30.10.2023

Laboratoriemeddelande 140/2023 • Pohjanmaa/Österbotten

---

Den nya undersökningen 23052 Li-MikrNhO tas i bruk i Vasa fr.o.m. 1.11.2023 och undersökningen är endast beställbar vid Vasa centralsjukhus. Vid sidan om rekommenderar vi alltid att man också ska beställa bakterieodlingsundersökningen från likvor (1154 Li-BaktVi).

Samtidigt tas bakterieantigenundersökningen från likvor (1143 Li-BaktAg) ur bruk.

Den nya undersökningen är en kvalitativ multiplex-PCR-undersökning som påvisar följande meningit/encefalit-orsakande mikrober ur likvorprov:

Bakterier

• Escherichia coli K1
• Haemophilus influenzae
• Listeria monocytogenes
• Neisseria meningitidis (inkapslad)
• Streptococcus agalactiae
• Streptococcus pneumoniae
• Streptococcus pyogenes 
• Mycoplasma pneumoniae 

Virus

• Enterovirus (EV)
• Herpes simplex virus 1 (HSV-1)
• Herpes simplex virus 2 (HSV-2)
• Human herpesvirus 6 (HHV-6)
• Human parechovirus (HPeV)
• Varicella zoster virus (VZV)

Svampar

• Cryptococcus neoformans/gattii

23052 Li-MikrNhO	MIKROBIT, NUKLEIINIHAPPO (KVAL), LIKVORI Mikrober, nukleinsyra (kval), Likvor
Metod:	Kvalitativ nukleinsyrapåvisningsundersökning (RT-PCR)
Indikation:	Differentialdiagnostik av akut meningit/encefalit med mikrobursprung. Utöver denna undersökning rekommenderar vi också att man beställer bakterieodlingsundersökningen från likvor (1154 Li-BaktVi).
Provinformation:	0,5 ml likvor/hjärn-ryggmärgsvätska. Om provmängden är mindre än 0,2 ml är ett negativt analysresultat inte pålitligt.
Färdigt resultat:	Undersökningen utförs under mikrobiologiska laboratoriets öppethållningstider.
Tolkning:	Ett positivt resultat tyder på meningit/encefalit orsakad av mikroben i fråga. Fyndet ska alltid bedömas i förhållande till patientens kliniska bild.   Observera att – metoden inte identifierar andra E. coli stammar än serotyp K1 – metoden identifierar inte N. meningitidis stammar utan kapsel – metoden identifierar inte mikrober som inte hör till testpanelen (t.ex. stafylokocker från främmande objekt) – ett positivt resultat för Streptococcus pneumoniae kan orsaka ett felaktigt negativt resultat för HSV-1. Vid S. pneumoniae positiva prov ska man därför förhålla sig med reservation till negativa HSV-1 svar, och vid behov beställa HSVNhO-undersökningen 4404 Li-HSVNhO.

Tilläggsinformation

För mera detaljerad information om undersökningar och tolkningen av resultaten kan ni konsultera den elektroniska laboratoriehandboken

Förfrågningar

Kundtjänst och rådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786

---

Roosa Jämsén, sjukhusmikrobiolog
Tapio Seiskari, direktör för specialområdet mikrobiologi

30.10.2023

Laboratoriemeddelande 139/2023 • Pohjanmaa/Österbotten

---

Fr.o.m. 1.11.2023 hemförlovas cytomegalovirus nukleinsyraundersökningarna 4359 -CMVNhO och 4777 P -CMVNh, samt antikroppsundersökningen 2727 S -CMVAb till Fimlabs laboratorium i Tammerfors.

På grund av olika undersökningsmetoder kan ändringen orsaka skillnader i kvantitativa resultatnivåer jämfört med tidigare prover.

Parallellundersökningen 27713 P -CMVNh tas i bruk för sådana patienter som också vårdas på ÅUCS, och dessa prover analyseras fortsättningsvis på ÅUCS laboratorium. Observera att om ni önskar att undersökningen analyseras vid ÅUCS, så ska det göras nya beställningar åt patienten med det nya undersökningsnumret och eventuella gamla beställningar ska tas bort.

