Pohjanmaa: Uusi PCR-tutkimus ulostepatogeenien osoittamiseen otetaan käyttöön Vaasassa 12.5.2022 alkaen
Laboratoriotiedote 62/2022 • Pohjanmaa/Österbotten
Uusi tutkimus 23349 F-MikrNhO otetaan käyttöön Vaasan toimipisteessä 12.5.2022 alkaen. Tutkimus on aluksi tilattavissa vain Vaasan keskussairaalassa ja sitä on suositeltavaa käyttää ainoastaan kiireistä selvittelyä vaativissa tapauksissa. Tutkimus on kvalitatiivinen multiplex-PCR-tutkimus, jolla voidaan osoittaa ulostenäytteestä seuraavia suolistoinfektiota aiheuttavia viruksia, bakteereita ja parasiitteja:
- Parasiitit (ParaNho): Entamoeba histolytica, Cryptosporidium spp., Giardia lamblia, Cyclospora cayetanensis
- Bakteerit (BaktNhO): Vibrio vulnificus, V. parahaemolyticus, V. cholerae, Campylobacter spp. (sis. C. jejuni, C. upsaliensis, C. coli), Salmonella spp., Clostridioides difficile (tcdA/tcdB), Yersinia enterocolitica, enterotoksigeeninen Escherichia coli (ETEC), enteropatogeeninen E. coli (EPEC), enteroaggregatiivinen E. coli (EAEC), Shigan kaltaista toksiinia tuottava E. coli (STEC [enterohemorraginen E. coli]), Shiga-toksiinia tuottava E. coli (STEC) -serotyyppi O157:H7, enteroinvasiivinen E. coli (EIEC)/Shigella, Plesiomonas shigelloides
- Virukset (VirusNhO): Ihmisen adenovirus F40/F41, Norovirus GI, Norovirus GII, Rotavirus A, Astrovirus, Sapovirus GI, GII, GIV ja GV.
23349 F-MikrNhO | F-Mikrobit, nukleiinihappo (kval) |
Menetelmä: | Kvalitatiivinen nukleiinihaponosoitustutkimus (RT-PCR) |
Indikaatiot: | Kiireistä selvittelyä edellyttävä suolistoinfektioepäily erityisesti matkailijoilla ja pakolaisilla, myös epäselvien suolisto-oireiden laaja-alainen etiologinen selvittely. |
Näytetiedot: | Ulostetta ulostenäytepurkissa, erityisesti verinen tai limainen uloste. Näytepurkki pakataan suljettavaan muovipussiin. Näyte tulee toimittaa laboratorioon mahdollisimman pian näytteenoton jälkeen, koska monet ulostepatogeenit kuolevat pitkään säilytettäessä. Näyte säilytetään tarvittaessa jääkaapissa ja toimitetaan laboratorioon kylmäkuljetuksena. |
Tulos valmiina: | Tutkimusta tehdään mikrobiologian laboratorion aukioloaikoina. |
Tulkinta: | Positiivinen tulos viittaa ko. ulostepatogeenin aiheuttamaan infektioon. Tietyt positiiviset bakteerilöydökset (Yersinia enterocolitica, Salmonella spp., Campylobacter spp. ja EHEC/STEC-löydökset) vastataan ensin alustavana ja varmistetaan viljelemällä. |
Lisätiedot
Tarkemmat tiedot tutkimuksista ja niiden tulkinnasta pyydetään tarkistamaan sähköisestä ohjekirjasta: http://www.vshp.fi/medserv/klkemi/search.asp
Roosa Jämsén, sairaalamikrobiologi
Tapio Seiskari, erikoisalajohtaja