuotushoitoon tulevat
fP-Gluk	2.5 mmol/l	30 mmol/l
uS-TSH		40 mU/l	synnytysosastot, jos näytettä ei voida analysoida, pyydetään vauvasta P-TSH
S -GBMAb, S -Pr3Ab	uudet positiiviset löydökset
B-BaktVi, Li-BaktVi	värjäyspositiiviset/ viljelyssä kasvavat		myös osastoilla olevat
Pu-BaktVi1	värjäyspositiiviset nivelnestenäytteet		myös osastoilla olevat

4075 -HPVNhO	Papilloomavirus (HPV), nukleiinihappo (kval)
Menetelmä:	PCR-monistusmenetelmä, joka tunnistaa 14 korkean riskin HPV-genotyyppiä (16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 68). Genotyypit 16 ja 18 se tunnistaa erilleen muista genotyypeistä
Näytetiedot:	Näyteastia: Roche Cell Collection Medium. Näyte säilyy kuljetuspurkissa huoneenlämmössä 3 kuukautta. Menetelmässä on sisäinen kontrolli, joka kertoo jos näytteessä ei ole ollut riittävästi soluja.
Tulos valmiina:	Kahden viikon kuluessa.
Tulkinta:	Tutkimuksesta vastataan lausunto.

Varaa aika netissä

Varaa aika puhelimitse

Laboratoriemeddelande 49/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 49/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 48/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Tilläggsinformation

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 48/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 44/2022 • Keski-Suomi

Polyoomavirusten nukleiinihapon osoitus

Uusi käyttöön otettu tutkimus:

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 43/2022 • Päijät-Häme

Päijät-Hämeen osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Laboratoriotiedote 42/2022 • Kanta-Häme

Kanta-Hämeen osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Laboratoriotiedote 41/2022 • Pirkanmaa

Pirkanmaan osalta käyttökatko vaikuttaa seuraavasti:

My+ Mikrobiologia -järjestelmä

My+ Verikeskus sanomaliikenne

Laboratoriotiedote 30/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme

Putkien vertailu

Puritan MRSA medium

Copan eSwab

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 21/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Tilläggsinformation

Laboratoriotiedote 21/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot

Laboratoriemeddelande 16/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Tilläggsinformation

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 16/2022 • Pohjanmaa/Österbotten

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriemeddelande 15/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Därtill ringer vi alltid från Hemostas- och trombocytlaboratoriet när det gäller

Förfrågningar

Laboratoriotiedote 15/2022 • Pirkanmaa, Kanta-Häme, Keski-Suomi, Päijät-Häme, Pohjanmaa/Österbotten

Lisäksi Hemostaasi- ja trombosyyttilaboratoriosta soitetaan aina seuraavissa tapauksissa:

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 13/2022 • Päijät-Häme

Päijät-Hämeen osalta käyttökatkot vaikuttavat seuraavasti:

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 12/2022 • Pirkanmaa

Pirkanmaan osalta käyttökatkot vaikuttavat seuraavasti:

Lisätiedot

Tiedustelut

Laboratoriotiedote 11/2022 • Kanta-Häme

Kanta-Hämeen osalta käyttökatkot vaikuttavat seuraavasti:

Lisätiedot

Tiedustelut