Fr.o.m. 1.11.2023 är följande undersökningar beställbara:

4359 -CMVNhO	CYTOMEGALOVIRUS, NUKLEIINIHAPPO (KVAL) Cytomegalovirus, nukleinsyra (kval)
Metod:	Kvalitativ undersökning för påvisning av nukleinsyra (PCR)
Indikation:	Vid misstanke av cytomegalovirusinfektion och uppföljning av antiviral behandling, speciellt hos transplantations- och immunsupprimerade patienter.
Provinformation:	BAL-, biopsi/vävnadsprov eller urinprov. Likvor-prov kan analyseras men den provtypen är inte validerad för undersökningen.
Förvaring:	Förvaras och skickas i kylskåpstemperatur.
Tolkning:	Positiv/negativ. Ett positivt resultat tyder på förekomsten av cytomegalovirusets DNA i provet.
4777 P -CMVNh	CYTOMEGALOVIRUS, NUKLEIINIHAPPO (KVANT) Cytomegalovirus, nukleinsyra (kvant)
Metod:	Kvantitativ undersökning för påvisning av nukleinsyra (PCR)
Indikation:	Vid misstanke av cytomegalovirusinfektion och uppföljning av antiviral behandling, speciellt hos transplantations- och immunsupprimerade patienter. Minimimängden plasma som behövs är 0,5 ml.
Provinformation:	Blodprov, 3 ml i EDTA-rör. Undersökningen görs från plasma som ska avskiljas från helblod inom ett dygn.
Förvaring:	Förvaras och skickas i kylskåpstemperatur. Avskild plasma håller sig 6 dygn i kylskåpstemperatur och 12 veckor fryst ≤ -18°C.
Tolkning:	Kvantitativt bestämningsintervall 34,5–10 000 000 IU/ml plasma. Resultatnivån indikerar infektionens svårighetsgrad hos transplantationspatienter.
27713 P -CMVNh	CYTOMEGALOVIRUS, NUKLEIINIHAPPO (KVANT), (RINNAKKAISTUTKIMUS, TYKSLAB) Cytomegalovirus, nukleinsyra (kvant) (Parallellundersökning, ÅUCS lab.)
Metod:	Kvantitativ undersökning för påvisning av nukleinsyra (PCR)
Indikation:	Beställs om patienten också vårdas på ÅUCS. Undersökningen utförs på ÅUCS laboratorium.
Provinformation:	Blodprov 3 ml i EDTA-rör. Plasma bör avskiljas så snabbt som möjligt och senast inom 12 timmar från provtagningen. För undersökningen behövs 1–2 ml plasma.
Förvaring:	Avskilt prov kan tillfälligt förvaras i kylskåpstemperatur (1–3 dygn). Långtidsförvaring fryst. Om provet fryses, bör det också transporteras fryst.
Tolkning:	Påvisning av CMV-DNA tyder på aktiverad infektion och IU/ml beskriver infektionens aktivitet och svårighetsgrad. · <30 IU/ml, negativ, utlåtande: ”Näytteessä ei mitattavaa määrää CMV-DNA:ta.” (I provet finns inte mätbar mängd CMV-DNA). · RAJA-ARVO (gränsvärde), utlåtande: ”Näytteestä osoitettu CMV-DNA:ta määritysherkkyyden alarajalla, tulos raja-arvo.” (I provet påvisades CMV-DNA på analyskänslighetens nedre gräns, resultat gränsvärde.) · Positiva resultat får ett numeriskt värde 30 – 100 000 000 IU/ml, och utlåtande: ”Positiivinen, näytteestä osoitettu CMV-DNA:ta.” (Positiv, i provet påvisades CMV-DNA.)
2727 S -CMVAb	CYTOMEGALOVIRUS, VASTA-AINEET Cytomegalovirus, antikroppar
Metod:	Enzymimmunologisk bestämning av IgG- och IgM-klassens antikroppar. Uppskattning av tidpunkten för primärinfektion genom aviditetsbestämning av IgG-klassens antikroppar i prov där både IgG- och IgM-klassens antikroppar är positiva.
Provinformation:	1 ml serum.
Tolkning:	IgG-klassens antikroppar svaras med kvantitativa resultat (ALLE 12 mg/l=negativ; ≥12 U/ml = positiv). IgM-klassens antikroppar svaras med kvalitativa resultat (pos, pos/neg, neg). För primärinfektions diagnostik är oftast ett enstaka prov tillräckligt, eftersom analysen mäter både IgG- och IgM-klassens antikroppar. Då tyder positivt IgM-resultat på aktuell/nylig primärinfektion. Om både IgG- och IgM-klassens antikroppar är positiva så görs ännu en IgG-aviditetsundersökning för utredning av tidpunkten för primärinfektion. Aviditetsresultatet skrivs i svaret och får ett utlåtande.

