14.11.2023

Laboratoriemeddelande 150/2023 • Pohjanmaa/Österbotten

---

Inledningen av SARS-CoV-2 epidemiperioden och influensaperioden som snart startar har snabbt ökat antalet testningar för dessa virus. För en optimal användning av testreagenser och provkärl och för att de ska räcka till, finns nedan anvisningar om rekommenderade undersökningar och deras primära provkärl i den nuvarande epidemisituationen.

6466 -CV19NhO, Cobas PCR media-rör: primär undersökning vid misstanke om infektion orsakad av SARS-CoV-2 virus. Avdelningsepidemier och andra sjukdomskluster där prover tas av flera personer (resultatet fås vanligtvis under samma eller följande dag).

26466 -NCovNhO, eSwab-rör: den här undersökningen är främst avsedd för patienter inom den specialiserade sjukvården på universitets- eller centralsjukhus i situationer där man behöver information om en eventuell infektion särskilt snabbt (resultatet fås vanligtvis under samma dag; undersökningen är inte tillgänglig i Österbotten fr.o.m. 16.11).  

56466 -CoInRSV, eSwab-rör: den här undersökningen är främst avsedd för patienter inom den specialiserade sjukvården i situationer där det finns en misstake om en infektion orsakad av SARS-CoV-2-, influensa- eller RSV-virus (resultatet fås vanligtvis under samma eller följande dag).

Tilläggsinformation

För noggrannare information om undersökningen och tolkningen av resultaten kan ni konsultera den elektroniska laboratoriehandboken fimlab.fi/ohjekirja.

Förfrågningar

Kundtjänst och rådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786.

---

Tapio Seiskari, direktör för specialområdet mikrobiologi

13.11.2023

Laboratoriemeddelande 149/2023 • Pohjanmaa/Österbotten

---

Undersökningarna 26466 -NCovNhO, 6193-InABNhO och 6198 -RSVNhO avslutas vid Vasa och Jakobstads verksamhetsställen fr.o.m. 16.11.2023. Undersökningarna ersätts med kombinationsundersökningen 56466 -CoInRSV (SARS-CoV-2, Influensa A, Influensa B och RSV, nukleinsyra (Kval)). Undersökningen är en kvalitativ multiplex-PCR-undersökning som påvisar SARS-CoV-2, influensa A, influensa B och RSV ur nässvalgprov.

Vid Vasa centralsjukhus analyseras 56466 -CoInRSV också under dejourstid.

I fortsättningen analyseras undersökningen 23077 -RMikNhO (respiratoriska mikrober, nukleinsyra (kval)) endast under mikrobiologilaboratoriets öppethållningstider.

56466 -CoInRSV	SARS-CoV-2, INFLUENSSA A, INFLUENSSA B ja RSV, NUKLEIINIHAPPO (kval) SARS-CoV-2, Influensa A, Influensa B och RSV, nukleinsyra (kval)
Metod:	Kvalitativ nukleinsyrapåvisningsundersökning (RT-PCR)
Provinformation:	Provet tas från nässvalget eller näsborrarna med en flockad pinne. Provrör: COPAN UTM-RT MINI -transportrör 3 ml (353C). Provröret packas dessutom i ett 50 ml Falcon-rör eller en minigrip-påse. Provet håller i rumstemperatur max. 4 t, och i kylskåpstemperatur max. 3 dygn. Konsultera laboratoriehandboken för noggrannare instruktioner.
Färdigt resultat:	Samma eller senast följande dag.
Tolkning:	Påvisning av SARS-CoV-2-, influensa A-, influensa B- och RS-virusens nukleinsyror tyder på infektion orsakad av viruset i fråga.

Tilläggsinformation

För noggrannare information om undersökningen och tolkningen av resultaten kan ni konsultera den elektroniska laboratoriehandboken fimlab.fi/ohjekirja.

Förfrågningar

Kundtjänst och rådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786

---

Roosa Jämsén, sjukhusmikrobiolog
Tapio Seiskari, direktör för specialområdet mikrobiologi

30.10.2023

Laboratoriemeddelande 140/2023 • Pohjanmaa/Österbotten

---

Den nya undersökningen 23052 Li-MikrNhO tas i bruk i Vasa fr.o.m. 1.11.2023 och undersökningen är endast beställbar vid Vasa centralsjukhus. Vid sidan om rekommenderar vi alltid att man också ska beställa bakterieodlingsundersökningen från likvor (1154 Li-BaktVi).