Tilläggsinformation

För mera detaljerad information om undersökningar och tolkningen av resultaten kan ni konsultera den elektroniska laboratoriehandboken.

Förfrågningar

Kundtjänst och rådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786

---

Roosa Jämsén, sjukhusmikrobiolog
Tapio Seiskari, direktör för specialområdet mikrobiologi

12.10.2023

Laboratoriemeddelande 124/2023 • Pohjanmaa/Österbotten

---

1154 Li-BaktVi undersökningens provkärl ändrar fr.o.m. 16.10.2023:

• För bakterieodlingen tas en droppe likvor i ett rumsvarmt skruvkorksförsett FAB- eller tioglykolatrör.
• För färgningen tas några droppar likvor i ett fabriksrent/sterilt provrör.

I fortsättningen sätter beställaren/provtagaren inte likvor på odlingsskålar eller objektglas.

Proverna levereras till laboratoriet omedelbart. Proverna får inte kylas under rumstemperatur.

Provkärl fås från materialutdelningen på B3.

Tilläggsinformation

För noggrannare information om undersökningen och tolkningen av resultaten kan ni konsultera den elektroniska laboratoriehandboken fimlab.fi/ohjekirja.

Förfrågningar

Kundtjänst och rådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786

---

Tapio Seiskari, direktör för specialområdet mikrobiologi

10.10.2023

Laboratoriemeddelande 121/2023 • Pohjanmaa/Österbotten

---

23458 F -BaktNhO    Påvisande av nukleinsyra och subkultivering av bakterier i avföringen

Den nya undersökningen 23458 F -BaktNhO har tagits i bruk 10.10.2023. Undersökningen ersätter de undersökningar som tidigare använts: F -BaktVi1, F -EHEC samt i Birkaland och Egentliga Tavastland även undersökningen F -CldTNhO.

Samtidigt avslutades undersökningarna F -ShigVi, F -CampVi och F -YersVi, samt F -BaktVi2, 13904 F -BaktNhO och 8624 F -CldiVTx undersökningarna som använts i Österbotten.

Obs. Provkärlet för en F -BaktNhO-undersökning är FecalSwab (inkluderar ett transportrör och en provtagningssticka).

Förutom de bakterier som listats under påvisandet av nukleinsyra och bakterier märkta med en stjärna (*), innehåller F -BaktNhO-undersökningen som ska tas i bruk dessutom en subkultivering för en noggrannare artbestämning.

Shigella (spp)*
Campylobacter (spp)*
Yersinia enterocolitica *
Vibrio (spp) *
Aeromonas spp
Salmonella (spp) *
C. difficile toxin B
hypervirulenten C. difficile
enterohemorragisk E. coli (EHEC)
enteropatogen  E.coli (EPEC)
enterotoxigen E.coli (ETEC)
enteroaggregativ E.coli (EAEC)

Med den nya metoden får kunderna resultaten snabbare än tidigare. Dessutom identifierar metoden mikrober som man inte kunnat påvisa med tidigare metoder.

Obs. Prover som har tagits före 10.10.2023 med ”gamla” begäran kommer att fortfarande analyseras som tidigare och provtagningstillbehör överensstämmer således också med tidigare praxis.

23458 F -BaktNhO	Bakteerit, nukleiinihappo (kval), uloste Bakterier, nukleinsyra (kval), avföring
Metod:	Ett multiplex test i realtid för påvisande av nukleinsyra, eventuell bakterieodling och känslighetstester.
Provuppgifter:	En liten mängd avföring som tagits i Fecal Swab-provröret. Vätskan klarar sig i kylskåpstemperatur i cirka två dygn, vid längre förvaring ska den vara djupfryst. Skickas med kyltransport.
Resultatet färdigt:	F -BaktNhO: Första vardagen efter att provet anlänt.   F -BaktJVi (subkultiveras positiv): inom ungefär en vecka.
Tolkning:	Positiva fynd besvaras med bakteriens namn och ett utlåtande.

Provet tas från diarré genom att doppa bomullsstickan i avföringen eller från lite fastare avföring genom att snurra runt max 1 cm av bomullsstickan i avföringen. Snurra bomullsstickan i Fecal swab-röret så att avföringen på bomullsstickan löser sig i röret. Obs! För mycket avföring får inte sättas i röret. Färgen på lösningen i röret borde ändras till ljusbrunt men vid vattendiarré kan färgen lämna ljus. Se bilden. Bomullsstickan lämnas inte i röret. Stäng röret ordentligt.

För noggrannare information se anvisningen: Ulosteen bakteerien nukleiinihaponosoitus (F-BaktNhO), näytteenotto-ohje.

Bild 1. Lämplig provmängd
1: Lämplig provmängd: endast vattendiarré (annars är provet inte tillräckligt)
2-3: Lämplig provmängd: fast/lös/diarré avföring
4-5: För stor provmängd
Observera! En lämplig mängd prov ökar praktiskt taget inte den ursprungliga vätskevolymen i provröret.

Anvisningar för beställning av FecalSwab-rör för Fimlabs egna enheter:

• FecalSwab-röret beställs via OneClinic-beställningssystemet och produkten finns i utbudet i lagren med följande uppgifter:
  • Produktkod: T:197438Tillverkarens produktnummer 470CE
  • Produktens namn: KULJETUSPUTKI FECAL SWAB +NUKKATIKKU
    (TRANSPORTRÖR FECAL SWAB + PROVTAGNINGSSTICKA)

3584 F -BaktVi3      Bakterie, odling 3, från avföring

F -BaktVi3 finns även i fortsättningen kvar som en undersökning som kan beställas vid utredningen av matförgiftningar och epidemier. Undersökningens innehåll utvidgas till att i fortsättningen även omfatta en kall anrikning av Yersinia. På detta sätt försöker man effektivera konstaterandet av Yersinia-fall. I undersökningen rapporteras även Bacillus cereus, Clostridium perfringens och Staphylococcus aureus som orsakar matförgiftningar.

2608 F -SalmVi       Salmonella, odling, från avföring

F -SalmVi kan fortfarande användas som screeningundersökning för att konstatera asymtomatiska bärare av salmonella bland livsmedelsarbetare.

För mer information om hur du beställer produkten kontakta osto[at]fimlab.fi

Tilläggsinformation

Se den elektroniska laboratoriehandboken för noggrannare information om undersökningar och tolkning: fimlab.fi/ohjekirja.         

Förfrågningar

Kundtjänst och rådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786

---

Tapio Seiskari, direktör för specialområdet mikrobiologi

20.9.2023 • Tiedote päivitetty: 22.9.2023

Laboratoriemeddelande 108/2023 • Pohjanmaa/Österbotten

---

23458 F -BaktNhO    Påvisande av nukleinsyra och subkultivering av bakterier i avföringen

Den nya undersökningen 23458 F -BaktNhO tas i bruk 10.10.2023. Undersökningen ersätter de undersökningar som tidigare använts: F -BaktVi1, F -EHEC samt i Birkaland även undersökningen F -CldTNhO.

Samtidigt avslutas undersökningarna F -ShigVi, F -CampVi och F -YersVi, samt undersökningarna F -BaktVi2, 13904 F -BaktNhO och 8624 F -CldiVTx som använts i Österbotten.

Obs. Provkärlet för en F -BaktNhO-undersökning är FecalSwab (inkluderar ett transportrör och en provtagningssticka).

Förutom de bakterier som listats under påvisandet av nukleinsyra och bakterier märkta med en stjärna (*), innehåller F -BaktNhO-undersökningen som ska tas i bruk dessutom en subkultivering för en noggrannare artbestämning.

Shigella (spp)*
Campylobacter (spp)*
Yersinia enterocolitica*
Vibrio (spp)*
Aeromonas spp
Salmonella (spp)*
C. difficile toxin B
hypervirulenten C. difficile
enterohemorragisk E. coli (EHEC)
enteropatogen  E.coli (EPEC)
enterotoxigen E.coli (ETEC)
enteroaggregativ E.coli (EAEC)

Med metoden som ska tas i bruk får kunderna resultaten snabbare än tidigare. Dessutom identifierar metoden mikrober som man inte kunnat påvisa med tidigare metoder.