Samtidigt tas bakterieantigenundersökningen från likvor (1143 Li-BaktAg) ur bruk.

Den nya undersökningen är en kvalitativ multiplex-PCR-undersökning som påvisar följande meningit/encefalit-orsakande mikrober ur likvorprov:

Bakterier

• Escherichia coli K1
• Haemophilus influenzae
• Listeria monocytogenes
• Neisseria meningitidis (inkapslad)
• Streptococcus agalactiae
• Streptococcus pneumoniae
• Streptococcus pyogenes 
• Mycoplasma pneumoniae 

Virus

• Enterovirus (EV)
• Herpes simplex virus 1 (HSV-1)
• Herpes simplex virus 2 (HSV-2)
• Human herpesvirus 6 (HHV-6)
• Human parechovirus (HPeV)
• Varicella zoster virus (VZV)

Svampar

• Cryptococcus neoformans/gattii

23052 Li-MikrNhO	MIKROBIT, NUKLEIINIHAPPO (KVAL), LIKVORI Mikrober, nukleinsyra (kval), Likvor
Metod:	Kvalitativ nukleinsyrapåvisningsundersökning (RT-PCR)
Indikation:	Differentialdiagnostik av akut meningit/encefalit med mikrobursprung. Utöver denna undersökning rekommenderar vi också att man beställer bakterieodlingsundersökningen från likvor (1154 Li-BaktVi).
Provinformation:	0,5 ml likvor/hjärn-ryggmärgsvätska. Om provmängden är mindre än 0,2 ml är ett negativt analysresultat inte pålitligt.
Färdigt resultat:	Undersökningen utförs under mikrobiologiska laboratoriets öppethållningstider.
Tolkning:	Ett positivt resultat tyder på meningit/encefalit orsakad av mikroben i fråga. Fyndet ska alltid bedömas i förhållande till patientens kliniska bild.   Observera att – metoden inte identifierar andra E. coli stammar än serotyp K1 – metoden identifierar inte N. meningitidis stammar utan kapsel – metoden identifierar inte mikrober som inte hör till testpanelen (t.ex. stafylokocker från främmande objekt) – ett positivt resultat för Streptococcus pneumoniae kan orsaka ett felaktigt negativt resultat för HSV-1. Vid S. pneumoniae positiva prov ska man därför förhålla sig med reservation till negativa HSV-1 svar, och vid behov beställa HSVNhO-undersökningen 4404 Li-HSVNhO.

Tilläggsinformation

För mera detaljerad information om undersökningar och tolkningen av resultaten kan ni konsultera den elektroniska laboratoriehandboken

Förfrågningar

Kundtjänst och rådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786

---

Roosa Jämsén, sjukhusmikrobiolog
Tapio Seiskari, direktör för specialområdet mikrobiologi

30.10.2023

Laboratoriemeddelande 139/2023 • Pohjanmaa/Österbotten

---

Fr.o.m. 1.11.2023 hemförlovas cytomegalovirus nukleinsyraundersökningarna 4359 -CMVNhO och 4777 P -CMVNh, samt antikroppsundersökningen 2727 S -CMVAb till Fimlabs laboratorium i Tammerfors.

På grund av olika undersökningsmetoder kan ändringen orsaka skillnader i kvantitativa resultatnivåer jämfört med tidigare prover.

Parallellundersökningen 27713 P -CMVNh tas i bruk för sådana patienter som också vårdas på ÅUCS, och dessa prover analyseras fortsättningsvis på ÅUCS laboratorium. Observera att om ni önskar att undersökningen analyseras vid ÅUCS, så ska det göras nya beställningar åt patienten med det nya undersökningsnumret och eventuella gamla beställningar ska tas bort.

Fr.o.m. 1.11.2023 är följande undersökningar beställbara:

4359 -CMVNhO	CYTOMEGALOVIRUS, NUKLEIINIHAPPO (KVAL) Cytomegalovirus, nukleinsyra (kval)
Metod:	Kvalitativ undersökning för påvisning av nukleinsyra (PCR)
Indikation:	Vid misstanke av cytomegalovirusinfektion och uppföljning av antiviral behandling, speciellt hos transplantations- och immunsupprimerade patienter.
Provinformation:	BAL-, biopsi/vävnadsprov eller urinprov. Likvor-prov kan analyseras men den provtypen är inte validerad för undersökningen.
Förvaring:	Förvaras och skickas i kylskåpstemperatur.
Tolkning:	Positiv/negativ. Ett positivt resultat tyder på förekomsten av cytomegalovirusets DNA i provet.
4777 P -CMVNh	CYTOMEGALOVIRUS, NUKLEIINIHAPPO (KVANT) Cytomegalovirus, nukleinsyra (kvant)
Metod:	Kvantitativ undersökning för påvisning av nukleinsyra (PCR)
Indikation:	Vid misstanke av cytomegalovirusinfektion och uppföljning av antiviral behandling, speciellt hos transplantations- och immunsupprimerade patienter. Minimimängden plasma som behövs är 0,5 ml.
Provinformation:	Blodprov, 3 ml i EDTA-rör. Undersökningen görs från plasma som ska avskiljas från helblod inom ett dygn.
Förvaring:	Förvaras och skickas i kylskåpstemperatur. Avskild plasma håller sig 6 dygn i kylskåpstemperatur och 12 veckor fryst ≤ -18°C.
Tolkning:	Kvantitativt bestämningsintervall 34,5–10 000 000 IU/ml plasma. Resultatnivån indikerar infektionens svårighetsgrad hos transplantationspatienter.
27713 P -CMVNh	CYTOMEGALOVIRUS, NUKLEIINIHAPPO (KVANT), (RINNAKKAISTUTKIMUS, TYKSLAB) Cytomegalovirus, nukleinsyra (kvant) (Parallellundersökning, ÅUCS lab.)
Metod:	Kvantitativ undersökning för påvisning av nukleinsyra (PCR)
Indikation:	Beställs om patienten också vårdas på ÅUCS. Undersökningen utförs på ÅUCS laboratorium.
Provinformation:	Blodprov 3 ml i EDTA-rör. Plasma bör avskiljas så snabbt som möjligt och senast inom 12 timmar från provtagningen. För undersökningen behövs 1–2 ml plasma.
Förvaring:	Avskilt prov kan tillfälligt förvaras i kylskåpstemperatur (1–3 dygn). Långtidsförvaring fryst. Om provet fryses, bör det också transporteras fryst.
Tolkning:	Påvisning av CMV-DNA tyder på aktiverad infektion och IU/ml beskriver infektionens aktivitet och svårighetsgrad. · <30 IU/ml, negativ, utlåtande: ”Näytteessä ei mitattavaa määrää CMV-DNA:ta.” (I provet finns inte mätbar mängd CMV-DNA). · RAJA-ARVO (gränsvärde), utlåtande: ”Näytteestä osoitettu CMV-DNA:ta määritysherkkyyden alarajalla, tulos raja-arvo.” (I provet påvisades CMV-DNA på analyskänslighetens nedre gräns, resultat gränsvärde.) · Positiva resultat får ett numeriskt värde 30 – 100 000 000 IU/ml, och utlåtande: ”Positiivinen, näytteestä osoitettu CMV-DNA:ta.” (Positiv, i provet påvisades CMV-DNA.)
2727 S -CMVAb	CYTOMEGALOVIRUS, VASTA-AINEET Cytomegalovirus, antikroppar
Metod:	Enzymimmunologisk bestämning av IgG- och IgM-klassens antikroppar. Uppskattning av tidpunkten för primärinfektion genom aviditetsbestämning av IgG-klassens antikroppar i prov där både IgG- och IgM-klassens antikroppar är positiva.
Provinformation:	1 ml serum.
Tolkning:	IgG-klassens antikroppar svaras med kvantitativa resultat (ALLE 12 mg/l=negativ; ≥12 U/ml = positiv). IgM-klassens antikroppar svaras med kvalitativa resultat (pos, pos/neg, neg). För primärinfektions diagnostik är oftast ett enstaka prov tillräckligt, eftersom analysen mäter både IgG- och IgM-klassens antikroppar. Då tyder positivt IgM-resultat på aktuell/nylig primärinfektion. Om både IgG- och IgM-klassens antikroppar är positiva så görs ännu en IgG-aviditetsundersökning för utredning av tidpunkten för primärinfektion. Aviditetsresultatet skrivs i svaret och får ett utlåtande.

Tilläggsinformation

För mera detaljerad information om undersökningar och tolkningen av resultaten kan ni konsultera den elektroniska laboratoriehandboken.

Förfrågningar

Kundtjänst och rådgivning för professionella i Österbotten, tel. 041 7314 786

---

Roosa Jämsén, sjukhusmikrobiolog
Tapio Seiskari, direktör för specialområdet mikrobiologi