23458 F -BaktNhO	Bakteerit, nukleiinihappo (kval), uloste Bakterier, nukleinsyra (kval), avföring
Metod:	Ett multiplex test i realtid för påvisande av nukleinsyra, eventuell bakterieodling och känslighetstester.
Provuppgifter:	En liten mängd avföring som tagits i Fecal Swab-provröret. Vätskan klarar sig i kylskåpstemperatur i cirka två dygn, vid längre förvaring ska den vara djupfryst. Skickas med kyltransport.
Resultatet färdigt:	F -BaktNhO: Första vardagen efter att provet anlänt.   F -BaktJVi (subkultiveras positiv): inom ungefär en vecka.
Tolkning:	Positiva fynd besvaras med bakteriens namn och ett utlåtande.

Vid provtagningen är det viktigt att se till att man inte sätter för mycket avföring i provröret. Noggrannare anvisningar sätts i provtagningsinstruktionerna i laboratoriehandboken.

Anvisningar för beställning av FecalSwab-rör för Fimlabs egna enheter:

• FecalSwab-röret beställs via OneClinic-beställningssystemet och produkten finns i utbudet i lagren med följande uppgifter:
  • Produktkod: T:197438Tillverkarens produktnummer 470CE
  • Produktens namn: KULJETUSPUTKI FECAL SWAB +NUKKATIKKU
    (TRANSPORTRÖR FECAL SWAB + PROVTAGNINGSSTICKA)

3584 F -BaktVi3      Bakterie, odling 3, från avföring

F -BaktVi3 finns även i fortsättningen kvar som en undersökning som kan beställas vid utredningen av matförgiftningar och epidemier. Undersökningens innehåll utvidgas till att i fortsättningen även omfatta en kall anrikning av Yersinia. På detta sätt försöker man effektivera konstaterandet av Yersinia-fall. I undersökningen rapporteras även Bacillus cereus, Clostridium perfringens och Staphylococcus aureus som orsakar matförgiftningar.

2608 F -SalmVi       Salmonella, odling, från avföring

F -SalmVi kan fortfarande användas som screeningundersökning för att konstatera asymtomatiska bärare av salmonella bland livsmedelsarbetare.

För mer information om hur du beställer produkten kontakta osto[at]fimlab.fi

Tilläggsinformation

Se den elektroniska laboratoriehandboken för noggrannare information om undersökningar och tolkning: fimlab.fi/ohjekirja.    

Förfrågningar

Kundtjänst och rådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786

---

Tapio Seiskari, direktör för specialområdet mikrobiologi

19.9.2023

Laboratoriemeddelande 107/2023 • Pohjanmaa/Österbotten

---

Den nya undersökningen 56466 -CoInRSV tas i bruk i Vasa fr.o.m. 20.9.2023. Inledningsvis är undersökningen endast beställbar vid Vasa centralsjukhus och proverna analyseras också under dejourstid.

Undersökningen är en kvalitativ multiplex-PCR-undersökning som påvisar SARS-CoV-2, influensa A, influensa B och RSV ur nässvalgprov.

56466 -CoInRSV	SARS-CoV-2, INFLUENSSA A, INFLUENSSA B ja RSV, NUKLEIINIHAPPO (kval) SARS-CoV-2, Influensa A, Influensa B och RSV, nukleinsyra (kval)
Metod:	Kvalitativ nukleinsyrapåvisningsundersökning (RT-PCR)
Provinformation:	Provet tas från nässvalget eller näsborrarna med en flockad pinne. Provrör: COPAN UTM-RT MINI -transportrör 3ml (353C) eller Copan ESwab-transportrör (482CE eller 490CE). Provröret packas dessutom i ett 50 ml Falcon-rör eller en minigrip-påse. Provet håller i rumstemperatur max. 4 t, och i kylskåpstemperatur max. 3 dygn.
Färdigt resultat:	Samma dag.
Tolkning:	Påvisning av SARS-CoV-2-, A-influensa-, B-influensa- och RS-virusens nukleinsyror tyder på infektion orsakad av viruset i fråga.

Tilläggsinformation

För noggrannare information om undersökningen och tolkningen av resultaten kan ni konsultera den elektroniska laboratoriehandboken fimlab.fi/ohjekirja.     

Förfrågningar         

Kundtjänst och rådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786

---

Tapio Seiskari, direktör för specialområdet mikrobiologi